More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4367 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  597  1e-170  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4094  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.27 
 
 		 317 aa  282  6.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.466006  normal  0.380638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4244  PecM protein  55.56 
 
 		 335 aa  268  8e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  43.82 
 
 		 293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  41.3 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.37 
 
 		 314 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3106  hypothetical protein  46.18 
 
 		 299 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  44.25 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  43.22 
 
 		 303 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  44.25 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0391  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.9 
 
 		 287 aa  203  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598398  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.86 
 
 		 290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25270  predicted permease, DMT superfamily  49.61 
 
 		 291 aa  200  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  47.27 
 
 		 318 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  41.88 
 
 		 307 aa  198  7.999999999999999e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  43.21 
 
 		 290 aa  195  8.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3501  hypothetical protein  46.49 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2764  hypothetical protein  49.24 
 
 		 310 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.876324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.39 
 
 		 291 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2455  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.66 
 
 		 362 aa  182  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0619  hypothetical protein  39.14 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4210  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.43 
 
 		 290 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2279  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.95 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136903  normal  0.215844 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3677  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.73 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.73 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0088  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.7 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.529373  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  44 
 
 		 395 aa  166  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0070  carboxylate/amino acid/amine transporter  37.14 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2455  hypothetical protein  38.67 
 
 		 272 aa  160  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.93 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0151  putative transmembrane protein  45.61 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0551496  normal  0.867935 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4124  hypothetical protein  36.86 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000621435  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0215  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.47 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000175088  normal  0.378069 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4245  hypothetical protein  36.86 
 
 		 285 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000122262  hitchhiker  0.00219233 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3499  hypothetical protein  36.08 
 
 		 285 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290777  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0213  hypothetical protein  36.08 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223398  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4527  integral membrane domain-containing protein  37.01 
 
 		 284 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3933  hypothetical protein  37.01 
 
 		 284 aa  123  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000367698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3735  hypothetical protein  37.01 
 
 		 284 aa  123  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.486754 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3806  hypothetical protein  37.01 
 
 		 284 aa  123  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.305382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3644  hypothetical protein  32.69 
 
 		 293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3337  hypothetical protein  33.9 
 
 		 298 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.491654 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0682  hypothetical protein  34.15 
 
 		 299 aa  109  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.095942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02200  hypothetical protein  33.33 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3565  DMT family permease  28.11 
 
 		 291 aa  95.5  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003645  permease  29.64 
 
 		 295 aa  92.8  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.436376  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.43 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.1 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2433  hypothetical protein  29.77 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21912  normal  0.079185 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.89 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0367  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.19 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3287  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.56 
 
 		 288 aa  75.5  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  34.69 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  26.14 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.64 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3034  hypothetical protein  28.37 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  30.69 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.66 
 
 		 306 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  29 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  30.04 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  30.04 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  30.04 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  27.61 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3173  hypothetical protein  30.97 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  0.1324 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2356  hypothetical protein  28.94 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469762  normal  0.368317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  30.9 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  28.57 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2416  hypothetical protein  28.7 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0994864  normal  0.0254261 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.56 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  30.61 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  30.34 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.96 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  30.5 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  32.84 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  30.5 
 
 		 326 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  32.39 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  30.5 
 
 		 294 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  27.64 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  31.64 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2920  hypothetical protein  31.08 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.15 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1098  hypothetical protein  33.01 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100036  normal  0.664944 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.75 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3008  hypothetical protein  33.02 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.645099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2810  hypothetical protein  28.52 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.834647  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  27.51 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3324  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.82 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2179  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.47 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.54 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  36.24 
 
 		 308 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8212  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.34 
 
 		 303 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  27.82 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.11 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0335  hypothetical protein  26.57 
 
 		 289 aa  62.4  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.414942 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.26 
 
 		 349 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  27.99 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  30.47 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  27.44 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>