More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2837 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2837  Peptidase M23  100 
 
 
424 aa  841    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000204146  normal  0.0350761 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3898  Peptidase M23  38.34 
 
 
442 aa  233  6e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0247447  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2536  Peptidase M23  37.71 
 
 
413 aa  213  3.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4198  peptidase M23B  34.92 
 
 
398 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.354904 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2320  hypothetical protein  30.56 
 
 
399 aa  170  4e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0377  Peptidase M23  38.06 
 
 
409 aa  168  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2463  hypothetical protein  31.1 
 
 
399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1743  peptidase M23B  42.22 
 
 
404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127789  normal  0.162626 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2794  hypothetical protein  32.26 
 
 
360 aa  134  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220092  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1745  peptidase M23B  30.59 
 
 
365 aa  109  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0803102  normal  0.1621 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2205  Peptidase M23  41.79 
 
 
295 aa  97.8  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000288171  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0268  Peptidase M23  27.9 
 
 
303 aa  96.7  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.839567 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2926  Peptidase M23  35.75 
 
 
502 aa  94  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.902001  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1538  Peptidase M23  28.24 
 
 
362 aa  93.6  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000553648 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12860  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.04 
 
 
281 aa  88.6  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2234  peptidase M23B  34.87 
 
 
307 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  hitchhiker  0.000684677 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2599  peptidase M23  36.05 
 
 
251 aa  85.5  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1320  hypothetical protein  32.18 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0711  Peptidase M23  33.33 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.324034 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3404  Peptidase M23  36.8 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3591  peptidase M23B  35.38 
 
 
302 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27670  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.75 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5323  M24/M37 family peptidase  38.32 
 
 
298 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5370  peptidase M23B  38.32 
 
 
298 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5231  peptidase M23B  38.32 
 
 
298 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.347786  normal  0.103229 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2233  peptidase M23B  30.07 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.467623  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2272  peptidase M23B  30.07 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0942  peptidase M23B  37.5 
 
 
321 aa  69.3  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0501696  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3642  Peptidase M23  31.45 
 
 
339 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1872  peptidase, M23/M37 family  35.25 
 
 
187 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.917362  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0185  peptidase M23B  44.44 
 
 
298 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48550  peptidase M23B family protein  36.79 
 
 
319 aa  66.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5035  peptidase M23B  40 
 
 
300 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5480  peptidase, M23/M37 family  39 
 
 
268 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1987  peptidase, M23/M37 family  34.43 
 
 
286 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.431203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1691  cell wall endopeptidase  33.87 
 
 
286 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1958  M24/M37 family peptidase  34.43 
 
 
286 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.186178  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  50.88 
 
 
414 aa  63.5  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1914  peptidase, M23/M37 family  36.84 
 
 
286 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000487 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1717  cell wall endopeptidase  36.84 
 
 
286 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.402348  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0151  peptidase M23B  43.24 
 
 
300 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01679  peptidase  34.27 
 
 
281 aa  62.8  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3471  peptidase, M23/M37 family  33.61 
 
 
234 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0239412  hitchhiker  0.000000108931 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5609  peptidase M23B  43.84 
 
 
298 aa  62  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1660  peptidase M23B  37.36 
 
 
348 aa  62  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.190766  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1742  M24/M37 family peptidase  32.26 
 
 
286 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1879  M23/37 family peptidase  32.26 
 
 
262 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  49.12 
 
 
377 aa  61.2  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  51.79 
 
 
464 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1475  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.44 
 
 
309 aa  60.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  36.73 
 
 
482 aa  60.5  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05623  hypothetical protein  32.79 
 
 
328 aa  59.7  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  43.94 
 
 
490 aa  59.3  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1148  phage-associated peptidase  37.63 
 
 
979 aa  59.3  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.602861  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0696  Peptidase M23  49.15 
 
 
487 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3225  peptidase M23B  43.75 
 
 
443 aa  58.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.755339  normal  0.375504 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4572  peptidase M23B  35.29 
 
 
995 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109216  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1761  hypothetical protein  47.46 
 
 
929 aa  58.2  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1916  peptidase M23  34.44 
 
 
290 aa  58.2  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.636111  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0115  Peptidase M23  40 
 
 
334 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  46.43 
 
 
569 aa  57.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1987  peptidase  34.44 
 
 
290 aa  57.8  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  46.43 
 
 
362 aa  57.4  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  48.21 
 
 
343 aa  57  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6142  hypothetical protein  43.06 
 
 
299 aa  57  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  48.21 
 
 
262 aa  57  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70780  hypothetical protein  43.06 
 
 
299 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.848669 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5760  peptidase M23B  39.29 
 
 
443 aa  56.2  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  42.11 
 
 
533 aa  56.2  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  41.54 
 
 
423 aa  55.8  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  45.61 
 
 
287 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2450  peptidase M23B  42.42 
 
 
428 aa  56.2  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3571  M23 peptidase domain protein  39.29 
 
 
441 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1462  peptidase M23B  38.64 
 
 
111 aa  55.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0490484  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2441  Peptidase M23  32.12 
 
 
735 aa  55.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00201295  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  42.86 
 
 
412 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  27.54 
 
 
524 aa  55.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  43.86 
 
 
253 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  43.86 
 
 
676 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  43.86 
 
 
681 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  42.86 
 
 
400 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  48.21 
 
 
313 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1351  Peptidase M23  37.5 
 
 
467 aa  54.7  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.749113  hitchhiker  0.00315116 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  42.86 
 
 
425 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  42.86 
 
 
421 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000457  peptidase M23  34.67 
 
 
325 aa  54.7  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0013  Peptidase M23  31.68 
 
 
284 aa  54.7  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.958477  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  47.46 
 
 
441 aa  54.7  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  36.71 
 
 
274 aa  54.7  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  42.86 
 
 
425 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  42.86 
 
 
421 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  32.97 
 
 
498 aa  54.3  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  42.86 
 
 
420 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  42.11 
 
 
651 aa  54.3  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  40.35 
 
 
417 aa  54.3  0.000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  46.3 
 
 
255 aa  54.7  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0261  M23 peptidase domain protein  32.69 
 
 
314 aa  54.3  0.000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0566048  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  44.29 
 
 
412 aa  54.3  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  47.46 
 
 
431 aa  54.3  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  41.27 
 
 
388 aa  54.3  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>