More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4613 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4613  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  893    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4737  hypothetical protein  86.84 
 
 		 443 aa  778    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  77.45 
 
 		 440 aa  704    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3854  hypothetical protein  74.38 
 
 		 447 aa  664    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3437  hypothetical protein  65.84 
 
 		 444 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1957  hypothetical protein  66.06 
 
 		 444 aa  593  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4280  hypothetical protein  66.06 
 
 		 444 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4086  hypothetical protein  66.06 
 
 		 444 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4500  hypothetical protein  65.38 
 
 		 444 aa  585  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2353  hypothetical protein  66.06 
 
 		 448 aa  586  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3154  hypothetical protein  66.06 
 
 		 448 aa  584  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3979  hypothetical protein  65.38 
 
 		 444 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  0.381679 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2387  hypothetical protein  66.06 
 
 		 448 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1402  hypothetical protein  66.06 
 
 		 448 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2094  hypothetical protein  66.06 
 
 		 448 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0471832  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1483  hypothetical protein  66.06 
 
 		 448 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3268  hypothetical protein  66.06 
 
 		 448 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3798  hypothetical protein  68.45 
 
 		 441 aa  582  1.0000000000000001e-165  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1122  hypothetical protein  66.06 
 
 		 448 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3496  hypothetical protein  65.16 
 
 		 444 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  64.55 
 
 		 445 aa  578  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1142  hypothetical protein  64.32 
 
 		 442 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3668  hypothetical protein  65.76 
 
 		 451 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2003  hypothetical protein  65.66 
 
 		 446 aa  565  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3345  hypothetical protein  66.21 
 
 		 451 aa  567  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0082  hypothetical protein  65.98 
 
 		 450 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0798772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0398  hypothetical protein  65.38 
 
 		 441 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1041  hypothetical protein  63.33 
 
 		 446 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0344  hypothetical protein  63.55 
 
 		 441 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3685  hypothetical protein  67.51 
 
 		 442 aa  558  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1446  hypothetical protein  64.65 
 
 		 444 aa  560  1e-158  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0289166  normal  0.430384 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5468  hypothetical protein  62.95 
 
 		 442 aa  560  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2797  hypothetical protein  63.15 
 
 		 447 aa  557  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.289939 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3602  hypothetical protein  61.63 
 
 		 444 aa  549  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0673474  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3803  hypothetical protein  66.59 
 
 		 442 aa  551  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1705  hypothetical protein  62.7 
 
 		 447 aa  550  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0167541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3480  hypothetical protein  65.9 
 
 		 442 aa  547  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.634829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0161  hypothetical protein  60.32 
 
 		 442 aa  535  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004322  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  57.7 
 
 		 443 aa  523  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2328  hypothetical protein  59.16 
 
 		 444 aa  518  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.134065  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00991  aminotransferase, class III (AFU_orthologue; AFUA_1G16810)  47.4 
 
 		 448 aa  430  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.47575  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06930  conserved hypothetical protein  47.62 
 
 		 447 aa  421  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.406035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38281  aminotransferase  43.65 
 
 		 461 aa  393  1e-108  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2288  aminotransferase class-III  44.62 
 
 		 442 aa  348  1e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06180  class III aminotransferase, putative  41.8 
 
 		 469 aa  330  2e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0804287  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0831  aminotransferase class-III  41.88 
 
 		 470 aa  311  1e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2094  aminotransferase class-III  36 
 
 		 459 aa  309  6.999999999999999e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0920345  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7651  aminotransferase class-III  40.76 
 
 		 451 aa  309  8e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2853  aminotransferase class-III  42.21 
 
 		 455 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.382989  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3905  aminotransferase  41.11 
 
 		 451 aa  295  9e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.57399  decreased coverage  0.00444917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2111  aminotransferase class-III  42.3 
 
 		 453 aa  293  6e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0683698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  38.27 
 
 		 449 aa  291  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1177  aminotransferase class-III  43.34 
 
 		 444 aa  289  7e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1751  adenosylmethionine-8-amino-7- oxononanoateaminotr ansferase  35.36 
 
 		 446 aa  283  4.0000000000000003e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000427853  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3719  aminotransferase class-III  39.52 
 
 		 455 aa  280  4e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3049  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  35.73 
 
 		 449 aa  280  5e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.512098  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  38.77 
 
 		 459 aa  279  9e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  39.24 
 
 		 456 aa  277  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  37.67 
 
 		 458 aa  277  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13361  hypothetical protein  41.89 
 
 		 438 aa  276  4e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000267145  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0017  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  38.88 
 
 		 451 aa  276  5e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  37.5 
 
 		 456 aa  275  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  37.81 
 
 		 458 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2275  hypothetical protein  36.71 
 
 		 436 aa  273  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  39.49 
 
 		 461 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  39.49 
 
 		 461 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  40.24 
 
 		 459 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  38.84 
 
 		 448 aa  273  7e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  38.84 
 
 		 448 aa  272  7e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  38.84 
 
 		 448 aa  272  7e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  39.25 
 
 		 456 aa  272  9e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  39.02 
 
 		 461 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2857  adenosylmethionine-8-amino-7- oxononanoateaminotr ansferase  38.65 
 
 		 451 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3048  hypothetical protein  36.24 
 
 		 436 aa  270  5e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2139  hypothetical protein  36.24 
 
 		 436 aa  269  7e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2077  hypothetical protein  36.24 
 
 		 436 aa  269  7e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2073  hypothetical protein  36.24 
 
 		 436 aa  269  7e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2319  hypothetical protein  36.24 
 
 		 436 aa  269  7e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2294  hypothetical protein  36.24 
 
 		 436 aa  269  7e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1682  hypothetical protein  36 
 
 		 436 aa  269  7e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63587  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  38.27 
 
 		 449 aa  269  8e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2328  hypothetical protein  36.24 
 
 		 436 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000223994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2402  hypothetical protein  36.24 
 
 		 436 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0371  aminotransferase  40.79 
 
 		 452 aa  268  1e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1249  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  36.09 
 
 		 453 aa  268  1e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  40.18 
 
 		 462 aa  268  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  38.06 
 
 		 451 aa  268  1e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  38.59 
 
 		 456 aa  268  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  38.01 
 
 		 449 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  38.01 
 
 		 449 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  38.01 
 
 		 449 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  38.01 
 
 		 449 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3075  aminotransferase class-III  42.79 
 
 		 437 aa  267  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116582  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  41.08 
 
 		 468 aa  267  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  38.01 
 
 		 449 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0283  hypothetical protein  38.85 
 
 		 457 aa  266  4e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  36.05 
 
 		 468 aa  266  5e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  37.73 
 
 		 454 aa  266  5e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  37.39 
 
 		 451 aa  266  5.999999999999999e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  38.01 
 
 		 449 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>