143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8195 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  82.99 
 
 		 482 aa  837    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  100 
 
 		 482 aa  979    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  58.5 
 
 		 477 aa  553  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  53.81 
 
 		 445 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  49.28 
 
 		 482 aa  437  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  47.58 
 
 		 459 aa  400  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  45.74 
 
 		 478 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  46.21 
 
 		 445 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  46.44 
 
 		 470 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  45.05 
 
 		 476 aa  385  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  43.79 
 
 		 488 aa  375  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  46.24 
 
 		 476 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  44.47 
 
 		 472 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  42.73 
 
 		 490 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  45.43 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  39.73 
 
 		 462 aa  329  7e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  45.06 
 
 		 473 aa  311  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  33.4 
 
 		 473 aa  271  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0095  protein of unknown function DUF1254  35.88 
 
 		 491 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.870201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0102  protein of unknown function DUF1254  35.17 
 
 		 487 aa  253  6e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3684  hypothetical protein  35.23 
 
 		 488 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0446196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1063  hypothetical protein  33.33 
 
 		 493 aa  240  4e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294245  normal  0.0969669 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0254  hypothetical protein  33.97 
 
 		 542 aa  239  9e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  33.47 
 
 		 471 aa  239  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  34.25 
 
 		 492 aa  236  9e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  33.79 
 
 		 798 aa  230  5e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6960  protein of unknown function DUF1254  34.6 
 
 		 480 aa  226  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5158  hypothetical protein  33.56 
 
 		 480 aa  224  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4882  hypothetical protein  33.92 
 
 		 481 aa  223  8e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  32.52 
 
 		 512 aa  222  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  34.85 
 
 		 480 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  29.37 
 
 		 490 aa  222  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  33.56 
 
 		 479 aa  220  5e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6909  protein of unknown function DUF1254  33.71 
 
 		 470 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.566125 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3163  hypothetical protein  35.45 
 
 		 479 aa  217  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  34.74 
 
 		 432 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  32.59 
 
 		 480 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3151  hypothetical protein  35.45 
 
 		 479 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00208087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3213  hypothetical protein  35.45 
 
 		 479 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211255  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  32.31 
 
 		 479 aa  216  8e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3077  hypothetical protein  31.48 
 
 		 474 aa  216  9e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.923842  normal  0.428423 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  32.89 
 
 		 442 aa  212  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4317  hypothetical protein  34.62 
 
 		 470 aa  209  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  32.94 
 
 		 437 aa  208  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  31.97 
 
 		 469 aa  207  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  32.55 
 
 		 436 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  33.41 
 
 		 445 aa  206  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2936  putative lipoprotein  34.4 
 
 		 465 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6891  protein of unknown function DUF1214  34.32 
 
 		 472 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179873  normal  0.195601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1208  hypothetical protein  28.34 
 
 		 484 aa  204  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.614813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  30.99 
 
 		 482 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3390  protein of unknown function DUF1254  34.57 
 
 		 447 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5372  hypothetical protein  31.57 
 
 		 479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  29.77 
 
 		 467 aa  202  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5367  hypothetical protein  32.04 
 
 		 478 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5493  hypothetical protein  32.04 
 
 		 478 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0168482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4826  hypothetical protein  32.27 
 
 		 479 aa  200  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.853525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4778  hypothetical protein  32.04 
 
 		 478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535493 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1757  hypothetical protein  30.96 
 
 		 432 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0409  putative lipoprotein  30.96 
 
 		 473 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390709  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0319  putative lipoprotein  30.96 
 
 		 473 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  30.23 
 
 		 488 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1847  putative lipoprotein  30.73 
 
 		 473 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.418718  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0851  putative lipoprotein  30.73 
 
 		 473 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437824  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1141  putative lipoprotein  30.73 
 
 		 473 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2115  putative lipoprotein  30.73 
 
 		 473 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2471  hypothetical protein  30.79 
 
 		 488 aa  192  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0165  hypothetical protein  30.51 
 
 		 478 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  0.139033 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  33.11 
 
 		 427 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  31.84 
 
 		 438 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  30.75 
 
 		 465 aa  189  8e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2166  putative lipoprotein  30.72 
 
 		 484 aa  189  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.459318  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  31.45 
 
 		 485 aa  189  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  31.39 
 
 		 465 aa  189  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3300  hypothetical protein  31.83 
 
 		 475 aa  187  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2979  hypothetical protein  26.53 
 
 		 462 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293037  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  32.23 
 
 		 464 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6080  hypothetical protein  31.38 
 
 		 423 aa  179  9e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985101  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  30.37 
 
 		 435 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4637  hypothetical protein  31.78 
 
 		 421 aa  176  8e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  28.44 
 
 		 461 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1113  protein of unknown function DUF1214  51.22 
 
 		 200 aa  160  7e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.540526  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1147  hypothetical protein  31.02 
 
 		 479 aa  159  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5319  hypothetical protein  27.98 
 
 		 467 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1115  protein of unknown function DUF1214  46.78 
 
 		 222 aa  144  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000893  hypothetical protein  26.7 
 
 		 435 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3038  hypothetical protein  27.36 
 
 		 431 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1293  hypothetical protein  26.79 
 
 		 482 aa  128  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3496  hypothetical protein  28.98 
 
 		 449 aa  126  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7169  protein of unknown function DUF1214  28.42 
 
 		 456 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  25.97 
 
 		 452 aa  125  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5465  hypothetical protein  29.56 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640967  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2624  protein of unknown function DUF1214  28.82 
 
 		 459 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000350326  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2989  hypothetical protein  26.54 
 
 		 431 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1209  hypothetical protein  27.76 
 
 		 445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.376745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4286  hypothetical protein  25.21 
 
 		 480 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4372  hypothetical protein  25.21 
 
 		 480 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0578425  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3377  putative lipoprotein  24.12 
 
 		 499 aa  86.7  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2579  hypothetical protein  24.3 
 
 		 512 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6665  protein of unknown function DUF1214  25.05 
 
 		 512 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110382  normal  0.780423 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>