258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3414 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2205  glycoside hydrolase family protein  63.26 
 
 		 702 aa  816    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3414  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 		 677 aa  1329    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.723218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1347  4-alpha-glucanotransferase  52.15 
 
 		 717 aa  645    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451927  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3421  4-alpha-glucanotransferase  48.5 
 
 		 708 aa  617  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3175  4-alpha-glucanotransferase  46.83 
 
 		 730 aa  593  1e-168  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.682952  normal  0.0349305 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4887  4-alpha-glucanotransferase  46.83 
 
 		 724 aa  589  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11812  4-alpha-glucanotransferase malQ  48.01 
 
 		 724 aa  589  1e-167  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.268573 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1369  4-alpha-glucanotransferase  49.57 
 
 		 708 aa  582  1e-164  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.613124  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0478  4-alpha-glucanotransferase  45.9 
 
 		 730 aa  576  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2153  4-alpha-glucanotransferase  47.69 
 
 		 717 aa  564  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362113  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3529  4-alpha-glucanotransferase  47.84 
 
 		 712 aa  558  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00842103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24590  4-alpha-glucanotransferase  45.38 
 
 		 718 aa  561  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.686427  normal  0.585333 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2633  4-alpha-glucanotransferase  46.76 
 
 		 733 aa  555  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.272173 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2869  4-alpha-glucanotransferase  47.59 
 
 		 719 aa  552  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2913  4-alpha-glucanotransferase  47.59 
 
 		 719 aa  552  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2899  4-alpha-glucanotransferase  47.59 
 
 		 719 aa  552  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1101  4-alpha-glucanotransferase  44.7 
 
 		 717 aa  543  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00817417  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13220  4-alpha-glucanotransferase  45.01 
 
 		 717 aa  510  1e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.133916  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3533  4-alpha-glucanotransferase  43.5 
 
 		 721 aa  503  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5309  4-alpha-glucanotransferase  45.87 
 
 		 780 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.242878 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1157  4-alpha-glucanotransferase  45.81 
 
 		 757 aa  489  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.337105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1321  4-alpha-glucanotransferase  40.95 
 
 		 745 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0251  4-alpha-glucanotransferase  38.89 
 
 		 721 aa  466  9.999999999999999e-131  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1692  4-alpha-glucanotransferase  39.29 
 
 		 721 aa  463  1e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5116  4-alpha-glucanotransferase  45.25 
 
 		 692 aa  455  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.796514  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1601  4-alpha-glucanotransferase  40.66 
 
 		 766 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1299  4-alpha-glucanotransferase  38.05 
 
 		 749 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0996  4-alpha-glucanotransferase  44.5 
 
 		 660 aa  443  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11750  4-alpha-glucanotransferase  42.66 
 
 		 1169 aa  430  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3093  4-alpha-glucanotransferase  42.04 
 
 		 610 aa  355  2e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601313  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.2 
 
 		 1673 aa  326  8.000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4120  4-alpha-glucanotransferase  33.33 
 
 		 694 aa  315  9.999999999999999e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3927  4-alpha-glucanotransferase  32.48 
 
 		 694 aa  316  9.999999999999999e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0162  4-alpha-glucanotransferase  31.31 
 
 		 698 aa  315  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3992  4-alpha-glucanotransferase  31.31 
 
 		 698 aa  315  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3751  4-alpha-glucanotransferase  31.17 
 
 		 698 aa  313  5.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  35.95 
 
 		 1464 aa  313  6.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01251  4-alpha-glucanotransferase  29.48 
 
 		 732 aa  310  8e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0315  4-alpha-glucanotransferase  33.43 
 
 		 707 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0233  4-alpha-glucanotransferase  32.22 
 
 		 717 aa  307  4.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.95 
 
 		 1715 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0890  4-alpha-glucanotransferase  29.87 
 
 		 699 aa  305  2.0000000000000002e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.763251  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3829  4-alpha-glucanotransferase  30.35 
 
 		 695 aa  300  4e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.7 
 
 		 1703 aa  300  6e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0118  4-alpha-glucanotransferase  30.81 
 
 		 726 aa  293  5e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1607  4-alpha-glucanotransferase  35.85 
 
 		 728 aa  293  5e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001104  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  29.82 
 
 		 726 aa  293  6e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2994  glycoside hydrolase family protein  33.19 
 
 		 692 aa  293  7e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10076  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6826  4-alpha-glucanotransferase  33.57 
 
 		 736 aa  293  9e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4635  4-alpha-glucanotransferase  30.68 
 
