69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4463 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4463  major facilitator transporter  100 
 
 		 449 aa  890    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.756392  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5777  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 		 417 aa  180  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6021  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 		 410 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal  0.959126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3662  hypothetical protein  31.63 
 
 		 415 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.246746  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4522  hypothetical protein  27.16 
 
 		 427 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8042  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 		 436 aa  130  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2674  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 		 443 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7065  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 433 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1642  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 460 aa  108  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0959  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 434 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00812848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0418  hypothetical protein  29.47 
 
 		 419 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3758  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 		 418 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3638  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 		 409 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205021  decreased coverage  0.00774423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8436  major facilitator superfamily MFS_1  27.02 
 
 		 429 aa  99.8  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.599978 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1069  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 395 aa  99.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.865117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1225  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 		 468 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  0.3032 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3099  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 433 aa  67.8  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4177  hypothetical protein  27.66 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.464754 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 		 419 aa  56.2  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 		 417 aa  53.1  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  27.67 
 
 		 424 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  22.06 
 
 		 423 aa  53.1  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1994  putative MFS-type transporter YdeE  25.71 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.252393  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  27.67 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  27.67 
 
 		 424 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 391 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 466 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  22.79 
 
 		 395 aa  50.4  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3789  efflux transporter, putative  26.1 
 
 		 406 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0557908 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1660  major facilitator superfamily transporter  30.15 
 
 		 510 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0977  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 503 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0376  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 		 420 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  22.82 
 
 		 450 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1091  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  25.81 
 
 		 424 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 398 aa  48.5  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 		 423 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  22.1 
 
 		 423 aa  47.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  22.1 
 
 		 423 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  22.1 
 
 		 423 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  23.73 
 
 		 381 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  22.1 
 
 		 423 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1742  putative MFS-type transporter YdeE  24.68 
 
 		 395 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0931308  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1571  major facilitator transporter  23.14 
 
 		 407 aa  47.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 405 aa  47.4  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  23.32 
 
 		 421 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  23.12 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15780  Major Facilitator Superfamily transporter  28.86 
 
 		 414 aa  46.6  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.475772  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4618  major facilitator superfamily MFS_1  22.99 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01493  predicted transporter  24.68 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.045441  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  49.02 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01504  hypothetical protein  24.68 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1623  putative MFS-type transporter YdeE  24.68 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000326131  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  24.86 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1630  putative MFS-type transporter YdeE  24.68 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0579751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 419 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2148  putative MFS-type transporter YdeE  25 
 
 		 395 aa  45.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.355886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  20.99 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0543  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 		 383 aa  44.3  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  21.66 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2124  putative MFS-type transporter YdeE  24.68 
 
 		 395 aa  44.3  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0942294  normal  0.976791 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  24.59 
 
 		 405 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0707  major facilitator superfamily permease  23.38 
 
 		 412 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 476 aa  43.9  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  24.67 
 
 		 450 aa  43.9  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2181  multidrug resistance protein MdtH  24.44 
 
 		 401 aa  43.9  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.815188  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  28.32 
 
 		 397 aa  43.1  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.503171 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>