More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3594 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2913  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  63.55 
 
 
1067 aa  1156    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511883  normal  0.352036 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  100 
 
 
1056 aa  2039    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  41.19 
 
 
1949 aa  243  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.81 
 
 
1063 aa  229  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1718  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.17 
 
 
777 aa  188  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4744  putative outer membrane adhesin like protein  47.04 
 
 
666 aa  177  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511214  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  35.1 
 
 
3927 aa  173  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1009  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.42 
 
 
802 aa  164  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0847  putative outer membrane adhesin like protein  41.78 
 
 
567 aa  163  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189392  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  33.33 
 
 
2377 aa  152  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  36.84 
 
 
1667 aa  145  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.41 
 
 
689 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.14 
 
 
1884 aa  141  7.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  34.34 
 
 
354 aa  140  8.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  38.11 
 
 
580 aa  137  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  39.42 
 
 
353 aa  135  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  37 
 
 
335 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  28.6 
 
 
1597 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  41.85 
 
 
354 aa  126  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  30.12 
 
 
1867 aa  125  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  38.08 
 
 
354 aa  125  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  37.54 
 
 
457 aa  124  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  34.95 
 
 
391 aa  122  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  34.92 
 
 
1094 aa  122  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.47 
 
 
366 aa  121  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4736  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.77 
 
 
1433 aa  116  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159607 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  34.52 
 
 
387 aa  112  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  34.52 
 
 
332 aa  111  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1597  hypothetical protein  36.28 
 
 
898 aa  110  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.489596 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.99 
 
 
752 aa  110  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5004  hypothetical protein  41.96 
 
 
1039 aa  107  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.69 
 
 
2507 aa  106  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  34.32 
 
 
810 aa  105  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  32.8 
 
 
819 aa  105  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.21 
 
 
317 aa  105  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.43 
 
 
312 aa  102  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.71 
 
 
415 aa  100  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  28.88 
 
 
892 aa  99  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.97 
 
 
517 aa  96.3  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  32.61 
 
 
479 aa  95.1  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  37.2 
 
 
971 aa  94.7  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1882  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.55 
 
 
383 aa  95.1  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.69 
 
 
1553 aa  92  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0102  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  47.06 
 
 
154 aa  92  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  28.47 
 
 
329 aa  90.1  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.79 
 
 
607 aa  90.1  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.52 
 
 
328 aa  89.4  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.27 
 
 
850 aa  89.7  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  44.88 
 
 
272 aa  89  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.47 
 
 
329 aa  89  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  27.97 
 
 
5745 aa  89  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  29.08 
 
 
329 aa  89  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.34 
 
 
335 aa  88.6  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1813  hypothetical protein  35.51 
 
 
306 aa  88.2  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.76 
 
 
329 aa  87.8  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0103  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  44.37 
 
 
192 aa  87.8  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  32.35 
 
 
1189 aa  87  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3145  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.67 
 
 
327 aa  86.7  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.62 
 
 
362 aa  87  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  27.18 
 
 
1512 aa  85.9  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.63 
 
 
366 aa  85.1  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.87 
 
 
327 aa  84.7  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3263  hypothetical protein  29.71 
 
 
487 aa  84.7  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000325549  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.27 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2380  hypothetical protein  28.63 
 
 
250 aa  84  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4611  hypothetical protein  30.3 
 
 
346 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  27.29 
 
 
2839 aa  83.6  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.33 
 
 
994 aa  83.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.69 
 
 
1170 aa  84  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1477  hypothetical protein  30.3 
 
 
330 aa  82.8  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.940326 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4136  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.49 
 
 
345 aa  82.8  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0910022  normal  0.508786 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.92 
 
 
347 aa  83.2  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.35 
 
 
332 aa  82.4  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.87 
 
 
328 aa  82.4  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  32.55 
 
 
776 aa  82  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.17 
 
 
329 aa  82  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.17 
 
 
328 aa  81.6  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.3 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.17 
 
 
328 aa  81.6  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  28.23 
 
 
4978 aa  80.5  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5316  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.62 
 
 
330 aa  80.9  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.05 
 
 
334 aa  80.5  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2182  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.52 
 
 
328 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5265  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.08 
 
 
327 aa  79.3  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.23 
 
 
324 aa  79  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.52 
 
 
348 aa  79  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.54 
 
 
324 aa  79  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.69 
 
 
323 aa  79  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.18 
 
 
362 aa  78.6  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.49 
 
 
348 aa  78.6  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  25.45 
 
 
3439 aa  78.2  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0690  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.89 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0314651  normal  0.511949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5946  hypothetical protein  28.52 
 
 
335 aa  77.8  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  26.5 
 
 
2784 aa  76.6  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0577  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.94 
 
 
652 aa  77  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.01 
 
 
320 aa  76.6  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3045  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.62 
 
 
313 aa  76.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  32.51 
 
 
556 aa  76.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  30.6 
 
 
1269 aa  75.5  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3803  hypothetical protein  33.55 
 
 
1181 aa  75.9  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>