More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6046 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6046  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 502 aa  996    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1229  two component LuxR family transcriptional regulator  85.66 
 
 		 502 aa  857    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6248  two component LuxR family transcriptional regulator  72.38 
 
 		 633 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.713882 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0975  two component transcriptional regulator, LuxR family  65.09 
 
 		 508 aa  405  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5418  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.61 
 
 		 774 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4877  PAS sensor protein  58.33 
 
 		 643 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5362  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.72 
 
 		 643 aa  348  1e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6450  signal transduction histidine kinase  56.52 
 
 		 635 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2364  signal transduction histidine kinase  52.61 
 
 		 633 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.932865  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2977  response regulator receiver protein  41.58 
 
 		 208 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 208 aa  126  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 210 aa  126  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  38.58 
 
 		 205 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  40.21 
 
 		 214 aa  122  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 203 aa  120  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.57 
 
 		 205 aa  118  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  37.56 
 
 		 205 aa  117  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  36.22 
 
 		 205 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1616  two component LuxR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 218 aa  115  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2222  response regulator FixJ  35.38 
 
 		 205 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 203 aa  114  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6902  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 210 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.173656  normal  0.571333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2968  two component LuxR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 207 aa  111  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5693  two component LuxR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 224 aa  110  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4053  response regulator FixJ  37.37 
 
 		 205 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1906  response regulator FixJ  37.06 
 
 		 205 aa  110  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.700153  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  44.81 
 
 		 205 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6273  response regulator FixJ  33.17 
 
 		 204 aa  110  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.544702 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 406 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  29.58 
 
 		 657 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2228  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 654 aa  108  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 414 aa  107  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4727  response regulator FixJ  35.08 
 
 		 203 aa  107  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7977  signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 1039 aa  105  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0366  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.26 
 
 		 618 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  42.22 
 
 		 1111 aa  103  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0630  response regulator FixJ  37.43 
 
 		 204 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136769  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5002  signal transduction histidine kinase  43.8 
 
 		 1096 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  43.8 
 
 		 1096 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3626  signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 792 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0746201  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1028  response regulator FixJ  36.14 
 
 		 205 aa  102  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1878  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 208 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 207 aa  100  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6109  two component LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 210 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1717  two component LuxR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 205 aa  100  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 212 aa  100  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2857  signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 515 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207944  normal  0.114386 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  34.33 
 
 		 213 aa  100  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  36.07 
 
 		 202 aa  99.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7267  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.52 
 
 		 217 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.85 
 
 		 228 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 214 aa  99.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  31.75 
 
 		 209 aa  99.4  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.23 
 
 		 214 aa  99  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 209 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1499  LuxR family two component transcriptional regulator  33.99 
 
 		 209 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0872  two component LuxR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 210 aa  99  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1621  two component LuxR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 201 aa  99.4  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5090  two component LuxR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 214 aa  98.2  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2579  response regulator FixJ  37.89 
 
 		 205 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4618  two component LuxR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 224 aa  98.2  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3181  two component LuxR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 214 aa  98.2  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.246114  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 382 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5186  two component LuxR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 214 aa  98.2  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 381 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  33.91 
 
 		 381 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2095  response regulator receiver protein  32.68 
 
 		 216 aa  97.4  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5743  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.17 
 
 		 212 aa  97.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0693  Signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 		 400 aa  97.1  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 214 aa  97.4  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3815  response regulator receiver protein  35.56 
 
 		 212 aa  97.4  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 381 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  32.2 
 
 		 212 aa  96.3  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 400 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 212 aa  96.3  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 		 674 aa  95.5  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  32.2 
 
 		 212 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  32.2 
 
 		 212 aa  95.9  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  32.2 
 
 		 212 aa  95.9  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0530  two component LuxR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 211 aa  95.9  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  32.2 
 
 		 212 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 212 aa  95.9  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 212 aa  95.9  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  32.2 
 
 		 212 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  32.2 
 
 		 212 aa  95.9  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  32.2 
 
 		 212 aa  95.9  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3529  signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 405 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 212 aa  95.9  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 212 aa  95.9  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  33.16 
 
 		 215 aa  95.5  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 212 aa  95.9  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 212 aa  95.9  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  33.33 
 
 		 210 aa  94.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.12 
 
 		 213 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3850  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  94.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 212 aa  94.4  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 206 aa  94.4  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0241  LuxR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 216 aa  94  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2400  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.38 
 
 		 210 aa  94  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 210 aa  94.4  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>