More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1450 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1450  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  682    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.996482  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  42.09 
 
 		 364 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  36.45 
 
 		 372 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  36.34 
 
 		 340 aa  181  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2554  hypothetical protein  35.43 
 
 		 356 aa  173  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0956  hypothetical protein  37.3 
 
 		 349 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0392869 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1984  hypothetical protein  39.16 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372704  normal  0.185401 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0340  hypothetical protein  39.16 
 
 		 340 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3439  hypothetical protein  38.69 
 
 		 370 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.242294 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0915  hypothetical protein  31.99 
 
 		 346 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2262  hypothetical protein  32.71 
 
 		 381 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141033  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1508  hypothetical protein  32.75 
 
 		 401 aa  146  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0662165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1787  protein of unknown function UPF0118  32.75 
 
 		 392 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190485  normal  0.0890558 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1508  protein of unknown function UPF0118  32.96 
 
 		 395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4216  hypothetical protein  36.99 
 
 		 346 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2700  hypothetical protein  30.68 
 
 		 368 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0306531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2711  hypothetical protein  30.66 
 
 		 395 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1751  hypothetical protein  33.94 
 
 		 353 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.903333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0244  protein of unknown function UPF0118  32.04 
 
 		 376 aa  134  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1905  hypothetical protein  30.21 
 
 		 379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.358826 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2675  hypothetical protein  29.41 
 
 		 391 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173775  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07191  permease  29.7 
 
 		 359 aa  130  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3110  protein of unknown function UPF0118  28.41 
 
 		 383 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  32.19 
 
 		 372 aa  129  7.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4286  hypothetical protein  33.66 
 
 		 343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4585  putative transport protein/permease  28.12 
 
 		 382 aa  126  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1078  protein of unknown function UPF0118  30.13 
 
 		 336 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0134  hypothetical protein  29.8 
 
 		 358 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  30.84 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1411  hypothetical protein  31.4 
 
 		 369 aa  124  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  28.3 
 
 		 349 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0783  hypothetical protein  32.55 
 
 		 365 aa  124  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.930721  normal  0.646408 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  31.3 
 
 		 340 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07661  permease  28.45 
 
 		 358 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0908  hypothetical protein  40.33 
 
 		 355 aa  120  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0708322  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2742  protein of unknown function UPF0118  32.19 
 
 		 344 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  unclonable  0.00000000268058 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3369  protein of unknown function UPF0118  31.56 
 
 		 344 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  28.37 
 
 		 382 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2235  hypothetical protein  28.53 
 
 		 395 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.55122  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0518  hypothetical protein  30.24 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4793  hypothetical protein  29.43 
 
 		 344 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  28.46 
 
 		 344 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3863  hypothetical protein  30.46 
 
 		 347 aa  102  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.596541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1195  hypothetical protein  29.72 
 
 		 329 aa  102  9e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16391  permease  29.57 
 
 		 360 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.216071 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  25.07 
 
 		 361 aa  97.1  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  25.58 
 
 		 361 aa  96.7  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  37.06 
 
 		 354 aa  96.3  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  25.07 
 
 		 361 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  22.9 
 
 		 341 aa  95.9  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  25.07 
 
 		 361 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1196  hypothetical protein  34.76 
 
 		 359 aa  94.4  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  25.35 
 
 		 373 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  26.57 
 
 		 361 aa  94  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  25.23 
 
 		 348 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1275  hypothetical protein  29.53 
 
 		 329 aa  92.4  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  26 
 
 		 361 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  26 
 
 		 361 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  26 
 
 		 361 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09331  permease  25.54 
 
 		 347 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09321  permease  27.27 
 
 		 347 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  24.61 
 
 		 348 aa  89.4  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0873  hypothetical protein  26.8 
 
 		 347 aa  87  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.475897  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2670  protein of unknown function UPF0118  26.71 
 
 		 345 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3434  protein of unknown function UPF0118  26.71 
 
 		 345 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  20.13 
 
 		 392 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  26.59 
 
 		 368 aa  83.2  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  26.55 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10101  permease  26.62 
 
 		 347 aa  79.7  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  26.78 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  26.58 
 
 		 368 aa  79.3  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2189  protein of unknown function UPF0118  31.22 
 
 		 396 aa  79  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  22.04 
 
 		 368 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  28.8 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  22.34 
 
 		 349 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0581  protein of unknown function UPF0118  32.2 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.96457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  28.17 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0263  protein of unknown function UPF0118  30.12 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.120153  normal  0.560864 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  25.39 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  22.37 
 
 		 372 aa  75.9  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  31.36 
 
 		 417 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  26.51 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  27.11 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  23.21 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1274  hypothetical protein  36.7 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.094175  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  29.87 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  27.11 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  27.11 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  27.11 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  24.07 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  27.11 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  27.11 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  27.11 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  27.11 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  21.58 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  26.27 
 
 		 368 aa  72  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  25.83 
 
 		 357 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2800  hypothetical protein  26.83 
 
 		 425 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0330256  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  23.72 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  27.5 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>