145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2837 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2837  putative acyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
375 aa  747    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.926618 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0305  putative acyl-CoA dehydrogenase  46.36 
 
 
376 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.1367 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2211  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.9 
 
 
378 aa  308  9e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0970  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.2 
 
 
379 aa  306  3e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3792  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  50.41 
 
 
358 aa  297  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.267616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5417  putative acyl-CoA dehydrogenase family protein  45.63 
 
 
373 aa  297  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3484  acyl-CoA dehydrogenase type 2  49.86 
 
 
358 aa  296  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2613  putative acyl-CoA dehydrogenase family protein  44.5 
 
 
373 aa  292  7e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.346291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1706  putative acyl-CoA dehydrogenase  46.8 
 
 
375 aa  280  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.087432  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4852  acyl-CoA dehydrogenase-like  42.93 
 
 
395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.150232 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2174  putative acyl-CoA dehydrogenase  40.11 
 
 
382 aa  270  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3866  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  49.12 
 
 
362 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0222771 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4820  putative acyl-CoA dehydrogenase  44.48 
 
 
375 aa  257  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0038  putative acyl-CoA dehydrogenase  38.2 
 
 
360 aa  257  3e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1150  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  42.34 
 
 
397 aa  251  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.428628 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1309  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.98 
 
 
397 aa  248  9e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4667  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  41.36 
 
 
396 aa  233  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0171462  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0622  acyl-CoA dehydrogenase  34.97 
 
 
354 aa  202  7e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00205931  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0160  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  30.21 
 
 
344 aa  173  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0165  hypothetical protein  30.21 
 
 
344 aa  173  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2627  hypothetical protein  30.63 
 
 
353 aa  143  4e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0414836  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2274  acyl-CoA dehydrogenase  32.35 
 
 
354 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.921595  normal  0.572718 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2095  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  32.24 
 
 
354 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.528653 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3638  acyl-CoA dehydrogenase, putative  32.24 
 
 
354 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0587866  normal  0.442088 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2929  hypothetical protein  31.09 
 
 
355 aa  123  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0459  hypothetical protein  31.29 
 
 
367 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34490  hypothetical protein  32.45 
 
 
355 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000897326  normal  0.153318 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3928  acyl-CoA dehydrogenase, putative  30.84 
 
 
366 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.438549  normal  0.0461862 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1538  putative acyl-CoA dehydrogenase  30.48 
 
 
367 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0700  acyl-CoA dehydrogenase family protein  26.3 
 
 
354 aa  101  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.564675  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6511  hypothetical protein  30.65 
 
 
371 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6745  hypothetical protein  30.65 
 
 
371 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.839762  normal  0.367272 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0102  putative acyl-CoA dehydrogenase  30.79 
 
 
367 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988493  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6334  putative acyl-CoA dehydrogenase  30.32 
 
 
371 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5825  putative acyl-CoA dehydrogenase  30.72 
 
 
365 aa  94  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.803301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1452  acyl-CoA dehydrogenase  27.54 
 
 
350 aa  86.7  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00428618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1345  acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain protein  27.15 
 
 
387 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3289  isovaleryl-CoA dehydrogenase  28.12 
 
 
390 aa  56.6  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0481  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.02 
 
 
363 aa  56.6  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4214  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.81 
 
 
386 aa  56.6  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.234142  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3291  acyl-CoA dehydrogenase-like  26.38 
 
 
388 aa  55.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6366  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.11 
 
 
387 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3274  citronelloyl-CoA dehydrogenase, GnyD  25.56 
 
 
387 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4353  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.77 
 
 
385 aa  53.1  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6843  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.98 
 
 
393 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38440  citronelloyl-CoA dehydrogenase, GnyD  25.11 
 
 
387 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1719  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.13 
 
 
389 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2121  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.11 
 
 
388 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.274166  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2062  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.22 
 
 
395 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33630  acyl-CoA dehydrogenase  23.08 
 
 
386 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0241  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.4 
 
 
389 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6030  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.69 
 
 
391 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0714  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.2 
 
 
388 aa  51.2  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.0860013 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4115  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.15 
 
 
390 aa  50.4  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1029  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.51 
 
 
387 aa  50.4  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239684  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06620  butyryl-CoA dehydrogenase  21.61 
 
 
380 aa  50.4  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2589  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.15 
 
 
390 aa  50.4  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000683478  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2033  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.2 
 
 
387 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0666462  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1436  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.92 
 
 
415 aa  49.7  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.549354  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2638  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.77 
 
 
387 aa  50.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3174  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.79 
 
 
383 aa  49.7  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000929019  hitchhiker  0.000000000938929 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1375  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.11 
 
 
387 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.178062  normal  0.0980928 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4700  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.64 
 
 
384 aa  49.7  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.201387  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1804  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.18 
 
 
390 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392184  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28760  acyl-CoA dehydrogenase  25.91 
 
 
382 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12851  normal  0.0971486 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4724  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.61 
 
 
390 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4263  acyl-CoA dehydrogenase-like  23.45 
 
 
390 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.662141  normal  0.561312 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0960  isovaleryl-CoA dehydrogenase  22.73 
 
 
393 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.433991  normal  0.388602 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2082  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.53 
 
 
376 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3360  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25.33 
 
 
410 aa  48.5  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13303  acyl-CoA dehydrogenase fadE25  23.53 
 
 
389 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2188  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.11 
 
 
387 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.25 
 
 
393 aa  47.8  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0319  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.03 
 
 
383 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.339666  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4686  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.73 
 
 
393 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162224  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5326  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.54 
 
 
382 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.777784 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1085  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.68 
 
 
373 aa  47.8  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.863384  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1126  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.57 
 
 
373 aa  47  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0409  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.66 
 
 
406 aa  47  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0272  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.68 
 
 
356 aa  47.4  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0882804  normal  0.0745617 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4530  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.81 
 
 
389 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.335652  normal  0.412983 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3693  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.89 
 
 
390 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0289  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.89 
 
 
391 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0226098  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5850  acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain protein  25.33 
 
 
380 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.856697 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4413  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.23 
 
 
384 aa  46.6  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3779  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.23 
 
 
396 aa  46.6  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3127  acyl-CoA dehydrogenase-like  22.27 
 
 
393 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.105998  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5240  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.27 
 
 
393 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288959  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1208  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.51 
 
 
391 aa  46.2  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166701  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4743  butyryl-CoA dehydrogenase  22.76 
 
 
417 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0966  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.42 
 
 
390 aa  46.2  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0129  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.34 
 
 
393 aa  46.2  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3057  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.23 
 
 
396 aa  46.2  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0344  acyl-CoA dehydrogenase-like  21.51 
 
 
395 aa  45.8  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05840  glutaryl-CoA dehydrogenase  27.78 
 
 
393 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0549  glutaryl-CoA dehydrogenase  27.78 
 
 
393 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5991  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.26 
 
 
395 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000302563 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0175  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.89 
 
 
393 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017739  normal  0.388373 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5032  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.27 
 
 
393 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1300  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  23.13 
 
 
388 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>