 		 696 aa  292  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2365  4-alpha-glucanotransferase  26.95 
 
 		 732 aa  292  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.84762  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1780  4-alpha-glucanotransferase  37.55 
 
 		 605 aa  291  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.900692  normal  0.822688 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3715  4-alpha-glucanotransferase  30.89 
 
 		 692 aa  291  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.4 
 
 		 1730 aa  291  4e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3712  4-alpha-glucanotransferase  30.89 
 
 		 692 aa  291  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2279  4-alpha-glucanotransferase  33.19 
 
 		 684 aa  290  4e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0480824  normal  0.0112086 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.04 
 
 		 1662 aa  291  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3787  4-alpha-glucanotransferase  30.89 
 
 		 692 aa  290  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3821  4-alpha-glucanotransferase  30.89 
 
 		 692 aa  290  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04850  4-alpha-glucanotransferase  29.81 
 
 		 726 aa  290  9e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3883  4-alpha-glucanotransferase  31.08 
 
 		 692 aa  289  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2866  glycoside hydrolase family protein  34.91 
 
 		 736 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.988435 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1635  4-alpha-glucanotransferase  31.82 
 
 		 731 aa  288  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3127  4-alpha-glucanotransferase  33.53 
 
 		 692 aa  287  4e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0039  4-alpha-glucanotransferase  29.68 
 
 		 726 aa  286  5.999999999999999e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0297  4-alpha-glucanotransferase  30.16 
 
 		 694 aa  286  8e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128437  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2674  4-alpha-glucanotransferase  32.22 
 
 		 607 aa  286  8e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3614  4-alpha-glucanotransferase  30.16 
 
 		 694 aa  286  9e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0297  4-alpha-glucanotransferase  30.16 
 
 		 694 aa  286  9e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000311021  normal  0.0613825 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3797  4-alpha-glucanotransferase  30.01 
 
 		 694 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4388  4-alpha-glucanotransferase  33.52 
 
 		 726 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373122 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03268  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  30.16 
 
 		 694 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000118056  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3892  4-alpha-glucanotransferase  30.01 
 
 		 694 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03220  hypothetical protein  30.16 
 
 		 694 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4162  4-alpha-glucanotransferase  34.24 
 
 		 650 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245713  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3697  4-alpha-glucanotransferase  30.01 
 
 		 694 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.451758 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4723  4-alpha-glucanotransferase  30.16 
 
 		 694 aa  282  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2938  4-alpha-glucanotransferase  33.81 
 
 		 664 aa  280  7e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3677  4-alpha-glucanotransferase  35.33 
 
 		 656 aa  280  8e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1822  4-alpha-glucanotransferase  34.81 
 
 		 689 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2451  putative 4-alpha-glucanotransferase  35.44 
 
 		 605 aa  277  5e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1114  4-alpha-glucanotransferase  36.42 
 
 		 605 aa  276  8e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.587609 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3651  4-alpha-glucanotransferase  33.78 
 
 		 689 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215305 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.42 
 
 		 1642 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1467  4-alpha-glucanotransferase  34.48 
 
 		 646 aa  273  6e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1791  4-alpha-glucanotransferase  33.33 
 
 		 689 aa  273  7e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.816513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1210  glycoside hydrolase family protein  32.97 
 
 		 663 aa  272  2e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24890  4-alpha-glucanotransferase  34.58 
 
 		 691 aa  271  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829974  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6321  putative 4-alpha-glucanotransferase  31.56 
 
 		 650 aa  271  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0986  4-alpha-glucanotransferase  30.29 
 
 		 724 aa  270  7e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0154961 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2166  4-alpha-glucanotransferase  30.63 
 
 		 761 aa  270  7e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5398  4-alpha-glucanotransferase  34.51 
 
 		 630 aa  269  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229574  hitchhiker  0.00287392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4052  4-alpha-glucanotransferase  33.04 
 
 		 689 aa  269  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0545  4-alpha-glucanotransferase  31.77 
 
 		 669 aa  266  5.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.650062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.09 
 
 		 1646 aa  264  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.09 
 
 		 1646 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2547  4-alpha-glucanotransferase  31.01 
 
 		 692 aa  261  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6325  4-alpha-glucanotransferase  34.07 
 
 		 743 aa  261  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372498  normal  0.027515 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3143  4-alpha-glucanotransferase  33.73 
 
 		 682 aa  261  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113205  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5486  4-alpha-glucanotransferase  35.98 
 
 		 736 aa  260  6e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.259622  hitchhiker  0.00166664 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>