More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5860 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  100 
 
 
272 aa  536  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  60.82 
 
 
252 aa  300  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  62.3 
 
 
256 aa  300  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  60 
 
 
256 aa  294  9e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  60 
 
 
256 aa  294  9e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.85 
 
 
251 aa  292  4e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0546  ABC transporter related  56.8 
 
 
260 aa  260  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.747453 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  51.81 
 
 
252 aa  232  5e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  47.56 
 
 
266 aa  229  4e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  46.22 
 
 
254 aa  228  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  45.82 
 
 
254 aa  226  4e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4184  ABC transporter related protein  47.54 
 
 
271 aa  224  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.233186  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.94 
 
 
250 aa  220  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  47.74 
 
 
250 aa  220  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4205  ABC transporter related  46.4 
 
 
254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4057  ABC transporter related  46.4 
 
 
254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0519536  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0760  ABC transporter related  44.78 
 
 
273 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.53 
 
 
250 aa  218  6e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  48.36 
 
 
267 aa  218  7e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  49.17 
 
 
252 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7683  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.09 
 
 
254 aa  217  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  42.74 
 
 
271 aa  217  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  45.8 
 
 
249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4883  ABC transporter related  46 
 
 
254 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  45.8 
 
 
249 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1373  ABC transporter related  46.09 
 
 
254 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2552  ABC transporter related  45.97 
 
 
260 aa  215  8e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.94553 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2064  ABC transporter related  46.22 
 
 
260 aa  214  8e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0006  ABC transporter related  46.5 
 
 
253 aa  214  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.362312  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  45.38 
 
 
249 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1280  ABC transporter-related protein  43.31 
 
 
277 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78204  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0839  ABC transporter related  47.52 
 
 
246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  45.53 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  45.53 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3424  ABC transporter related  46.5 
 
 
255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0006  ABC transporter related  47.33 
 
 
255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.112174 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  42.64 
 
 
259 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  43.58 
 
 
859 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  43.85 
 
 
256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3086  ABC transporter related  44.72 
 
 
258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.983712  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  47.52 
 
 
252 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3344  ABC transporter ATP-binding protein  45.68 
 
 
256 aa  211  7.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6436  ABC transporter related  44.13 
 
 
261 aa  211  7.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  45.45 
 
 
251 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  46.53 
 
 
250 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  46.77 
 
 
252 aa  211  1e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  46.72 
 
 
256 aa  210  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  47.98 
 
 
256 aa  209  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2314  ABC transporter related  44.44 
 
 
249 aa  209  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  40.81 
 
 
284 aa  209  4e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  45.31 
 
 
251 aa  209  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5956  ABC transporter related  44.86 
 
 
256 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00448247  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2418  ABC transporter related  44.22 
 
 
255 aa  208  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  40.08 
 
 
253 aa  208  8e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  45.38 
 
 
253 aa  208  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  43.48 
 
 
265 aa  208  9e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  43.44 
 
 
256 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  45.87 
 
 
250 aa  207  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  40.81 
 
 
284 aa  207  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  46.06 
 
 
266 aa  208  1e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3522  ABC transporter related  46.53 
 
 
250 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0311765  normal  0.543543 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  43.48 
 
 
264 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0226  ABC transporter related  43.48 
 
 
257 aa  207  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.0444601 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3122  ABC transporter related  43.44 
 
 
256 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30892  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  42.53 
 
 
842 aa  206  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3487  ABC transporter related  44.26 
 
 
256 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1068  ABC transporter related  43.8 
 
 
273 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711539  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2168  ABC transporter related  48.21 
 
 
274 aa  206  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1932  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42 
 
 
257 aa  206  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1793  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42 
 
 
257 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  44.44 
 
 
255 aa  206  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1933  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42 
 
 
257 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2517  ABC transporter related  43.82 
 
 
256 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.547475  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2931  ABC transporter-related protein  44.31 
 
 
264 aa  206  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.409418  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2032  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.4 
 
 
257 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0564166  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  45.53 
 
 
252 aa  206  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1750  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42 
 
 
257 aa  206  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.844188  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2769  ABC transporter related  41.87 
 
 
257 aa  206  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0502459  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  45.04 
 
 
254 aa  206  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  45.49 
 
 
263 aa  205  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  44.31 
 
 
253 aa  205  6e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1968  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.6 
 
 
257 aa  205  7e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000325906 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4073  ABC transporter related  44.67 
 
 
256 aa  205  7e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  44.58 
 
 
250 aa  205  8e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.6 
 
 
257 aa  204  9e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.790665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3410  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42 
 
 
257 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000400579 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2329  ABC transporter related  43.5 
 
 
251 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170291  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2011  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42 
 
 
257 aa  203  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0642  ABC transporter related  44.57 
 
 
278 aa  203  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3167  ABC transporter related  44.21 
 
 
251 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449942  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1672  ABC transporter related  44.63 
 
 
251 aa  203  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.707432  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2809  ABC transporter related  42.06 
 
 
625 aa  202  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194078  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1802  ABC transporter related  41.04 
 
 
257 aa  202  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.201927  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3727  ABC transporter related  42.8 
 
 
246 aa  202  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141093  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  46 
 
 
255 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3520  ABC transporter-related protein  43.62 
 
 
257 aa  202  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.341337 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  43.02 
 
 
259 aa  202  6e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  44.88 
 
 
257 aa  202  7e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5822  ABC transporter related  42.15 
 
 
260 aa  201  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.545268  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3527  ABC transporter related  43.62 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>