64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3739 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3739  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  389  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0861772  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2679  hypothetical protein  89.39 
 
 		 198 aa  362  3e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5187  DedA  80.83 
 
 		 193 aa  320  6e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0868  DedA family  78.24 
 
 		 193 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0978  DedA family protein  77.2 
 
 		 193 aa  310  9e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00254572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0958  hypothetical protein  78.24 
 
 		 193 aa  309  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.361291  normal  0.790222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0715  DedA family  72.4 
 
 		 205 aa  288  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628845  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0699  DedA family  60.1 
 
 		 193 aa  231  6e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0725  DedA family protein  60.1 
 
 		 193 aa  230  9e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0738  DedA family protein  60.1 
 
 		 193 aa  230  9e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0048  DedA family protein  59.07 
 
 		 193 aa  230  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0479  DedA family protein  60.32 
 
 		 193 aa  225  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5212  DedA family protein  59.89 
 
 		 193 aa  221  7e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5957  DedA family protein  59.88 
 
 		 193 aa  217  7.999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0757  DedA family protein  50.51 
 
 		 210 aa  208  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2964  DedA family  51.85 
 
 		 193 aa  198  5e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1168  DedA family protein  50.29 
 
 		 192 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0232351 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2492  DedA family protein  47.34 
 
 		 192 aa  176  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.107524 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  46.88 
 
 		 192 aa  166  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3196  DedA family protein  49.47 
 
 		 200 aa  165  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556536  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_004310  BR1641  hypothetical protein  48.68 
 
 		 196 aa  158  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0984  membrane-like protein  48.42 
 
 		 212 aa  158  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1589  hypothetical protein  48.68 
 
 		 222 aa  157  9e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.356457  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3998  hypothetical protein  44.62 
 
 		 196 aa  155  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1274  hypothetical protein  47.87 
 
 		 196 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72790  hypothetical protein  42.86 
 
 		 194 aa  154  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2545  hypothetical protein  47.85 
 
 		 195 aa  150  8e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3116  hypothetical protein  48.57 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3844  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  46.11 
 
 		 196 aa  147  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.662096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1314  hypothetical protein  42.53 
 
 		 197 aa  145  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00346276  decreased coverage  0.000188073 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  40.53 
 
 		 214 aa  141  7e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0371  hypothetical protein  44 
 
 		 192 aa  140  8e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  37.23 
 
 		 197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1255  hypothetical protein  40.64 
 
 		 192 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0889015  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3551  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  42.16 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.846117  normal  0.490696 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2076  hypothetical protein  42.24 
 
 		 195 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1077  DedA family membrane protein  39.11 
 
 		 192 aa  132  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1827  hypothetical protein  43.58 
 
 		 193 aa  130  7.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1434  SNARE associated Golgi protein  45.51 
 
 		 194 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  38.12 
 
 		 183 aa  128  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1822  SNARE associated Golgi protein  43.29 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000131488  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  42.77 
 
 		 193 aa  125  6e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0548  SNARE associated Golgi protein-related protein  41.46 
 
 		 195 aa  119  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1429  hypothetical protein  42.31 
 
 		 191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0411  SNARE associated Golgi protein  42.11 
 
 		 195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100204 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0183  hypothetical protein  36.41 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  37.08 
 
 		 416 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1501  lipoprotein B  34.13 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0681914  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  30.81 
 
 		 195 aa  99  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  36.73 
 
 		 187 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1286  SNARE associated Golgi protein-related protein  42.7 
 
 		 194 aa  93.2  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.453161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4083  hypothetical protein  28.07 
 
 		 190 aa  90.5  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00163  lipoprotein  37.42 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193393  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1460  hypothetical protein  31.98 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0653  hypothetical protein  29.22 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1994  lipoprotein  34.42 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1920  hypothetical protein  33.77 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.817234  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  27.91 
 
 		 159 aa  52  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3883  hypothetical protein  26.71 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.230327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1852  hypothetical protein  28.47 
 
 		 145 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1825  hypothetical protein  27.08 
 
 		 145 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.44 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1746  SNARE associated Golgi protein  28.68 
 
 		 160 aa  43.1  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.535585  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  23.43 
 
 		 201 aa  42  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>