More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2700 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 138 aa  271  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  80.88 
 
 		 143 aa  223  7e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  66.91 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  68.7 
 
 		 141 aa  181  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  67.48 
 
 		 145 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  58.09 
 
 		 147 aa  157  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  58.96 
 
 		 139 aa  155  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  44.85 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  40.38 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1089  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2097  NUDIX hydrolase  38.35 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0651329  normal  0.043835 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  37.19 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0824  NUDIX hydrolase  48.45 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.612559  hitchhiker  0.000224465 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  41.3 
 
 		 236 aa  70.5  0.000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  39.36 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  38.52 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  36.07 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  38.69 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 		 146 aa  67  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  30.72 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  35.24 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  34.06 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  36.7 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  36.52 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  32.12 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  33.33 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  33.98 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  37.39 
 
 		 149 aa  62  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  35 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1319  NUDIX hydrolase  27.74 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  41.88 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  36.64 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0716  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  35.77 
 
 		 473 aa  60.8  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  35.56 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  41.18 
 
 		 146 aa  60.1  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11185  mutator protein mutT  40.19 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0122522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  35.51 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  32.97 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  38.61 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  35.51 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  35.51 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  34.06 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  50.82 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  38.83 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2719  mutT/nudix family protein  30 
 
 		 147 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00471958  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  33.61 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5226  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2705  mutT/nudix family protein  31.82 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  34.9 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  46.55 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  36.67 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  52.54 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2605  mutT/nudix family protein  30.91 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000292929 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4889  hypothetical protein  33.83 
 
 		 337 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  34.48 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  35.07 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  26.72 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000652481  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 187 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2429  MutT/Nudix family protein  29.23 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  43 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>