208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3775 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3775  ribonuclease BN  100 
 
 		 356 aa  718    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00242423  normal  0.45335 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0518  ribonuclease BN  75 
 
 		 298 aa  369  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24410  predicted membrane protein  48.01 
 
 		 402 aa  236  3e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1838  ribonuclease BN  47.22 
 
 		 404 aa  228  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0195892  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1501  ribonuclease BN  47.1 
 
 		 431 aa  226  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.639318  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2180  ribonuclease BN  42.54 
 
 		 321 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2226  ribonuclease BN  42.54 
 
 		 321 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2169  ribonuclease BN  42.54 
 
 		 321 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000149157  hitchhiker  0.00191818 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3495  ribonuclease BN  43.43 
 
 		 342 aa  216  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.385493 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3945  ribonuclease BN  44 
 
 		 323 aa  216  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1249  ribonuclease BN  40.67 
 
 		 360 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00563624  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2241  ribonuclease BN  43.2 
 
 		 426 aa  213  5.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2454  ribonuclease BN  43.67 
 
 		 344 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458983 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1038  ribonuclease BN  43.43 
 
 		 355 aa  209  5e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3555  ribonuclease BN  39.34 
 
 		 354 aa  199  6e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.862191  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12721  hypothetical protein  41.95 
 
 		 324 aa  189  9e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.662031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2354  ribonuclease BN  31.02 
 
 		 327 aa  149  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6692  membrane protein-like protein  33.7 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.291028 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2813  ribonuclease BN  31 
 
 		 336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.934919 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1789  ribonuclease BN  30.9 
 
 		 300 aa  126  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00331025  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1751  ribonuclease BN  32.01 
 
 		 355 aa  119  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.807347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3072  ribonuclease BN  31.25 
 
 		 361 aa  116  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1887  hypothetical protein  29.91 
 
 		 433 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.321613  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  29.56 
 
 		 331 aa  98.6  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  26.54 
 
 		 414 aa  93.6  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  26.17 
 
 		 341 aa  93.6  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  28.85 
 
 		 392 aa  92  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  26.94 
 
 		 374 aa  90.9  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  23.51 
 
 		 321 aa  90.5  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  30.77 
 
 		 313 aa  89.4  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  24.67 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  26.76 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  25 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  26.92 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  25.67 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  24.09 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2494  ribonuclease BN  25.36 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12214  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  23.99 
 
 		 283 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  24.06 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  20.8 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  24.35 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  27.16 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  24.75 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  24.72 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  26.88 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  25.89 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  25.18 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  25.47 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  25.61 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  24.44 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  24.23 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4883  ribonuclease BN  23.47 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  26.95 
 
 		 445 aa  73.2  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3484  ribonuclease BN  22.87 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  23.91 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  27.41 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  24.29 
 
 		 356 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19220  predicted membrane protein  21.92 
 
 		 463 aa  72  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.234203  normal  0.518782 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  29.22 
 
 		 289 aa  72.4  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  27.59 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0750  ribonuclease BN  22.87 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  24.28 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  24.69 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  23.47 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  24.08 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  24.53 
 
 		 349 aa  69.3  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  23.23 
 
 		 288 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  23.1 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  24.03 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  23.23 
 
 		 288 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  22.59 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  24.35 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  23.9 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  22.46 
 
 		 359 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  26.27 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  25.08 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3558  ribonuclease BN, putative  25.12 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  23.99 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  24.37 
 
 		 386 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  24.92 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  24.91 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0036  putative ribonuclease BN  27.21 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1937  putative ribonuclease BN  25.91 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.666523  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1971  putative ribonuclease BN  25.91 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.493707  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  23.61 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  25 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5015  ribonuclease BN  24.51 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778134  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  22.87 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  22.87 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  22.87 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  22.87 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  22.87 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  22.87 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  24.54 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  22.55 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  26.5 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  24.75 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  26 
 
 		 373 aa  63.2  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  25.16 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  25.16 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>