More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4942 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  100 
 
 
436 aa  874    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  81.95 
 
 
399 aa  684    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  60.66 
 
 
401 aa  451  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  58.69 
 
 
400 aa  434  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  54.59 
 
 
407 aa  416  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  56.67 
 
 
400 aa  409  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  52.76 
 
 
408 aa  405  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  54.36 
 
 
399 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  50.25 
 
 
400 aa  384  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  53.1 
 
 
395 aa  379  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  53.81 
 
 
400 aa  381  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  49.63 
 
 
400 aa  365  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  51.91 
 
 
401 aa  364  1e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  52.18 
 
 
410 aa  364  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  50.88 
 
 
408 aa  363  3e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  49.75 
 
 
430 aa  342  5e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  46.73 
 
 
421 aa  326  6e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  46.08 
 
 
397 aa  307  3e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  48.24 
 
 
402 aa  306  7e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  46.67 
 
 
414 aa  305  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  48.47 
 
 
357 aa  298  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  45.92 
 
 
409 aa  295  8e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  45.22 
 
 
399 aa  290  4e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  43.33 
 
 
407 aa  288  9e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  43.33 
 
 
407 aa  288  9e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  43.14 
 
 
409 aa  287  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  42.36 
 
 
400 aa  286  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  43.45 
 
 
405 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  45.43 
 
 
399 aa  282  8.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  44.06 
 
 
406 aa  281  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  41.4 
 
 
408 aa  280  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  42.11 
 
 
415 aa  278  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  45.25 
 
 
394 aa  277  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  44.53 
 
 
406 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  44.53 
 
 
406 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  44.53 
 
 
406 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  45.37 
 
 
400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  41.71 
 
 
398 aa  272  8.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  41.41 
 
 
401 aa  271  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  46.22 
 
 
345 aa  270  5e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  41.23 
 
 
407 aa  266  5.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  40 
 
 
403 aa  265  8e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  38.27 
 
 
409 aa  264  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  40.49 
 
 
407 aa  263  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  43.78 
 
 
394 aa  263  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  41.2 
 
 
409 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  42.74 
 
 
398 aa  261  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4429  cytochrome P450  41.77 
 
 
413 aa  259  7e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  41.88 
 
 
405 aa  259  7e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  37.84 
 
 
409 aa  258  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  42.75 
 
 
406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3470  cytochrome P450  41.48 
 
 
404 aa  253  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0620803  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  41.25 
 
 
405 aa  252  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  39.55 
 
 
416 aa  249  8e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  37.78 
 
 
408 aa  249  8e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5801  cytochrome P450  43.01 
 
 
395 aa  246  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0291832  normal  0.365285 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  40.37 
 
 
391 aa  246  6e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  39.71 
 
 
423 aa  245  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4201  cytochrome P450  37.81 
 
 
421 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4267  cytochrome P450  37.81 
 
 
421 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.476691  normal  0.954738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4428  cytochrome P450  37.81 
 
 
421 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392257  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  39.05 
 
 
404 aa  240  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  40.54 
 
 
424 aa  239  5.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4419  cytochrome P450  44 
 
 
397 aa  239  9e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1407  cytochrome P450  40.05 
 
 
388 aa  238  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  41.13 
 
 
408 aa  236  9e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  41.32 
 
 
395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  39.67 
 
 
405 aa  233  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  42.28 
 
 
400 aa  233  6e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  39.02 
 
 
398 aa  233  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  40.1 
 
 
417 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2535  cytochrome P450  41.33 
 
 
423 aa  232  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369164  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  41.39 
 
 
412 aa  231  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3692  cytochrome P450  38.11 
 
 
397 aa  230  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  37.14 
 
 
412 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  37.14 
 
 
412 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2105  cytochrome P450  36.41 
 
 
407 aa  229  6e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34341  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  38.89 
 
 
406 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  36.87 
 
 
412 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3008  cytochrome P450  36.95 
 
 
401 aa  227  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  37.2 
 
 
415 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3162  cytochrome P450  38.31 
 
 
404 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.411247  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  37.91 
 
 
402 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5317  cytochrome P450  40.69 
 
 
395 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  39.57 
 
 
375 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  38.28 
 
 
393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  36.92 
 
 
399 aa  216  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  34.69 
 
 
411 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  39.9 
 
 
406 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  37.82 
 
 
411 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  37.3 
 
 
411 aa  212  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  42.15 
 
 
400 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4949  cytochrome P450  37.12 
 
 
412 aa  210  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  37.97 
 
 
400 aa  210  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  37.11 
 
 
395 aa  210  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  36.46 
 
 
404 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22720  cytochrome P450  36.67 
 
 
403 aa  206  6e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2524  cytochrome P450  39.7 
 
 
405 aa  206  8e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  36.41 
 
 
419 aa  205  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  35.48 
 
 
407 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>