147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1952 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1952  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  100 
 
 		 391 aa  792    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.383383  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0440  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  70.1 
 
 		 392 aa  507  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0642  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  66.41 
 
 		 386 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0028  hypothetical protein  52.17 
 
 		 280 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0595  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  50 
 
 		 415 aa  144  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3335  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  50.36 
 
 		 579 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0392  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  44.13 
 
 		 484 aa  136  7.000000000000001e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0997  NLP/P60 protein  52.98 
 
 		 669 aa  136  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1636  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  40.32 
 
 		 407 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0587  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  51.88 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.383257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3081  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  47.69 
 
 		 410 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1895  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  45.19 
 
 		 449 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0084  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  45.04 
 
 		 722 aa  120  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.334729  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0901  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  44.36 
 
 		 350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  47.69 
 
 		 669 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0109  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  48.62 
 
 		 396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21560  SH3 domain-containing protein  40 
 
 		 442 aa  113  4.0000000000000004e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0436482  hitchhiker  0.000261973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8657  hypothetical protein  43.85 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3194  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  44.62 
 
 		 358 aa  106  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0583  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  38.82 
 
 		 334 aa  103  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146091  hitchhiker  0.000670558 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2520  hydrophobic protein  41.54 
 
 		 461 aa  103  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.534739  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0368  hypothetical protein  42.86 
 
 		 368 aa  103  8e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.912382  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2374  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  40.46 
 
 		 495 aa  102  8e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  41.1 
 
 		 383 aa  101  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2482  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  38.46 
 
 		 447 aa  99.8  7e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2275  hypothetical protein  38.36 
 
 		 282 aa  99.4  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329742  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09610  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  52.48 
 
 		 294 aa  98.2  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.340149  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0812  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  41.22 
 
 		 432 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130702 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2128  hypothetical protein  38.36 
 
 		 295 aa  97.4  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400478  hitchhiker  0.00659313 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4092  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  40.48 
 
 		 368 aa  94.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.240127 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2395  hypothetical protein  41.61 
 
 		 261 aa  91.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2543  hypothetical protein  40.88 
 
 		 275 aa  91.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.578338  decreased coverage  0.00000438668 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1224  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  39.53 
 
 		 285 aa  90.5  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5428  Peptidase M23  39.62 
 
 		 349 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1799  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  43.3 
 
 		 558 aa  84.7  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0487  Peptidase M23  33.92 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22690  SH3 domain-containing protein  37.5 
 
 		 447 aa  84  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4302  hypothetical protein  35.4 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.628164 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2807  hypothetical protein  36.42 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0224369  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0633  Co/Zn/Cd efflux system component  31.75 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0706968  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1141  hypothetical protein  33.68 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.617877  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4302  peptidase M23B  37.42 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.416455  normal  0.37822 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4522  hypothetical protein  32.5 
 
 		 275 aa  79  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.594874 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3901  hypothetical protein  30.46 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0140637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0704  hypothetical protein  34.95 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1845  hypothetical protein  36.84 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.661954  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4566  hypothetical protein  35.51 
 
 		 203 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.252363 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1090  hypothetical protein  43.24 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.018463  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2527  hypothetical protein  35.14 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000287689 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1170  hypothetical protein  30.13 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379591  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8432  hypothetical protein  29.61 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.774825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1977  hypothetical protein  35.34 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2319  hypothetical protein  35.34 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229041  normal  0.0161406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3471  hypothetical protein  35.34 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2042  hypothetical protein  35.34 
 
 		 194 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3348  hypothetical protein  35.34 
 
 		 194 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.372059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0493  hypothetical protein  28.65 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.580154  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0072  hypothetical protein  34.06 
 
 		 200 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.736738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2417  hypothetical protein  34.06 
 
 		 194 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0954159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4738  peptidase M23B  34.91 
 
 		 388 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208513 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2185  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  33.12 
 
 		 279 aa  72  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.585027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0974  hypothetical protein  32.43 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2985  hypothetical protein  34.59 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3999  hypothetical protein  34.59 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4187  hypothetical protein  34.59 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  27.4 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3460  hypothetical protein  26.91 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1131  hypothetical protein  56.14 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5084  hypothetical protein  33.83 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000555714 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  30.52 
 
 		 437 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  30.52 
 
 		 437 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35520  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  39.26 
 
 		 196 aa  68.9  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.423821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  28.86 
 
 		 320 aa  69.3  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2414  hypothetical protein  33.83 
 
 		 203 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.291745 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3850  hypothetical protein  33.83 
 
 		 194 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  31.21 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0244  hypothetical protein  33.83 
 
 		 192 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2996  hypothetical protein  33.83 
 
 		 194 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3211  hypothetical protein  33.83 
 
 		 193 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3840  hypothetical protein  31.03 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25980  hypothetical protein  31.58 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7951  hypothetical protein  40.96 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3025  hypothetical protein  33.97 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144373  normal  0.932008 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1961  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  31.03 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4580  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  31.65 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1380  FG-GAP repeat-containing protein  33.77 
 
 		 514 aa  63.5  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  28.57 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  28.37 
 
 		 547 aa  61.6  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0123  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  35.77 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.172255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3580  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  28.09 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0996  hypothetical protein  43.06 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.8 
 
 		 554 aa  60.5  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3438  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  28.49 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425893 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4510  CHAP domain-containing protein  30.95 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11160  hypothetical protein  33.62 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  28.92 
 
 		 1048 aa  57.4  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3442  Peptidase M23  27 
 
 		 546 aa  55.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1573  peptidase M23B  38.46 
 
 		 348 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0724492  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4183  CHAP domain-containing protein  29.52 
 
 		 358 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1672  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  28.37 
 
 		 241 aa  50.8  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>