More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4308 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4308  beta-lactamase  100 
 
 		 459 aa  907    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0244726  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  35.68 
 
 		 455 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  34.43 
 
 		 461 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  34.62 
 
 		 456 aa  139  8.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  34.77 
 
 		 484 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0772  beta-lactamase  30.85 
 
 		 431 aa  134  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  33.25 
 
 		 464 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  33.59 
 
 		 446 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  33.66 
 
 		 437 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  32.61 
 
 		 460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6467  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.01 
 
 		 551 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341842  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0683  Beta-lactamase  30.93 
 
 		 530 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  29.84 
 
 		 388 aa  108  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  31.44 
 
 		 450 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4688  beta-lactamase  28.68 
 
 		 462 aa  106  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331113  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  28.57 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.44 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.74 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  28.44 
 
 		 388 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  30.92 
 
 		 475 aa  104  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01490  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  30.99 
 
 		 460 aa  104  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.697704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  29.17 
 
 		 463 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.44 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  33.94 
 
 		 451 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  28.44 
 
 		 388 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  28.44 
 
 		 388 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  30.42 
 
 		 497 aa  101  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09928  putative non-ribosomal peptide synthetase  27.41 
 
 		 483 aa  100  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206304  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  30.53 
 
 		 677 aa  100  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  30.65 
 
 		 370 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.17 
 
 		 388 aa  100  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.45 
 
 		 389 aa  99.8  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  27.99 
 
 		 388 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2357  beta-lactamase  33.87 
 
 		 368 aa  99.4  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4262  beta-lactamase  37.71 
 
 		 695 aa  99  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  28.83 
 
 		 389 aa  99  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  39.18 
 
 		 480 aa  97.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  27.06 
 
 		 388 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3144  beta-lactamase  25.47 
 
 		 590 aa  96.7  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  28.26 
 
 		 443 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  26.38 
 
 		 539 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.62 
 
 		 399 aa  95.5  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.88 
 
 		 389 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2996  beta-lactamase  31.45 
 
 		 479 aa  95.1  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  29.53 
 
 		 580 aa  94.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  30.84 
 
 		 5698 aa  94.7  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  26.15 
 
 		 720 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1134  beta-lactamase  28.11 
 
 		 459 aa  94.4  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  27.45 
 
 		 578 aa  94  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2708  beta-lactamase  34.95 
 
 		 417 aa  94  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  26.13 
 
 		 669 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3187  beta-lactamase  30.93 
 
 		 454 aa  93.6  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000216369  hitchhiker  0.000000000911992 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1501  beta-lactamase  28.83 
 
 		 447 aa  93.2  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130484  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4689  beta-lactamase  29.81 
 
 		 374 aa  92.8  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0791767  normal  0.116144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  26.69 
 
 		 365 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  30 
 
 		 498 aa  91.7  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5173  putative beta lactamase family protein  30.18 
 
 		 462 aa  91.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.230482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  35.83 
 
 		 635 aa  90.5  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  28.65 
 
 		 616 aa  90.5  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  37.93 
 
 		 476 aa  90.1  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  32.52 
 
 		 349 aa  89.7  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3287  beta-lactamase  32.74 
 
 		 463 aa  90.1  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0209216 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2896  alkaline D-peptidase  29.25 
 
 		 383 aa  89.7  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.243898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  31.45 
 
 		 658 aa  89.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  29.83 
 
 		 657 aa  89.7  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  38.92 
 
 		 507 aa  89.7  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  28.18 
 
 		 533 aa  89.4  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  29.6 
 
 		 650 aa  88.2  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3151  beta-lactamase  33.33 
 
 		 933 aa  88.2  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.7 
 
 		 414 aa  88.2  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  29.34 
 
 		 429 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  36.26 
 
 		 480 aa  87.4  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5327  beta-lactamase  32.46 
 
 		 440 aa  87.4  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2213  beta-lactamase  30.19 
 
 		 380 aa  87.4  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  33.96 
 
 		 633 aa  87  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.02 
 
 		 407 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  31.44 
 
 		 385 aa  86.7  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1021  beta-lactamase  30.08 
 
 		 353 aa  86.3  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.627803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.77 
 
 		 416 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0126  beta-lactamase  27.64 
 
 		 456 aa  85.5  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.14 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.56 
 
 		 378 aa  85.9  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  29.61 
 
 		 717 aa  85.5  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.43 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.96 
 
 		 385 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.72 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  28.38 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  27.57 
 
 		 466 aa  85.1  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  32.41 
 
 		 523 aa  84.7  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0801  beta-lactamase  27.13 
 
 		 478 aa  84.7  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.87828  normal  0.048033 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  29.74 
 
 		 375 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  32.93 
 
 		 691 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  31.25 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.96 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4043  beta-lactamase  30.77 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  33.71 
 
 		 496 aa  83.6  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  24.62 
 
 		 463 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  30.46 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3163  beta-lactamase  31.82 
 
 		 862 aa  83.2  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111664  normal  0.813914 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  24.62 
 
 		 481 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>