149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1997 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1997  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  589  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2869  hypothetical protein  40.58 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2609  hypothetical protein  40.98 
 
 		 350 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.918315 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2308  hypothetical protein  39.19 
 
 		 312 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.318236  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1871  hypothetical protein  36.88 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5020  hypothetical protein  53.85 
 
 		 343 aa  93.2  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.86222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2186  hypothetical protein  59.21 
 
 		 322 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  28.98 
 
 		 291 aa  85.9  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  29.26 
 
 		 311 aa  85.9  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1423  hypothetical protein  44.44 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.41572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2087  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.03 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1169  hypothetical protein  47.13 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1089  hypothetical protein  47.13 
 
 		 322 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0081  hypothetical protein  51.32 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  25 
 
 		 325 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  26.3 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1117  cytoskeletal protein RodZ  27.9 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 		 326 aa  72  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  29.41 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  26.28 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  27.36 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  24.42 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1355  hypothetical protein  26.61 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000155612 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  26.71 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  23.45 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  26.5 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  25.29 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  24.86 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  25 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  23.76 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3015  cytoskeletal protein RodZ  37.35 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0419  cytoskeletal protein RodZ  30 
 
 		 345 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250443 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  28.11 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  43.21 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  35.56 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2676  cytoskeletal protein RodZ  26.92 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3391  transcriptional regulator  40.96 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1292  cytoskeletal protein RodZ  31.37 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1257  cytoskeletal protein RodZ  40.22 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1289  hypothetical protein  25.54 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  40 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1214  hypothetical protein  40 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2893  cytoskeletal protein RodZ  26.63 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  24.35 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  24.35 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2719  cytoskeletal protein RodZ  27.06 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 351 aa  55.8  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2257  hypothetical protein  27.6 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.347318  normal  0.175939 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1185  cytoskeletal protein RodZ  31.25 
 
 		 363 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  35.53 
 
 		 347 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2782  cytoskeletal protein RodZ  26.63 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  35.53 
 
 		 348 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1462  XRE family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0280424  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1251  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 325 aa  53.9  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92911 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  25.09 
 
 		 303 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 260 aa  52.8  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1150  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 360 aa  52.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06601  hypothetical protein  32.94 
 
 		 236 aa  52.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  24.59 
 
 		 314 aa  52.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  30.33 
 
 		 331 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1058  transcriptional regulator, XRE family  35.96 
 
 		 360 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2738  cytoskeletal protein RodZ  26.47 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  35.9 
 
 		 362 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  35.9 
 
 		 360 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1714  hypothetical protein  26.1 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.333106  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  35.9 
 
 		 336 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05141  hypothetical protein  32.86 
 
 		 163 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  35.9 
 
 		 387 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  35.9 
 
 		 336 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  35.9 
 
 		 387 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1708  hypothetical protein  21.48 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2763  cytoskeletal protein RodZ  39.47 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0458  hypothetical protein  25 
 
 		 166 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.282734  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  39.44 
 
 		 300 aa  50.4  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2049  transcriptional regulator  36.71 
 
 		 325 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.055212  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  24.4 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1778  hypothetical protein  25.75 
 
 		 288 aa  50.8  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.842722  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  27.55 
 
 		 278 aa  50.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05211  hypothetical protein  31.43 
 
 		 188 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0734  XRE family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 404 aa  50.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2193  hypothetical protein  24.54 
 
 		 380 aa  50.1  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  24.4 
 
 		 303 aa  49.7  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  24.4 
 
 		 303 aa  49.7  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  24.4 
 
 		 303 aa  49.3  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3501  helix-turn-helix domain-containing protein  35.53 
 
 		 329 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1255  hypothetical protein  33.33 
 
 		 364 aa  49.3  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0157671  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  25.26 
 
 		 308 aa  49.3  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 345 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 338 aa  49.3  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 338 aa  49.3  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 334 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  33.33 
 
 		 448 aa  48.9  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2891  cytoskeletal protein RodZ  26.59 
 
 		 337 aa  48.5  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1789  XRE family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 196 aa  48.5  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2667  cytoskeletal protein RodZ  26.59 
 
 		 337 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1431  hypothetical protein  35.82 
 
 		 310 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.164911  normal  0.214757 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1161  cytoskeletal protein RodZ  26.59 
 
 		 337 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.697985  decreased coverage  0.00885076 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02370  hypothetical protein  26.59 
 
 		 337 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>