57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4781 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4781  GreA/GreB family elongation factor  100 
 
 		 159 aa  323  7e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.830945 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1945  GreA/GreB family elongation factor  72.19 
 
 		 157 aa  228  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.817259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5236  GreA/GreB family elongation factor  54.19 
 
 		 153 aa  150  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5324  GreA/GreB family elongation factor  54.19 
 
 		 153 aa  150  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5616  GreA/GreB family elongation factor  54.19 
 
 		 153 aa  150  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3597  GreA/GreB family elongation factor  52.29 
 
 		 155 aa  130  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0995544  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31810  transcription elongation factor GreA  45.1 
 
 		 172 aa  107  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.58029 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4418  transcription elongation factor GreA  39.13 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1887  transcription elongation factor GreA  50.52 
 
 		 162 aa  97.1  9e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.559588 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0707  transcription elongation factor GreA  41.1 
 
 		 162 aa  96.3  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4668  transcription elongation factor GreA  40.65 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741319 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3148  transcription elongation factor GreA  37.65 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0838733  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1239  transcription elongation factor GreA  39.63 
 
 		 164 aa  95.1  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243493 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11098  transcription elongation factor GreA  38.89 
 
 		 164 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759427  normal  0.450066 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4375  transcription elongation factor GreA  40.65 
 
 		 164 aa  95.5  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.366203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4219  transcription elongation factor GreA  40.65 
 
 		 164 aa  95.5  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4144  transcription elongation factor GreA  40.65 
 
 		 164 aa  95.5  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0426558  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2048  transcription elongation factor GreA  40.12 
 
 		 164 aa  95.1  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148142  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1167  GreA/GreB family elongation factor  39.62 
 
 		 164 aa  94.7  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440534  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4879  GreA/GreB family elongation factor  41.06 
 
 		 162 aa  94  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1636  transcription elongation factor GreA  36.42 
 
 		 164 aa  91.7  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3096  transcription elongation factor GreA  36.55 
 
 		 167 aa  88.2  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289834 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1076  transcription elongation factor GreA  45.92 
 
 		 160 aa  87.4  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0980  transcription elongation factor GreA  37.11 
 
 		 167 aa  86.3  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0668  transcription elongation factor GreA  47.96 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08210  transcription elongation factor  35.93 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.029534 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1893  transcription elongation factor GreA  37.42 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3904  GreA/GreB family elongation factor  42.27 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0764375  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0094  GreA/GreB family elongation factor  33.33 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.351516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07260  transcription elongation factor  42.42 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23090  transcription elongation factor GreA  35.62 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0923  transcription elongation factor GreA  36.54 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212607  normal  0.453288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1064  transcription elongation factor GreA  39.18 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0940  transcription elongation factor GreA  35.71 
 
 		 167 aa  72  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0866  transcription elongation factor GreA  37.01 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2635  GreA/GreB family elongation factor  36.14 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0447  transcription elongation factor GreA  30.13 
 
 		 167 aa  70.5  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0940  GreA/GreB family elongation factor  36.02 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8535  GreA/GreB family elongation factor  35.05 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0726  transcription elongation factor GreA  41.41 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05080  transcription elongation factor GreA  32.72 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.543117  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0824  transcription elongation factor GreA  36.63 
 
 		 161 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364949  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1099  transcription elongation factor GreA  39.39 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225388  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1535  GreA/GreB family elongation factor  35.51 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  30.26 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0768  transcription elongation factor  37.5 
 
 		 159 aa  47  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471261  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  28.39 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  28.1 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3748  transcription elongation factor GreA  27.97 
 
 		 156 aa  44.7  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2221  transcription elongation factor GreA  28.47 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  30.43 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  31.58 
 
 		 157 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0339  GreA/GreB family elongation factor  37.63 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.460322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  31.52 
 
 		 157 aa  41.6  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  26.39 
 
 		 171 aa  40.8  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2743  GreA/GreB family elongation factor  36.9 
 
 		 152 aa  40.8  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00755708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08470  nucleoside diphosphate kinase regulator  28.06 
 
 		 154 aa  40.4  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>