260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3175 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1101  4-alpha-glucanotransferase  50.28 
 
 		 717 aa  659    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00817417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2899  4-alpha-glucanotransferase  73.18 
 
 		 719 aa  972    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24590  4-alpha-glucanotransferase  49.29 
 
 		 718 aa  649    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.686427  normal  0.585333 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3421  4-alpha-glucanotransferase  82.18 
 
 		 708 aa  1160    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1369  4-alpha-glucanotransferase  54.35 
 
 		 708 aa  677    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.613124  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2869  4-alpha-glucanotransferase  73.18 
 
 		 719 aa  972    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2633  4-alpha-glucanotransferase  51.18 
 
 		 733 aa  649    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.272173 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2153  4-alpha-glucanotransferase  51.21 
 
 		 717 aa  662    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362113  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4887  4-alpha-glucanotransferase  56.67 
 
 		 724 aa  782    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0478  4-alpha-glucanotransferase  51.06 
 
 		 730 aa  673    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2913  4-alpha-glucanotransferase  73.18 
 
 		 719 aa  972    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3175  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 		 730 aa  1463    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.682952  normal  0.0349305 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3529  4-alpha-glucanotransferase  53.62 
 
 		 712 aa  669    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00842103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11812  4-alpha-glucanotransferase malQ  67.6 
 
 		 724 aa  934    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.268573 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13220  4-alpha-glucanotransferase  51.19 
 
 		 717 aa  631  1e-179  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.133916  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2205  glycoside hydrolase family protein  48.31 
 
 		 702 aa  609  1e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1347  4-alpha-glucanotransferase  49.86 
 
 		 717 aa  593  1e-168  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451927  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3414  4-alpha-glucanotransferase  46.92 
 
 		 677 aa  585  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.723218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3533  4-alpha-glucanotransferase  47.87 
 
 		 721 aa  579  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1601  4-alpha-glucanotransferase  43.85 
 
 		 766 aa  535  1e-150  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1692  4-alpha-glucanotransferase  41.77 
 
 		 721 aa  520  1e-146  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1321  4-alpha-glucanotransferase  41.77 
 
 		 745 aa  520  1e-146  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1299  4-alpha-glucanotransferase  39.61 
 
 		 749 aa  499  1e-139  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5309  4-alpha-glucanotransferase  44.69 
 
 		 780 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.242878 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11750  4-alpha-glucanotransferase  43.15 
 
 		 1169 aa  492  1e-137  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0251  4-alpha-glucanotransferase  39.12 
 
 		 721 aa  488  1e-136  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1157  4-alpha-glucanotransferase  47.6 
 
 		 757 aa  469  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.337105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0996  4-alpha-glucanotransferase  43.55 
 
 		 660 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5116  4-alpha-glucanotransferase  48.18 
 
 		 692 aa  459  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.796514  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3093  4-alpha-glucanotransferase  44.86 
 
 		 610 aa  383  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601313  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.92 
 
 		 1715 aa  356  8.999999999999999e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.38 
 
 		 1730 aa  355  2e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  33.24 
 
 		 1464 aa  341  4e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.76 
 
 		 1703 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0233  4-alpha-glucanotransferase  37.06 
 
 		 717 aa  339  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.36 
 
 		 1673 aa  338  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1607  4-alpha-glucanotransferase  35.93 
 
 		 728 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.48 
 
 		 1642 aa  337  5e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0315  4-alpha-glucanotransferase  35.9 
 
 		 707 aa  324  3e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4231  glycoside hydrolase family protein  35.7 
 
 		 733 aa  324  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04850  4-alpha-glucanotransferase  32.97 
 
 		 726 aa  323  6e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0039  4-alpha-glucanotransferase  32.22 
 
 		 726 aa  322  9.999999999999999e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01251  4-alpha-glucanotransferase  30.28 
 
 		 732 aa  323  9.999999999999999e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0118  4-alpha-glucanotransferase  32.44 
 
 		 726 aa  322  1.9999999999999998e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001104  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  32.84 
 
 		 726 aa  321  3e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3927  4-alpha-glucanotransferase  33.77 
 
 		 694 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.79 
 
 		 1647 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6826  4-alpha-glucanotransferase  33.16 
 
 		 736 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2994  glycoside hydrolase family protein  33.57 
 
 		 692 aa  308  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10076  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1467  4-alpha-glucanotransferase  36.3 
 
