117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4016 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3760  IucA/IucC family protein  90.25 
 
 		 594 aa  1062    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.130185 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4016  IucA/IucC family protein  100 
 
 		 595 aa  1184    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306734  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4055  IucA/IucC family protein  88.91 
 
 		 594 aa  1051    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0250939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2302  siderophore synthetase component  53.87 
 
 		 609 aa  593  1e-168  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.867655  normal  0.869204 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4392  IucA/IucC  52.24 
 
 		 596 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2632  IucA/IucC family protein  51.12 
 
 		 593 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3522  IucA/IucC family protein  43.22 
 
 		 610 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3346  petrobactin biosynthesis protein AsbA  31.69 
 
 		 602 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00585589  hitchhiker  0.0000000000000409747 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1983  petrobactin biosynthesis protein AsbA  31.24 
 
 		 602 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0967971  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2016  petrobactin biosynthesis protein AsbA  31.53 
 
 		 602 aa  301  3e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2796000000000001e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1812  siderophore biosynthesis protein  31.53 
 
 		 602 aa  300  4e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000021038  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1844  IucA/IucC family protein  32.41 
 
 		 602 aa  299  8e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0027586  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1838  siderophore biosynthesis protein  31.48 
 
 		 602 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1795  siderophore biosynthesis protein  31.14 
 
 		 602 aa  299  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1981  siderophore biosynthesis protein  31.48 
 
 		 602 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978268  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3334  IucA/IucC family protein  38.3 
 
 		 591 aa  286  8e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  36.35 
 
 		 578 aa  276  7e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3331  IucA/IucC family protein  38.67 
 
 		 601 aa  267  4e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  38.22 
 
 		 645 aa  266  1e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  31.86 
 
 		 606 aa  262  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  38.28 
 
 		 601 aa  256  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3257  IucA/IucC family protein  31.75 
 
 		 584 aa  254  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5062  IucA/IucC family protein  37.31 
 
 		 588 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0660  IucA/IucC family protein  39.07 
 
 		 570 aa  231  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00702947  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  30.66 
 
 		 810 aa  229  1e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4056  IucA/IucC  33.23 
 
 		 672 aa  225  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  28.54 
 
 		 818 aa  216  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  32.14 
 
 		 925 aa  203  9e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  30.88 
 
 		 610 aa  184  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  31.66 
 
 		 613 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1814  siderophore synthetase component, IucA/IucC  28.75 
 
 		 560 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00455454  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4634  aerobactin synthase, IucA component  30.64 
 
 		 574 aa  173  6.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3182  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  30.63 
 
 		 574 aa  172  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  32.24 
 
 		 611 aa  167  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0947  IucA/IucC family protein  30.23 
 
 		 574 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251332  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  26.54 
 
 		 578 aa  163  8.000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  26.54 
 
 		 578 aa  163  8.000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  28.82 
 
 		 580 aa  155  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0922  IucA/IucC family protein  30.69 
 
 		 581 aa  150  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0714  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  30.69 
 
 		 590 aa  150  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0786  IucA/IucC family protein  30.69 
 
 		 590 aa  150  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3139  IucA/IucC family protein  27.99 
 
 		 586 aa  150  8e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01928  iron transporter  30.66 
 
 		 576 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  32.64 
 
 		 608 aa  146  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09310  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  31.74 
 
 		 586 aa  144  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00047621  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3094  iron transporter  29.67 
 
 		 584 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  30.07 
 
 		 1153 aa  140  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  26.64 
 
 		 1148 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2584  IucA/IucC  26.35 
 
 		 594 aa  135  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652267  decreased coverage  0.000722878 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2971  IucA/IucC family protein  32.93 
 
 		 555 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.963882 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3750  IucA/IucC family protein  31.77 
 
 		 599 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1276  IucA/IucC  26.23 
 
 		 684 aa  129  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2677  IucA/IucC family protein  27.6 
 
 		 628 aa  124  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.211511  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8365  putative iron transport protein  31.44 
 
 		 519 aa  123  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  30.09 
 
 		 991 aa  84.3  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  32.53 
 
 		 998 aa  83.6  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  29.7 
 
 		 998 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  27.58 
 
 		 577 aa  80.9  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  28.49 
 
 		 577 aa  80.9  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  28.21 
 
 		 562 aa  80.5  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1779  hypothetical protein  20.88 
 
 		 585 aa  80.1  0.00000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.762831  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  26.18 
 
 		 720 aa  79.3  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  29.27 
 
 		 615 aa  78.6  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001065  vibrioferrin amide bond forming protein PvsB  26.02 
 
 		 610 aa  77.8  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  28.12 
 
 		 577 aa  76.6  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  25.36 
 
 		 582 aa  73.2  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  30.6 
 
 		 655 aa  70.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  23.76 
 
 		 588 aa  70.1  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  28.33 
 
 		 563 aa  69.3  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  30.65 
 
 		 655 aa  69.3  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2970  IucA/IucC family protein  30.09 
 
 		 546 aa  69.3  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2210  hypothetical protein  20.37 
 
 		 585 aa  68.6  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2249  hypothetical protein  20.37 
 
 		 585 aa  68.6  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  26.44 
 
 		 582 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  26.44 
 
 		 582 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  26.44 
 
 		 582 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  27.38 
 
 		 635 aa  63.9  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3092  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  30.79 
 
 		 587 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  26.21 
 
 		 580 aa  62.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  25.06 
 
 		 580 aa  61.6  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6950  IucA/IucC family protein  28.92 
 
 		 587 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  22.61 
 
 		 656 aa  60.8  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  22.61 
 
 		 656 aa  60.8  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  24.28 
 
 		 618 aa  60.5  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  24.86 
 
 		 619 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3733  IucA/IucC family protein  26.49 
 
 		 557 aa  59.3  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935352  normal  0.031282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  27.36 
 
 		 610 aa  58.2  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09330  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  25.48 
 
 		 592 aa  57.8  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0934837  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  24.01 
 
 		 617 aa  56.2  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3906  IucA/IucC family protein  27.1 
 
 		 633 aa  56.2  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  22.52 
 
 		 653 aa  54.7  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01930  vibrioferrin biosynthesis protein PvsB  27.1 
 
 		 600 aa  54.3  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  23.96 
 
 		 625 aa  53.9  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  25.91 
 
 		 621 aa  53.5  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  22.28 
 
 		 612 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  21.55 
 
 		 592 aa  52  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  21.55 
 
 		 592 aa  52  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  25.75 
 
 		 572 aa  50.8  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  20.73 
 
 		 612 aa  50.8  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  24.23 
 
 		 842 aa  50.4  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>