More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3871 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 433 aa  849    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  38.31 
 
 		 427 aa  237  4e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  33.59 
 
 		 420 aa  179  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  29.98 
 
 		 417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  32.91 
 
 		 430 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4665  hypothetical protein  31.05 
 
 		 445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0402536 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5360  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 430 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.261806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 426 aa  107  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4322  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 418 aa  104  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369395  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 425 aa  104  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 405 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 405 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1744  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 		 436 aa  100  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 431 aa  95.5  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 		 441 aa  93.2  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  29.66 
 
 		 429 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  30.1 
 
 		 417 aa  92  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 		 411 aa  91.3  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7174  major facilitator superfamily MFS_1  35.38 
 
 		 428 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 438 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 447 aa  87  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  27.02 
 
 		 424 aa  86.7  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 426 aa  86.3  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 416 aa  85.9  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 		 451 aa  84  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 433 aa  83.2  0.000000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 436 aa  83.2  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  28.02 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 442 aa  81.3  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  21.6 
 
 		 403 aa  80.9  0.00000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  25.77 
 
 		 418 aa  80.5  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 426 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 418 aa  79  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 405 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 		 450 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 440 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  24.41 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  24.21 
 
 		 1833 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2234  H+ antiporter protein  27.49 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 		 441 aa  75.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 435 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  24.01 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 432 aa  73.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 		 499 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  23.4 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 474 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  25.25 
 
 		 446 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3103  major facilitator superfamily MFS_1  24.36 
 
 		 434 aa  73.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00979206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3019  major facilitator superfamily MFS_1  24.36 
 
 		 434 aa  73.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  22.11 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24170  arabinose efflux permease family protein  25.71 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.917707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  23.92 
 
 		 436 aa  73.2  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4653  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 438 aa  73.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  22.97 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  30.11 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  30.11 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 456 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2668  protein of unknown function DUF894, DitE  29.2 
 
 		 541 aa  73.2  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 422 aa  72.4  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 451 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 410 aa  72  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  24.75 
 
 		 430 aa  72  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  25.93 
 
 		 405 aa  72  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 		 432 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 444 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25090  Major facilitator superfamily transporter  27.7 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2009  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0610699  normal  0.51216 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  23.1 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  29.83 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  29.83 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  29.83 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  29.83 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  22.84 
 
 		 406 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 439 aa  69.7  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  22.08 
 
 		 406 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0210  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 476 aa  69.3  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 417 aa  69.7  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2407  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 		 437 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0245013  normal  0.811162 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2384  protein of unknown function DUF894 DitE  28.41 
 
 		 549 aa  69.3  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123744  normal  0.932575 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  22.41 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>