66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5782 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5782  P4 family phage/plasmid primase  100 
 
 		 978 aa  1984    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8732  hypothetical protein  57.83 
 
 		 186 aa  178  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  22.61 
 
 		 717 aa  88.6  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  25.23 
 
 		 798 aa  87.4  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  22.29 
 
 		 717 aa  85.9  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  22.29 
 
 		 717 aa  84.3  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  23.84 
 
 		 632 aa  83.2  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  26.77 
 
 		 486 aa  82.4  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  22.6 
 
 		 531 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  25.09 
 
 		 771 aa  76.6  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  25.88 
 
 		 857 aa  76.3  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  23.58 
 
 		 746 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  23.58 
 
 		 746 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  23.12 
 
 		 828 aa  74.3  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  23.97 
 
 		 769 aa  73.6  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  26.83 
 
 		 775 aa  71.6  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0353  P4 family phage/plasmid primase  25.88 
 
 		 613 aa  71.6  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.764732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  24.91 
 
 		 697 aa  68.6  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1323  hypothetical protein  23.43 
 
 		 526 aa  67.8  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0842  hypothetical protein  23.43 
 
 		 526 aa  67.8  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464315  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1160  hypothetical protein  25.99 
 
 		 842 aa  67.4  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104949  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  25.07 
 
 		 755 aa  67.4  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2551  P4 family phage/plasmid primase  24.89 
 
 		 507 aa  65.5  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00685324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  26.06 
 
 		 775 aa  63.2  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3095  P4 family phage/plasmid primase  24.82 
 
 		 486 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406256  normal  0.59304 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  23.24 
 
 		 524 aa  62.8  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1180  P4 family phage/plasmid primase  25.48 
 
 		 843 aa  62.8  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000898776  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  22.8 
 
 		 782 aa  62  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  25.26 
 
 		 765 aa  62.4  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0983  P4 family phage/plasmid primase  21.97 
 
 		 612 aa  62  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  23.64 
 
 		 760 aa  61.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5275  phage/plasmid primase, P4 family  23.37 
 
 		 1285 aa  60.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.413265  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  26.07 
 
 		 777 aa  60.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  26.07 
 
 		 777 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  26.43 
 
 		 777 aa  59.3  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  26.07 
 
 		 777 aa  59.7  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2363  P4 family phage/plasmid primase  20.81 
 
 		 900 aa  59.7  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  22.37 
 
 		 695 aa  58.9  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  24.84 
 
 		 759 aa  58.5  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0490  phage/plasmid primase, P4 family  22.53 
 
 		 882 aa  56.6  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.958319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  23.72 
 
 		 749 aa  56.6  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2613  superfamily II helicase  26.34 
 
 		 987 aa  57  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0010  replication protein  30.65 
 
 		 406 aa  56.6  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.700386  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  25.93 
 
 		 777 aa  55.1  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2199  P4 family phage/plasmid primase  25.33 
 
 		 554 aa  54.7  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  18.73 
 
 		 723 aa  53.5  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  27.46 
 
 		 776 aa  51.6  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0633  replication protein  29.03 
 
 		 368 aa  51.6  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6606  putative Phage / plasmid primase P4  22.3 
 
 		 624 aa  51.6  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8782  hypothetical protein  26.8 
 
 		 482 aa  50.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242638  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1684  hypothetical protein  23.32 
 
 		 606 aa  50.1  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521904  hitchhiker  0.00120785 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  23.61 
 
 		 738 aa  50.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  22.67 
 
 		 462 aa  50.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5628  P4 family phage/plasmid primase  24.05 
 
 		 1145 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000865428 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  25.93 
 
 		 777 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2258  phage DNA polymerase  20.1 
 
 		 542 aa  48.9  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  21.67 
 
 		 770 aa  48.5  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  24.37 
 
 		 725 aa  48.5  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2898  hypothetical protein  32.82 
 
 		 825 aa  48.5  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.523858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0564  P4 family phage/plasmid primase  23.55 
 
 		 739 aa  47  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.68492  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1166  hypothetical protein  24.22 
 
 		 467 aa  46.6  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0533  phage DNA primase-like protein  24.64 
 
 		 636 aa  46.2  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0606801  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3466  replication protein  28.98 
 
 		 437 aa  46.2  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.255263  normal  0.875759 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3576  replication protein  32.33 
 
 		 439 aa  45.4  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  20.95 
 
 		 1172 aa  44.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  20.95 
 
 		 1172 aa  44.3  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>