More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2132 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2132  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 246 aa  483  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5224  GntR domain protein  43.1 
 
 		 244 aa  190  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4384  GntR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 242 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4471  GntR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 242 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.788198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4765  GntR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 242 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12010  transcriptional regulator, GntR family  44.44 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3342  GntR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 246 aa  155  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05160  transcriptional regulator, GntR family  42.34 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2896  GntR domain protein  44.83 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0843059  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0375  GntR domain protein  38.5 
 
 		 234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.400874  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7371  transcriptional regulator NanR  40.43 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3039  GntR domain protein  41.28 
 
 		 251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0453  regulatory protein GntR HTH  34.75 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0156183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19880  transcriptional regulator  34.51 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  32.57 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  32.3 
 
 		 239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 233 aa  109  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 238 aa  105  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  31.56 
 
 		 239 aa  102  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4412  GntR domain protein  36.73 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  31.1 
 
 		 239 aa  99.4  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  32.86 
 
 		 239 aa  99  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  29.74 
 
 		 245 aa  98.6  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  39.56 
 
 		 226 aa  95.5  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  39.02 
 
 		 250 aa  94.4  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 241 aa  94.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  30.22 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  31.82 
 
 		 241 aa  93.2  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  32.92 
 
 		 231 aa  93.6  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  31.44 
 
 		 243 aa  92  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 255 aa  91.7  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3223  GntR domain protein  34.98 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000159971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  30 
 
 		 227 aa  91.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0202  GntR-like  32.59 
 
 		 257 aa  90.5  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3930  GntR domain-containing protein  35.65 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  33.64 
 
 		 248 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  33.77 
 
 		 230 aa  90.1  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5438  transcriptional regulator GntR family  31.96 
 
 		 251 aa  89.4  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  30.53 
 
 		 241 aa  89.7  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 261 aa  89  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0633  transcriptional regulator PdhR  31.03 
 
 		 254 aa  88.6  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  31.51 
 
 		 240 aa  88.6  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0164  transcriptional regulator PdhR  30.43 
 
 		 254 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2079  regulatory protein GntR HTH  32.24 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.744782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0170  transcriptional regulator PdhR  30.43 
 
 		 254 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0173  transcriptional regulator PdhR  30.43 
 
 		 254 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0149565  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0164  transcriptional regulator PdhR  30.43 
 
 		 254 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.754019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  30.22 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0165  transcriptional regulator PdhR  30.43 
 
 		 254 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0750  GntR family transcriptional regulator  37 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.33475  normal  0.139544 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00112  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  30 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00731446  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3489  regulatory protein GntR HTH  30 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000065438  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0120  transcriptional regulator PdhR  30 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0106  transcriptional regulator PdhR  30 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0767654  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0117  transcriptional regulator PdhR  30 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000950379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  31.51 
 
 		 240 aa  87  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00111  hypothetical protein  30 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0201037  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  30.12 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3546  transcriptional regulator PdhR  30 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000909517  normal  0.0248062 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0115  transcriptional regulator PdhR  30 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00632319  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 257 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0123  transcriptional regulator PdhR  30 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.739593 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0606  GntR domain-containing protein  33.06 
 
 		 245 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  32.77 
 
 		 254 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  31.2 
 
 		 257 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 256 aa  86.7  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 258 aa  85.9  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  34.09 
 
 		 242 aa  85.5  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  29.63 
 
 		 252 aa  85.5  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1674  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 246 aa  85.1  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3569  transcriptional regulator PdhR  31.03 
 
 		 254 aa  85.1  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002549  transcriptional repressor for pyruvate dehydrogenase complex  29 
 
 		 255 aa  85.1  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1991  transcriptional regulator PdhR  27.64 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2520  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4012  transcriptional regulator PdhR  30.17 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.152194  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  28.91 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02849  DNA-binding transcriptional dual regulator, glycolate-binding  28.92 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0051984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0716  GntR domain protein  28.92 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  28.51 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3755  transcriptional regulator PdhR  30 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000830263  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2081  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0720  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  28.92 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02799  hypothetical protein  28.92 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00647704  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.96 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3153  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  28.92 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  31.41 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3440  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  28.92 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.96 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3258  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  28.92 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  29.2 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>