150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2752 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2752  integrase domain protein SAM domain protein  100 
 
 		 362 aa  711    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00014768  normal  0.023237 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2185  integrase family protein  40.11 
 
 		 413 aa  163  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0291516  hitchhiker  0.00000847111 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2995  integrase family protein  34.12 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.941848  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0918  integrase family protein  36.34 
 
 		 329 aa  153  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512331  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4297  integrase family protein  34.99 
 
 		 394 aa  151  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2304  phage integrase  37.29 
 
 		 362 aa  130  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0327568  normal  0.0181167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4157  integrase domain-containing protein  37.14 
 
 		 366 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118927  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1908  phage integrase family protein  35.33 
 
 		 338 aa  126  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.454202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6146  integrase family protein  30.49 
 
 		 311 aa  123  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4680  integrase family protein  33.63 
 
 		 346 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3359  integrase family protein  38.83 
 
 		 307 aa  119  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6972  integrase family protein  29.91 
 
 		 329 aa  116  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0164563  normal  0.0336098 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4367  phage integrase family protein  31.79 
 
 		 335 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2466  integrase family protein  34.6 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0580014  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4316  phage integrase family protein  31.63 
 
 		 340 aa  110  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3968  phage integrase family protein  30.15 
 
 		 347 aa  109  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1553  putative integrase/recombinase  32.68 
 
 		 343 aa  107  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2870  integrase family protein  33.95 
 
 		 322 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00943332  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0008  DNA integration/recombination/inversion protein  29.23 
 
 		 314 aa  103  5e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.856285  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1996  phage integrase family protein  26.93 
 
 		 369 aa  102  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4579  phage integrase  29.86 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.18624  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6280  integrase family protein  33.33 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1943  phage integrase family protein  26.93 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171548  normal  0.0940691 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2033  phage integrase family protein  26.35 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6851  integrase family protein  29.29 
 
 		 323 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100628  normal  0.271303 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1962  AP endonuclease  30.75 
 
 		 326 aa  100  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1698  Phage integrase  31.71 
 
 		 328 aa  99.4  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4358  phage integrase  29.86 
 
 		 408 aa  99  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2244  phage integrase family protein  25.21 
 
 		 380 aa  98.6  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.111867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9008  phage integrase family protein  29.41 
 
 		 377 aa  98.6  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02951  Phage integrase  31.52 
 
 		 336 aa  97.8  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2382  integrase family protein  25.07 
 
 		 354 aa  95.9  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0941885  normal  0.501513 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2082  integrase family protein  26.97 
 
 		 371 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.024543  hitchhiker  0.000210845 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1382  Phage integrase  30.03 
 
 		 335 aa  95.1  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2094  integrase family protein  25.36 
 
 		 400 aa  94.7  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000349759  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2380  phage integrase family protein  26.69 
 
 		 371 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.503709  normal  0.032696 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3751  integrase family protein  31.23 
 
 		 369 aa  94.4  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542126  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2384  phage integrase family site specific recombinase  26.15 
 
 		 369 aa  93.2  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2263  phage integrase family protein  26.4 
 
 		 371 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00650578  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2480  integrase family protein  31.16 
 
 		 354 aa  91.3  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.608661 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4195  phage integrase  28.99 
 
 		 408 aa  90.9  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0564405  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4027  integrase family protein  28.9 
 
 		 372 aa  90.9  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.461361  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4511  phage integrase  30.28 
 
 		 369 aa  89  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.694348  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8006  integrase protein  28.73 
 
 		 378 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7008  phage integrase family protein  29.23 
 
 		 387 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4792  integrase family protein  30.14 
 
 		 363 aa  87.4  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00356022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4548  phage integrase  28.41 
 
 		 421 aa  86.3  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.832393  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2092  phage integrase family protein  27.73 
 
 		 406 aa  85.9  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4576  phage integrase  28.74 
 
 		 357 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4820  phage integrase family protein  29.02 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5281  integrase family protein  28.49 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1640  integrase family protein  28.49 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2249  phage integrase family protein  27.79 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5342  putative cointegrate resolution protein S / recombinase  33.01 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2680  integrase family protein  27.79 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2926  Phage integrase  28.15 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0537176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3277  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  31.1 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3434  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  31.1 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0046  putative integrase  32.45 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2105  integrase family protein  28.27 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4239  hypothetical protein  33.18 
 
 		 365 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0653636  normal  0.519885 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2392  integrase family protein  28.27 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0530338  normal  0.472164 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3181  phage integrase family site specific recombinase  27.96 
 
 		 316 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3780  integrase family protein  30.16 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.325182  normal  0.557184 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2535  phage integrase family protein  27.96 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25710  cointegrate resolution protein S  29.34 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2669  integrase family protein  27.49 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.261954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1987  phage integrase family protein  25.87 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2981  Tn4652, cointegrate resolution protein S  31.36 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0457753 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1883  site-specific recombinase XerD-like  29.89 
 
 		 649 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2511  phage integrase  27.24 
 
 		 448 aa  70.5  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35820  cointegrate resolution protein S  31.4 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000225241  decreased coverage  6.17783e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3058  cointegrate resolution protein S  31.4 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2276  integrase family protein  26.95 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00370914  hitchhiker  0.000967634 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0031  DNA integration/recombination/inversion protein  31.71 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.976428  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2261  phage integrase  28.57 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.245925  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9510  phage-related integrase  25.84 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0464246  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3724  hypothetical protein  30.93 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000891408  normal  0.48751 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4516  phage integrase  24.87 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8481  integrase family protein  30.65 
 
 		 353 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383754  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7902  integrase family protein  30.65 
 
 		 353 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.356547  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5150  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  32.39 
 
 		 399 aa  59.7  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6128  integrase family protein  29.1 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5646  integrase family protein  29.63 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.575287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5431  phage integrase family protein  25.66 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3964  phage integrase family protein  23.62 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00221994  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  34.73 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  30.13 
 
 		 305 aa  57  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  30 
 
 		 308 aa  53.9  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  28.75 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1804  integrase family protein  28.42 
 
 		 401 aa  52  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000010936 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3773  integrase family protein  27.65 
 
 		 390 aa  52.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.91 
 
 		 296 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  29.14 
 
 		 302 aa  51.2  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00624  cointegrase  26.09 
 
 		 322 aa  50.8  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.281729  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1326  integrase family protein  24.48 
 
 		 309 aa  49.7  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.847423  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5471  integrase family protein  27.27 
 
 		 382 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  24.61 
 
 		 311 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1972  integrase family protein  28.17 
 
 		 359 aa  48.5  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.713568  normal  0.0793814 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  32.89 
 
 		 311 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>