More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1649 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  100 
 
 		 385 aa  781    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0809  aminotransferase, class V  54.13 
 
 		 382 aa  395  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  53.44 
 
 		 383 aa  393  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2884  cysteine desulfurase  56.87 
 
 		 373 aa  390  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1949  aminotransferase, class V  50.67 
 
 		 385 aa  365  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000781244  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0675  aminotransferase, class V  49.34 
 
 		 385 aa  333  2e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00811405  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  42.13 
 
 		 388 aa  324  2e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  49.33 
 
 		 1135 aa  322  6e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  43.97 
 
 		 382 aa  319  7e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2206  Cysteine desulfurase  48.94 
 
 		 387 aa  318  9e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0240111  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  45.41 
 
 		 400 aa  318  1e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  44.03 
 
 		 394 aa  317  2e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  45.12 
 
 		 388 aa  316  4e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  43.24 
 
 		 394 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  42.29 
 
 		 392 aa  314  1.9999999999999998e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  44.3 
 
 		 403 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  45.48 
 
 		 389 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  45.21 
 
 		 389 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  44.8 
 
 		 379 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  46.79 
 
 		 383 aa  312  4.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  46.79 
 
 		 383 aa  312  6.999999999999999e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4856  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  45.41 
 
 		 389 aa  310  4e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224928 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  45.09 
 
 		 394 aa  308  9e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  44.95 
 
 		 394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  46.85 
 
 		 383 aa  306  3e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  46.07 
 
 		 393 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  43.88 
 
 		 393 aa  305  8.000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  43.09 
 
 		 389 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  42.59 
 
 		 402 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  43.24 
 
 		 396 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  41.84 
 
 		 404 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1872  aminotransferase, class V  44.3 
 
 		 400 aa  302  7.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  44.53 
 
 		 407 aa  301  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  43.35 
 
 		 396 aa  301  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  44.83 
 
 		 386 aa  301  1e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  41.8 
 
 		 396 aa  300  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  44.68 
 
 		 391 aa  299  4e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42.82 
 
 		 400 aa  299  5e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  43.15 
 
 		 409 aa  299  6e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  41.8 
 
 		 414 aa  299  6e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  44.83 
 
 		 401 aa  299  7e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  42.18 
 
 		 396 aa  299  7e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  44.83 
 
 		 401 aa  299  7e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  44.16 
 
 		 388 aa  298  9e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  43.12 
 
 		 391 aa  298  9e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  43.12 
 
 		 384 aa  298  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  44.83 
 
 		 401 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  44.03 
 
 		 398 aa  298  1e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  43.62 
 
 		 386 aa  297  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1353  aminotransferase, class V  46.15 
 
 		 389 aa  297  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  43.39 
 
 		 400 aa  297  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  46.28 
 
 		 1143 aa  297  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  43.85 
 
 		 381 aa  296  5e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  42.29 
 
 		 393 aa  296  6e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  43.12 
 
 		 391 aa  295  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  42.71 
 
 		 399 aa  294  1e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  42.08 
 
 		 401 aa  294  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  44.56 
 
 		 399 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  41.53 
 
 		 392 aa  294  2e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  41.11 
 
 		 382 aa  294  2e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  43.62 
 
 		 400 aa  294  2e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  42.97 
 
 		 384 aa  294  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  44.42 
 
 		 407 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  44.42 
 
 		 407 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  44.42 
 
 		 407 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  44.42 
 
 		 407 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  45.1 
 
 		 395 aa  293  3e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0907  aminotransferase, class V  45.58 
 
 		 383 aa  293  3e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000245321  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  43.75 
 
 		 407 aa  293  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  44.92 
 
 		 398 aa  293  5e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  44.42 
 
 		 407 aa  292  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  43.86 
 
 		 400 aa  292  7e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  44.16 
 
 		 407 aa  292  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  42.82 
 
 		 404 aa  292  8e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  44.16 
 
 		 407 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42.18 
 
 		 404 aa  291  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  43.05 
 
 		 384 aa  291  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4811  cysteine desulfurase  44.47 
 
 		 398 aa  290  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  42.02 
 
 		 389 aa  291  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  43.65 
 
 		 380 aa  291  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5030  aminotransferase class V  44.47 
 
 		 388 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  41.64 
 
 		 398 aa  291  2e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  42.45 
 
 		 407 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  42.3 
 
 		 401 aa  290  4e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  45.36 
 
 		 1139 aa  290  4e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  43.75 
 
 		 407 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  45.69 
 
 		 397 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  43.75 
 
 		 407 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  44.01 
 
 		 407 aa  289  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  41.56 
 
 		 398 aa  289  6e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  43.75 
 
 		 407 aa  289  7e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  43.75 
 
 		 407 aa  289  7e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  43.75 
 
 		 407 aa  289  7e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  43.49 
 
 		 407 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  44.95 
 
 		 410 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  42.45 
 
 		 407 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  44.15 
 
 		 394 aa  288  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  41.25 
 
 		 401 aa  288  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  42.82 
 
 		 388 aa  288  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  43.35 
 
 		 400 aa  288  2e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>