More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0129 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0129  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 338 aa  637    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  54.6 
 
 		 331 aa  315  7e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2865  alpha/beta hydrolase fold  54.4 
 
 		 331 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  54.55 
 
 		 331 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  56.42 
 
 		 346 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5961  alpha/beta hydrolase fold protein  55.56 
 
 		 345 aa  280  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576377  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  42.05 
 
 		 342 aa  199  5e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  40.66 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  43.42 
 
 		 329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  41.03 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  42.96 
 
 		 320 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  41.8 
 
 		 334 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  36.99 
 
 		 330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  38.67 
 
 		 341 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3278  alpha/beta hydrolase fold  36.33 
 
 		 351 aa  165  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  39.53 
 
 		 333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3577  alpha/beta hydrolase fold protein  35.52 
 
 		 358 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  36.69 
 
 		 343 aa  159  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3689  hypothetical protein  34.53 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  35.12 
 
 		 320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  37.87 
 
 		 340 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  35.23 
 
 		 320 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  38.74 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  37.16 
 
 		 322 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  34.89 
 
 		 317 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  34.89 
 
 		 317 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  35.81 
 
 		 354 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  33.9 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  35.08 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  37.15 
 
 		 390 aa  136  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  34.97 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  35.56 
 
 		 332 aa  133  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  34.75 
 
 		 330 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  34.64 
 
 		 317 aa  132  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  34.69 
 
 		 332 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  33.67 
 
 		 332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  36.15 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  36.15 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  36.39 
 
 		 332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  35.11 
 
 		 332 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4934  Alpha/beta hydrolase fold  39.47 
 
 		 320 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  35.09 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  35.4 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  35.16 
 
 		 327 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  35.16 
 
 		 327 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  33.99 
 
 		 379 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0434  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332302  hitchhiker  0.0000000111123 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  35.16 
 
 		 327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  34.69 
 
 		 328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  34.8 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  32.55 
 
 		 318 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  34.03 
 
 		 371 aa  116  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  33.21 
 
 		 342 aa  116  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  35.54 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  27.96 
 
 		 310 aa  113  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  32.24 
 
 		 324 aa  113  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  32.24 
 
 		 324 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  32.24 
 
 		 327 aa  113  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  32.24 
 
 		 324 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  30.09 
 
 		 339 aa  112  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  32.24 
 
 		 324 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1380  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  32.55 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  32.86 
 
 		 344 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  32.29 
 
 		 321 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  32.29 
 
 		 321 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  32.29 
 
 		 321 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0118  alpha/beta fold family hydrolase  32.03 
 
 		 326 aa  99.4  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347516  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1537  alpha/beta fold family hydrolase  32.03 
 
 		 326 aa  99.4  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5140  alpha/beta hydrolase fold  35.43 
 
 		 305 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  32.75 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 		 339 aa  82.4  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0741  hypothetical protein  42.54 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5766  alpha/beta hydrolase fold protein  29.13 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  30.74 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 		 346 aa  75.9  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 302 aa  75.9  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  40.46 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  28.31 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3197  haloalkane dehalogenase  30.23 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  32.44 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2514  alpha/beta hydrolase fold protein  31.96 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  31.2 
 
 		 275 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1675  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0263497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  32.34 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  26.8 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  28.05 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  26.01 
 
 		 562 aa  70.1  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.67 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  29.56 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>