202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2890 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2890  KaiA binding protein  100 
 
 
236 aa  485  1e-136  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1860  KaiA binding  58.47 
 
 
228 aa  294  7e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1062  KaiA binding  55.51 
 
 
228 aa  285  5e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38736  normal  0.180687 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2260  KaiA binding  53.42 
 
 
231 aa  270  1e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00780772 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0048  putative circadian clock protein, KaiC  40.93 
 
 
235 aa  194  1e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1755  ATPase  39.84 
 
 
247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  29.68 
 
 
266 aa  101  9e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1691  KaiC  25.93 
 
 
259 aa  99.4  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.601669  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0039  putative circadian clock protein, KaiC  32.26 
 
 
505 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0424208 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0135  putative circadian clock protein, KaiC  30.25 
 
 
506 aa  94  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.034427 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0483  putative circadian clock protein, KaiC  29.54 
 
 
362 aa  93.2  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  29.24 
 
 
499 aa  92  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1661  putative circadian clock protein, KaiC  28.09 
 
 
344 aa  92  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0019  non-specific serine/threonine protein kinase  31.8 
 
 
520 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0020  putative circadian clock protein, KaiC  31.8 
 
 
520 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  29.17 
 
 
514 aa  90.9  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2453  putative circadian clock protein, KaiC  27.47 
 
 
478 aa  90.9  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  29.06 
 
 
224 aa  90.9  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.75 
 
 
498 aa  90.5  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4712  non-specific serine/threonine protein kinase  32.72 
 
 
507 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  29.36 
 
 
482 aa  90.1  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  27.23 
 
 
494 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  27.23 
 
 
229 aa  89.7  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  31.3 
 
 
496 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2689  putative circadian clock protein, KaiC  27.95 
 
 
234 aa  87.8  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2718  hypothetical protein  27.59 
 
 
494 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150479  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2398  hypothetical protein  30.13 
 
 
508 aa  85.9  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.381909  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  28.29 
 
 
506 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  29.66 
 
 
498 aa  85.5  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  29.3 
 
 
402 aa  84.3  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  26.89 
 
 
505 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  28.57 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6620  putative circadian clock protein, KaiC  30.08 
 
 
497 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2609  hypothetical protein  29.95 
 
 
505 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0628  putative circadian clock protein, KaiC  31.38 
 
 
492 aa  82  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.60194  normal  0.0153191 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  26.27 
 
 
510 aa  81.6  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0945  putative circadian clock protein, KaiC  27.71 
 
 
241 aa  81.6  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.553729  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5921  putative circadian clock protein, KaiC  29.82 
 
 
502 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3624  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.46 
 
 
480 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  26.27 
 
 
510 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5757  putative circadian clock protein, KaiC  27.82 
 
 
481 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36007  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  29.91 
 
 
496 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1170  putative circadian clock protein, KaiC  25.32 
 
 
237 aa  80.1  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0984322  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  28.37 
 
 
562 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0671  putative circadian clock protein, KaiC  26.92 
 
 
535 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5592  hypothetical protein  28.69 
 
 
480 aa  80.1  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  29.3 
 
 
575 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5577  non-specific serine/threonine protein kinase  26.84 
 
 
500 aa  79.3  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15364  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  29.3 
 
 
575 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  27.52 
 
 
500 aa  79  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  30.52 
 
 
570 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6530  putative circadian clock protein, KaiC  28.37 
 
 
501 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  28.06 
 
 
507 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  28.06 
 
 
507 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2779  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.39 
 
 
504 aa  77.4  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  25.94 
 
 
574 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  27.04 
 
 
532 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2268  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.5 
 
 
503 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00960812  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  27.06 
 
 
500 aa  76.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2044  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.96 
 
 
503 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174274  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1332  non-specific serine/threonine protein kinase  28.5 
 
 
502 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723068 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3030  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.5 
 
 
497 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2357  putative circadian clock protein, KaiC  27.65 
 
 
232 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0504614  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1657  putative circadian clock protein, KaiC  30.33 
 
 
501 aa  76.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  28.84 
 
 
567 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  25.96 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  25.23 
 
 
509 aa  76.3  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5974  non-specific serine/threonine protein kinase  28.51 
 
 
504 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270987  normal  0.51709 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  25.96 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  24.58 
 
 
301 aa  75.5  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1102  non-specific serine/threonine protein kinase  27.73 
 
 
489 aa  75.5  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  26.61 
 
 
488 aa  75.1  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  27.7 
 
 
519 aa  74.3  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1513  KaiC  22.55 
 
 
459 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00132783  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2353  putative circadian clock protein, KaiC  29.49 
 
 
489 aa  73.6  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  25.97 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  24.77 
 
 
509 aa  73.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  24.31 
 
 
498 aa  73.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0524  putative circadian clock protein, KaiC  25.11 
 
 
364 aa  73.2  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  24.17 
 
 
509 aa  73.2  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  24.02 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  24.77 
 
 
509 aa  73.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0174  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.96 
 
 
461 aa  72.8  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1553  putative circadian clock protein, KaiC  26.25 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  24.31 
 
 
512 aa  72.4  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  23.95 
 
 
504 aa  72  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3435  putative circadian clock protein, KaiC  27.52 
 
 
492 aa  71.2  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0596  putative circadian clock protein, KaiC  27.15 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00351856  hitchhiker  0.0000057975 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3229  non-specific serine/threonine protein kinase  29.59 
 
 
494 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  24.17 
 
 
514 aa  70.5  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  25 
 
 
520 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  24.77 
 
 
519 aa  70.5  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  24.79 
 
 
528 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0550  putative circadian clock protein, KaiC  26.61 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1297  putative circadian clock protein, KaiC  27.06 
 
 
492 aa  70.5  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2554  putative circadian clock protein, KaiC  26.69 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.445302  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0246  putative circadian clock protein, KaiC  29.06 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.168634  normal  0.157479 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  24.17 
 
 
519 aa  70.1  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  25.23 
 
 
512 aa  69.7  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2095  KaiC  25.42 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>