 		 646 aa  307  5.0000000000000004e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3992  4-alpha-glucanotransferase  30.47 
 
 		 698 aa  306  7e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4120  4-alpha-glucanotransferase  34.28 
 
 		 694 aa  306  9.000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2547  4-alpha-glucanotransferase  32.49 
 
 		 692 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.39 
 
 		 1646 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0162  4-alpha-glucanotransferase  30.47 
 
 		 698 aa  306  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1635  4-alpha-glucanotransferase  31.42 
 
 		 731 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3751  4-alpha-glucanotransferase  30.19 
 
 		 698 aa  305  2.0000000000000002e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.99 
 
 		 1650 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.39 
 
 		 1646 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1822  4-alpha-glucanotransferase  33.1 
 
 		 689 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.81 
 
 		 1662 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4388  4-alpha-glucanotransferase  32.93 
 
 		 726 aa  303  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2365  4-alpha-glucanotransferase  28.8 
 
 		 732 aa  302  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.84762  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3934  4-alpha-glucanotransferase  32.93 
 
 		 760 aa  302  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4047  4-alpha-glucanotransferase  32.93 
 
 		 760 aa  302  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0890  4-alpha-glucanotransferase  32.06 
 
 		 699 aa  301  4e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.763251  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3829  4-alpha-glucanotransferase  30.46 
 
 		 695 aa  300  5e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2866  glycoside hydrolase family protein  32.84 
 
 		 736 aa  298  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.988435 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3651  4-alpha-glucanotransferase  33.52 
 
 		 689 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215305 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24890  4-alpha-glucanotransferase  34.98 
 
 		 691 aa  296  9e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829974  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3127  4-alpha-glucanotransferase  32.04 
 
 		 692 aa  296  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1780  4-alpha-glucanotransferase  36.02 
 
 		 605 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.900692  normal  0.822688 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4635  4-alpha-glucanotransferase  33.61 
 
 		 696 aa  296  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3712  4-alpha-glucanotransferase  34.25 
 
 		 692 aa  296  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2674  4-alpha-glucanotransferase  35.85 
 
 		 607 aa  295  2e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3715  4-alpha-glucanotransferase  34.25 
 
 		 692 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3883  4-alpha-glucanotransferase  34.25 
 
 		 692 aa  295  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3797  4-alpha-glucanotransferase  30.32 
 
 		 694 aa  294  5e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3821  4-alpha-glucanotransferase  34.09 
 
 		 692 aa  293  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3787  4-alpha-glucanotransferase  33.6 
 
 		 692 aa  293  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1600  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.49 
 
 		 1633 aa  293  9e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290516  hitchhiker  0.00115838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4052  4-alpha-glucanotransferase  33.38 
 
 		 689 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1791  4-alpha-glucanotransferase  33.85 
 
 		 689 aa  293  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.816513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3892  4-alpha-glucanotransferase  29.94 
 
 		 694 aa  292  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1210  glycoside hydrolase family protein  34.23 
 
 		 663 aa  291  3e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3697  4-alpha-glucanotransferase  30.2 
 
 		 694 aa  291  3e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.451758 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2279  4-alpha-glucanotransferase  33.66 
 
 		 684 aa  291  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0480824  normal  0.0112086 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0297  4-alpha-glucanotransferase  29.94 
 
 		 694 aa  291  4e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128437  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3614  4-alpha-glucanotransferase  30.2 
 
 		 694 aa  290  4e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0297  4-alpha-glucanotransferase  30.2 
 
 		 694 aa  290  4e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000311021  normal  0.0613825 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2938  4-alpha-glucanotransferase  34.49 
 
 		 664 aa  291  4e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03268  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  30.2 
 
 		 694 aa  290  9e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000118056  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03220  hypothetical protein  30.2 
 
 		 694 aa  290  9e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3143  4-alpha-glucanotransferase  35.32 
 
 		 682 aa  289  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113205  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0545  4-alpha-glucanotransferase  32.61 
 
 		 669 aa  289  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.650062 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4723  4-alpha-glucanotransferase  30.06 
 
 		 694 aa  287  5.999999999999999e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3677  4-alpha-glucanotransferase  35.83 
 
 		 656 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36590  putative 4-alpha-glucanotransferase  35.43 
 
 		 684 aa  282  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.393735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1461  4-alpha-glucanotransferase  32.82 
 
 		 697 aa  282  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.465612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1114  4-alpha-glucanotransferase  35.86 
 
 		 605 aa  280  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.587609 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>