More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1477 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4611  hypothetical protein  99.7 
 
 
346 aa  649    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1477  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  654    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.940326 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5265  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  62.29 
 
 
327 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  35.04 
 
 
335 aa  140  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  35.02 
 
 
1094 aa  138  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  33.92 
 
 
1667 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  34.4 
 
 
580 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  33.33 
 
 
354 aa  126  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.7 
 
 
689 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  33.33 
 
 
391 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  33.33 
 
 
354 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  33.85 
 
 
353 aa  123  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  37.45 
 
 
819 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.08 
 
 
366 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  31.73 
 
 
354 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  32.5 
 
 
479 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.48 
 
 
317 aa  112  6e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  34.26 
 
 
810 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.2 
 
 
457 aa  109  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1882  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.68 
 
 
383 aa  106  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.89 
 
 
366 aa  106  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.64 
 
 
320 aa  106  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.33 
 
 
329 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.85 
 
 
1170 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  33.11 
 
 
971 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.15 
 
 
310 aa  103  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  33.82 
 
 
272 aa  102  8e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.11 
 
 
348 aa  102  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  32.61 
 
 
556 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.03 
 
 
328 aa  101  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.94 
 
 
406 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3045  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.43 
 
 
313 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.65 
 
 
752 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2611  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.15 
 
 
328 aa  99.8  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  30.23 
 
 
776 aa  98.2  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.28 
 
 
328 aa  97.8  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.09 
 
 
347 aa  98.2  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  33.89 
 
 
387 aa  97.1  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1750  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35.85 
 
 
451 aa  97.1  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000566962  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.88 
 
 
415 aa  95.5  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3145  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.8 
 
 
327 aa  95.5  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.28 
 
 
335 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.48 
 
 
348 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.77 
 
 
607 aa  94.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.93 
 
 
338 aa  94.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  31.11 
 
 
1189 aa  93.2  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  32.88 
 
 
332 aa  92.8  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1838  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.53 
 
 
366 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1470  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.96 
 
 
479 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00488394  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.48 
 
 
312 aa  90.5  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4136  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.69 
 
 
345 aa  90.5  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0910022  normal  0.508786 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2728  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.66 
 
 
318 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171718  normal  0.304342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  29.52 
 
 
314 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0690  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.61 
 
 
318 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0314651  normal  0.511949 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.88 
 
 
348 aa  90.1  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  29.38 
 
 
377 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2173  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.17 
 
 
366 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3263  hypothetical protein  33.05 
 
 
487 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000325549  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.55 
 
 
334 aa  88.6  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1789  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.53 
 
 
336 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2380  hypothetical protein  29.02 
 
 
250 aa  87.4  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.11 
 
 
332 aa  87.4  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1940  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.93 
 
 
320 aa  87.8  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.38 
 
 
340 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.38 
 
 
340 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.38 
 
 
340 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4977  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.03 
 
 
336 aa  87  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370165  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.66 
 
 
323 aa  87  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2259  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.22 
 
 
326 aa  86.3  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.669403  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5324  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.51 
 
 
311 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3937  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.72 
 
 
334 aa  86.3  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328417  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.13 
 
 
362 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.1 
 
 
324 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06180  YVTN family beta-propeller repeat protein  30.73 
 
 
408 aa  84.3  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.32 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.53 
 
 
327 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.1 
 
 
362 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5020  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.59 
 
 
311 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  26.43 
 
 
329 aa  83.6  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1813  hypothetical protein  30.22 
 
 
306 aa  84  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0577  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  34.18 
 
 
652 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.98 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2182  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.98 
 
 
328 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.34 
 
 
1056 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1892  hypothetical protein  25.77 
 
 
334 aa  83.2  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181009  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2583  hypothetical protein  25.71 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0721  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.87 
 
 
344 aa  83.2  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1241  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.71 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0330167  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.44 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5700  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.21 
 
 
362 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.851059  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0031  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.41 
 
 
328 aa  82.4  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.870241  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4199  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.16 
 
 
316 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13098  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.59 
 
 
328 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5316  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.3 
 
 
330 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3685  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.91 
 
 
384 aa  82  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.46 
 
 
417 aa  81.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1947  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.53 
 
 
321 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107167  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5321  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.21 
 
 
362 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5410  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.21 
 
 
362 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.186249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  26.3 
 
 
329 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>