128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0190 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0190  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  805    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.613594  normal  0.386647 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0148  extracellular ligand-binding receptor  85.26 
 
 		 403 aa  641    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0322  extracellular ligand-binding receptor  75.57 
 
 		 400 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.809903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0183  hypothetical protein  77.19 
 
 		 415 aa  569  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0422  extracellular ligand-binding receptor  72.63 
 
 		 399 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0398  extracellular ligand-binding receptor  72.18 
 
 		 399 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0327  extracellular ligand-binding receptor  71.6 
 
 		 399 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19118  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0404  extracellular ligand-binding receptor  49.07 
 
 		 403 aa  327  3e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.706576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0437  extracellular ligand-binding receptor  49.45 
 
 		 401 aa  318  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0602967  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0026  Extracellular ligand-binding receptor  53.94 
 
 		 398 aa  318  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3284  extracellular ligand-binding receptor  50.29 
 
 		 425 aa  309  5e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0291  Extracellular ligand-binding receptor  50 
 
 		 403 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.28159 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0023  extracellular ligand-binding receptor  52.46 
 
 		 404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0472  extracellular ligand-binding receptor  50 
 
 		 399 aa  302  9e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2940  extracellular ligand-binding receptor  50.15 
 
 		 421 aa  298  9e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3584  extracellular ligand-binding receptor  41.45 
 
 		 413 aa  245  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4012  hypothetical protein  39.47 
 
 		 402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3012  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  37.6 
 
 		 420 aa  209  9e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3694  hypothetical protein  38.6 
 
 		 408 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61828  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2832  hypothetical protein  33.53 
 
 		 394 aa  169  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0190613  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2085  extracellular ligand-binding receptor  36.16 
 
 		 356 aa  169  7e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0264  extracellular ligand-binding receptor  35.67 
 
 		 378 aa  169  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241284  normal  0.379489 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0570  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  33.08 
 
 		 394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3957  hypothetical protein  33.06 
 
 		 400 aa  163  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0470  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  33.06 
 
 		 391 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.10614 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1534  putative lipoprotein-like protein  32.58 
 
 		 402 aa  159  6e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.75635  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0447  extracellular ligand-binding receptor  32.48 
 
 		 394 aa  152  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.766827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1812  hypothetical protein  33.14 
 
 		 391 aa  150  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0459  hypothetical protein  33.14 
 
 		 391 aa  150  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0898  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  30.03 
 
 		 370 aa  113  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2581  hypothetical protein  32.37 
 
 		 354 aa  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0732986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3300  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  23.32 
 
 		 676 aa  87  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464162 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3138  hypothetical protein  27.51 
 
 		 419 aa  87  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1037  extracellular ligand-binding receptor  25.82 
 
 		 643 aa  87  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000129321  unclonable  0.0000121148 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  24.15 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3118  hypothetical protein  38.66 
 
 		 494 aa  74.7  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0105  ABC-type transport systems, periplasmic component  24.58 
 
 		 627 aa  72  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  25.83 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2424  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.67 
 
 		 383 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.806831  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1439  Extracellular ligand-binding receptor  25.28 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1534  Extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0446  extracellular ligand-binding receptor  24.52 
 
 		 451 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  24.72 
 
 		 384 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4758  extracellular ligand-binding receptor  24.85 
 
 		 382 aa  53.9  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1762  extracellular ligand-binding receptor  23.58 
 
 		 449 aa  53.9  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.304418  hitchhiker  0.000873526 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  21.59 
 
 		 397 aa  53.1  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1583  extracellular ligand-binding receptor  22.51 
 
 		 450 aa  53.1  0.000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1365  extracellular ligand-binding receptor  24.13 
 
 		 392 aa  53.1  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.08 
 
 		 385 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  21.28 
 
 		 381 aa  52.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  22.13 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3863  Extracellular ligand-binding receptor  24.75 
 
 		 651 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0863227 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04379  LppC superfamily  29.58 
 
 		 576 aa  51.6  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.418769  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2204  LppC family lipoprotein  29.41 
 
 		 628 aa  51.2  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.972417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  22.25 
 
 		 383 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0295  extracellular ligand-binding receptor  26.57 
 
 		 425 aa  50.8  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00215274  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1468  extracellular ligand-binding receptor  22.03 
 
 		 369 aa  50.8  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000538626  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0185  putative lipoprotein  26.26 
 
 		 625 aa  50.4  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2102  LppC family lipoprotein  23.49 
 
 		 631 aa  49.3  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2212  LppC family lipoprotein  26.67 
 
 		 621 aa  49.7  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.228557 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  20.92 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0316  Putative lipoprotein-like protein  23.91 
 
 		 612 aa  48.9  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.915463  hitchhiker  0.000474295 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0143  lipoprotein, putative  23.91 
 
 		 612 aa  48.9  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0532  Extracellular ligand-binding receptor  24.13 
 
 		 370 aa  48.9  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0390708  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1763  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  27.06 
 
 		 677 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4482  extracellular ligand-binding receptor  24.18 
 
 		 371 aa  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0592  extracellular ligand-binding receptor  21.82 
 
 		 447 aa  48.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.944632  hitchhiker  0.0000426056 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2923  hypothetical protein  27.94 
 
 		 603 aa  47.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0356  LppC putative lipoprotein  27.59 
 
 		 629 aa  47.4  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3584  LppC family lipoprotein  24.06 
 
 		 704 aa  47.4  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129912 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1579  extracellular ligand-binding receptor  25.08 
 
 		 392 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5889  extracellular ligand-binding receptor  21.63 
 
 		 382 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  24.67 
 
 		 382 aa  47  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4471  extracellular ligand-binding receptor  24.77 
 
 		 373 aa  47  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0995  Extracellular ligand-binding receptor  24.59 
 
 		 379 aa  47  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725983  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0701  Extracellular ligand-binding receptor  23.68 
 
 		 377 aa  46.6  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0183935  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1582  branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  22.25 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000809144  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3522  LppC superfamily  23.22 
 
 		 680 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.173213  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3066  hypothetical protein  27.42 
 
 		 603 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4277  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.58 
 
 		 515 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0628932  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2820  extracellular ligand-binding receptor  22.15 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0686  extracellular ligand-binding receptor  23.66 
 
 		 461 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3453  LppC superfamily  23.22 
 
 		 680 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1165  extracellular ligand-binding receptor  23.66 
 
 		 461 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.439455  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2305  extracellular ligand-binding receptor  26.64 
 
 		 380 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3619  LppC family protein  23.22 
 
 		 680 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4466  putative lipoprotein  23.31 
 
 		 678 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3629  putative lipoprotein  23.78 
 
 		 678 aa  45.8  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0551  LppC family lipoprotein  23.31 
 
 		 678 aa  46.2  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.551185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3442  putative lipoprotein  23.31 
 
 		 678 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1141  extracellular ligand-binding receptor  23.66 
 
 		 382 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03014  hypothetical protein  23.31 
 
 		 678 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0558  LppC family lipoprotein  23.31 
 
 		 678 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1761  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.16 
 
 		 467 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  22.19 
 
 		 391 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  22.19 
 
 		 391 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3559  LppC superfamily  22.75 
 
 		 680 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3339  putative lipoprotein  23.31 
 
 		 678 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4559  Extracellular ligand-binding receptor  24.75 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  22.22 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.962079 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>