More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3223 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  100 
 
 		 538 aa  1064    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  56.6 
 
 		 535 aa  530  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  55.2 
 
 		 537 aa  528  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  55.62 
 
 		 542 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  51.83 
 
 		 542 aa  462  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  49.6 
 
 		 545 aa  406  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  40.08 
 
 		 569 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  40.04 
 
 		 544 aa  287  4e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  36.45 
 
 		 541 aa  278  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  36.36 
 
 		 616 aa  270  5e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  31.17 
 
 		 574 aa  259  9e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  39.72 
 
 		 548 aa  254  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  39.72 
 
 		 548 aa  254  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  39.72 
 
 		 548 aa  254  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  34.03 
 
 		 576 aa  239  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  33.52 
 
 		 573 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  34.22 
 
 		 603 aa  237  4e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  30.57 
 
 		 556 aa  233  6e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  34.4 
 
 		 573 aa  233  7.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  35.22 
 
 		 560 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  32.44 
 
 		 546 aa  229  7e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  30.63 
 
 		 619 aa  224  4e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  30.32 
 
 		 550 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  34.86 
 
 		 553 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  32.83 
 
 		 564 aa  220  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  33.58 
 
 		 565 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  29.94 
 
 		 552 aa  217  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  32.39 
 
 		 527 aa  216  8e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  32.19 
 
 		 569 aa  216  9e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  29.74 
 
 		 548 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  32.76 
 
 		 564 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  32.39 
 
 		 569 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  35.7 
 
 		 530 aa  209  7e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  33.46 
 
 		 606 aa  209  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  29.98 
 
 		 557 aa  208  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  32.14 
 
 		 544 aa  207  3e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  33.96 
 
 		 553 aa  207  5e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  30.34 
 
 		 543 aa  207  6e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  35.32 
 
 		 532 aa  206  7e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  29.86 
 
 		 553 aa  205  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  33.27 
 
 		 556 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  33.09 
 
 		 580 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  34.27 
 
 		 620 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  33.86 
 
 		 568 aa  199  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  31.47 
 
 		 580 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  32.17 
 
 		 565 aa  197  6e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  29.38 
 
 		 558 aa  196  7e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  32.11 
 
 		 560 aa  196  8.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  31.04 
 
 		 608 aa  196  9e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  29.77 
 
 		 585 aa  195  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  33.21 
 
 		 601 aa  195  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  32.94 
 
 		 583 aa  194  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  30.86 
 
 		 613 aa  193  7e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  35.01 
 
 		 543 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  35.01 
 
 		 583 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  35.01 
 
 		 583 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  32.44 
 
 		 556 aa  190  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  34.06 
 
 		 552 aa  189  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  31.69 
 
 		 582 aa  188  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  34.49 
 
 		 549 aa  186  8e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  37.07 
 
 		 536 aa  186  9e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  32.35 
 
 		 576 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0751  amidohydrolase 3  32.33 
 
 		 575 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.696305 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4693  amidohydrolase 3  29.89 
 
 		 565 aa  184  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  28.11 
 
 		 520 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  32.58 
 
 		 545 aa  182  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  31.19 
 
 		 543 aa  182  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1053  hypothetical protein  29.45 
 
 		 583 aa  182  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  32.86 
 
 		 554 aa  181  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  32.51 
 
 		 522 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3987  amidohydrolase 3  29.16 
 
 		 563 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3862  amidohydrolase 3  28.97 
 
 		 563 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0992  hypothetical protein  29.27 
 
 		 583 aa  180  4.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  33.09 
 
 		 565 aa  180  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  33.9 
 
 		 574 aa  179  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  27.85 
 
 		 596 aa  179  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  31.95 
 
 		 546 aa  177  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  34.53 
 
 		 537 aa  177  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  32.2 
 
 		 549 aa  177  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  28.08 
 
 		 522 aa  173  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  27.88 
 
 		 522 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10795  conserved hypothetical protein  29.44 
 
 		 549 aa  172  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  27.69 
 
 		 522 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  27.69 
 
 		 522 aa  172  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  27.69 
 
 		 522 aa  171  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  27.69 
 
 		 522 aa  171  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  28.39 
 
 		 555 aa  171  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0253  amidohydrolase 3  31.71 
 
 		 551 aa  171  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  29.35 
 
 		 601 aa  170  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  27.5 
 
 		 522 aa  169  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  31.82 
 
 		 589 aa  169  8e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  26.55 
 
 		 544 aa  169  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0990  urease domain-containing protein  28.73 
 
 		 563 aa  168  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  30.36 
 
 		 560 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2198  amidohydrolase 3  33.55 
 
 		 501 aa  169  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  31.35 
 
 		 564 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  35.82 
 
 		 536 aa  167  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  32.55 
 
 		 541 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  29.91 
 
 		 560 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  26.96 
 
 		 539 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>