More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5140 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5140  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 305 aa  592  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  36.92 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  40.07 
 
 		 321 aa  155  6e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  35.77 
 
 		 354 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  37.36 
 
 		 350 aa  149  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  35.74 
 
 		 332 aa  148  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  37.1 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  37.1 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  34.52 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  35.66 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  36.26 
 
 		 332 aa  142  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  34.16 
 
 		 332 aa  143  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  35.14 
 
 		 342 aa  136  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  35.97 
 
 		 344 aa  135  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  35.66 
 
 		 371 aa  135  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 		 343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 		 379 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  36.72 
 
 		 317 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  36.72 
 
 		 317 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  35.47 
 
 		 317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  33.56 
 
 		 390 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  35.57 
 
 		 367 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  35.88 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1380  alpha/beta hydrolase fold  32.31 
 
 		 321 aa  125  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  32.95 
 
 		 320 aa  123  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  34.98 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  32.86 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  31.89 
 
 		 325 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  31.56 
 
 		 330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  32.91 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 		 322 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  33.89 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  32.92 
 
 		 341 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  34.84 
 
 		 328 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  37.78 
 
 		 346 aa  105  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4934  Alpha/beta hydrolase fold  35.63 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 328 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  33.09 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  31.4 
 
 		 314 aa  102  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  32.02 
 
 		 319 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3689  hypothetical protein  34.48 
 
 		 335 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3577  alpha/beta hydrolase fold protein  31.66 
 
 		 358 aa  99  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 		 320 aa  99  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  29.7 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  32.01 
 
 		 327 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0434  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 		 318 aa  95.5  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332302  hitchhiker  0.0000000111123 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 330 aa  95.5  9e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 		 331 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  32.01 
 
 		 327 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5961  alpha/beta hydrolase fold protein  36.68 
 
 		 345 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576377  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  32.01 
 
 		 327 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 		 331 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 		 331 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3278  alpha/beta hydrolase fold  30.52 
 
 		 351 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  31.58 
 
 		 324 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  31.58 
 
 		 324 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  31.58 
 
 		 324 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  31.58 
 
 		 324 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  31.58 
 
 		 327 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  31.58 
 
 		 324 aa  89.4  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0129  alpha/beta hydrolase fold  35.27 
 
 		 338 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2865  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0741  hypothetical protein  40.71 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1537  alpha/beta fold family hydrolase  31.34 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0118  alpha/beta fold family hydrolase  31.34 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347516  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  27.41 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  29.74 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  41.75 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  28.01 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2333  alpha/beta fold family hydrolase  29.07 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  36.36 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5766  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.57 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2240  alpha/beta hydrolase fold protein  30.91 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000309374  hitchhiker  0.000000000781643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4523  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  37.4 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4466  alpha/beta hydrolase fold protein  31.4 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.911408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2479  alpha/beta hydrolase fold  34.23 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2136  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000406984  decreased coverage  0.00000741326 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  29.35 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.53 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  34.21 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  35.77 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  23.55 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  38 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  38 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>