64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4304 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4304  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 309 aa  578  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30548  normal  0.0946838 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0826  von Willebrand factor type A  78.43 
 
 		 307 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.420191  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0866  von Willebrand factor type A  78.76 
 
 		 307 aa  367  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258212  normal  0.0493979 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0792  von Willebrand factor type A  78.43 
 
 		 307 aa  366  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.026316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1008  von Willebrand factor type A  66.23 
 
 		 306 aa  292  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.851254  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1387  von Willebrand factor type A  66.01 
 
 		 307 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353054  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2468  von Willebrand factor type A  44.66 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.722461 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3280  hypothetical protein  44.52 
 
 		 311 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.207213  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4012  hypothetical protein  43.97 
 
 		 311 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.523385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0460  hypothetical protein  40.73 
 
 		 299 aa  147  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1129  von Willebrand factor, type A  38.21 
 
 		 315 aa  115  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  32.89 
 
 		 607 aa  73.2  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 644 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  24.25 
 
 		 701 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2767  hypothetical protein  23.89 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2913  hypothetical protein  23.89 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  24.15 
 
 		 345 aa  62.4  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  24.84 
 
 		 576 aa  59.7  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  26.67 
 
 		 658 aa  59.3  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 		 653 aa  58.9  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  30.74 
 
 		 612 aa  58.9  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  28.22 
 
 		 599 aa  57  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 		 650 aa  56.2  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3117  hypothetical protein  30.94 
 
 		 503 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  30.3 
 
 		 646 aa  54.3  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 		 587 aa  53.5  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  30.24 
 
 		 701 aa  53.1  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  22.59 
 
 		 619 aa  53.1  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 		 647 aa  52.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  27.94 
 
 		 601 aa  52  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  25.3 
 
 		 679 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  31.28 
 
 		 579 aa  50.8  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  25.93 
 
 		 690 aa  50.4  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  26.79 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0853  TPR repeat-containing protein  31.23 
 
 		 680 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  30.86 
 
 		 544 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 		 572 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  27.55 
 
 		 572 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1886  von Willebrand factor, type A  28.52 
 
 		 329 aa  47.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 		 571 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 693 aa  46.6  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 		 663 aa  46.6  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  27.36 
 
 		 667 aa  45.8  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3659  hypothetical protein  30.14 
 
 		 335 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.54 
 
 		 692 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 692 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1740  hypothetical protein  26.57 
 
 		 564 aa  45.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  30.54 
 
 		 690 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 693 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  20.3 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  25.85 
 
 		 611 aa  44.3  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  24.62 
 
 		 344 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  25.5 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  27.49 
 
 		 530 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 		 691 aa  43.5  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  22.82 
 
 		 334 aa  43.1  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3278  von Willebrand factor domain-containing protein  26.35 
 
 		 328 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173273  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0865  von Willebrand factor type A  31.28 
 
 		 339 aa  42.7  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0877751  normal  0.04584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0825  von Willebrand factor type A  31.28 
 
 		 339 aa  42.7  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2495  von Willebrand factor type A  28.05 
 
 		 316 aa  42.7  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142903  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  22.6 
 
 		 339 aa  42.7  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2492  hypothetical protein  30.1 
 
 		 335 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2500  hypothetical protein  30.1 
 
 		 335 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.672748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2455  hypothetical protein  30.1 
 
 		 335 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.16032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>