More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2051 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2051  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
364 aa  728    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0552963  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4621  RND family efflux transporter MFP subunit  32.31 
 
 
386 aa  183  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0157  hypothetical protein  31.94 
 
 
366 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03415  hypothetical protein  32.66 
 
 
371 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002593  membrane-fusion protein  33 
 
 
372 aa  168  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00429247  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1680  RND family efflux transporter MFP subunit  29.94 
 
 
360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.560813 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0171  RND family efflux transporter MFP subunit  30.56 
 
 
378 aa  163  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0618  RND family efflux transporter MFP subunit  28.41 
 
 
387 aa  162  7e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2511  RND family efflux transporter MFP subunit  30.68 
 
 
354 aa  161  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0216385  normal  0.245234 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2743  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.15 
 
 
358 aa  160  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.125422  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2624  RND family efflux transporter MFP subunit  27.48 
 
 
357 aa  151  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0520  secretion protein HlyD  31.4 
 
 
356 aa  150  4e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3333  RND family efflux transporter MFP subunit  26.29 
 
 
377 aa  149  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0868  RND family efflux transporter MFP subunit  28.82 
 
 
358 aa  149  7e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.231559  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2570  hypothetical protein  30.2 
 
 
370 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295981  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2113  RND family efflux transporter MFP subunit  32.66 
 
 
360 aa  147  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0988  secretion protein HlyD  26.7 
 
 
415 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0345  RND family efflux transporter MFP subunit  29.72 
 
 
360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0426386  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0510  RND family efflux transporter MFP subunit  29.86 
 
 
358 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0586812  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1163  efflux transporter  30.2 
 
 
383 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.707562  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2197  secretion protein HlyD  30.89 
 
 
446 aa  103  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.378347  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3208  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.76 
 
 
357 aa  90.9  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0146448  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2818  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.77 
 
 
349 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1783  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.92 
 
 
354 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1119  RND family efflux transporter MFP subunit  27.94 
 
 
369 aa  82  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000371819  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0703  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.75 
 
 
355 aa  80.5  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  24.04 
 
 
379 aa  79.7  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3362  RND family efflux transporter MFP subunit  24.45 
 
 
358 aa  78.6  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.69 
 
 
349 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99545  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0767  RND family efflux transporter MFP subunit  30 
 
 
372 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00075698  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.38 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000250075  normal  0.807389 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0341  RND family efflux transporter MFP subunit  25.85 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.666034  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1216  RND family efflux transporter MFP subunit  23.79 
 
 
379 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.152303  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2322  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 
371 aa  75.9  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0437768 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.47 
 
 
362 aa  76.3  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.13 
 
 
372 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1023  RND family efflux transporter MFP subunit  25.36 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.866452  normal  0.121232 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  25.17 
 
 
365 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.48 
 
 
336 aa  74.7  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000138483  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0445  putative auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  23.21 
 
 
408 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000283487 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0385  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  23.21 
 
 
408 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0391  putative auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  23.21 
 
 
408 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000301381 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  25.7 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0383  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.21 
 
 
408 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000626257 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0405  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  22.9 
 
 
408 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.738714  hitchhiker  0.0000278759 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.02 
 
 
351 aa  73.2  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0849  RND efflux system membrane fusion protein  25.22 
 
 
418 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8894  decreased coverage  0.000437743 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1796  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.47 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000436323  hitchhiker  0.00000011193 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2665  RND family efflux transporter MFP subunit  23.47 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000267288  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2550  RND family efflux transporter MFP subunit  23.47 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000229958  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4493  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.97 
 
 
367 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1466  RND family efflux transporter MFP subunit  26.79 
 
 
409 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1840  RND family efflux transporter MFP subunit  26.79 
 
 
409 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  28.5 
 
 
351 aa  72.4  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2144  multidrug efflux pump BpeE  26.79 
 
 
406 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0416  multidrug efflux pump BpeE  26.79 
 
 
406 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  24.9 
 
 
372 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0827  multidrug efflux pump BpeE  26.79 
 
 
406 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.747872  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.26 
 
 
380 aa  72.4  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.05 
 
 
396 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.27 
 
 
397 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.430357  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0630  secretion protein HlyD  27.42 
 
 
357 aa  71.2  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0232449  normal  0.116732 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0513  multidrug efflux pump BpeE  26.49 
 
 
409 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4534  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.7 
 
 
424 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452412  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0930  RND family efflux transporter MFP subunit  24.38 
 
 
366 aa  70.5  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2095  secretion protein HlyD  22.75 
 
 
354 aa  70.1  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1554  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.41 
 
 
363 aa  70.1  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0484603  hitchhiker  0.00000015248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.41 
 
 
363 aa  70.1  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2179  RND family efflux transporter MFP subunit  25.09 
 
 
361 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000248395  normal  0.140593 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  24.48 
 
 
372 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2106  RND family efflux transporter MFP subunit  27.31 
 
 
408 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553946  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.22 
 
 
396 aa  69.7  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3268  HlyD family secretion protein  24.66 
 
 
372 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  27.46 
 
 
351 aa  69.3  0.00000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0276  transporter, putative  23.02 
 
 
383 aa  68.9  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4492  secretion protein HlyD  24.79 
 
 
382 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0226833 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3707  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.88 
 
 
354 aa  68.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1982  RND family efflux transporter MFP subunit  26.52 
 
 
360 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000542821  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0091  RND family efflux transporter MFP subunit  31.39 
 
 
394 aa  69.3  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.666427  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1152  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.02 
 
 
435 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00127856  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0290  putative transporter  23.02 
 
 
383 aa  68.6  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2795  RND family efflux transporter MFP subunit  22.34 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2588  RND family efflux transporter MFP subunit  22.79 
 
 
360 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000707575  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  20.46 
 
 
360 aa  67.8  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4918  RND family efflux transporter MFP subunit  26.59 
 
 
405 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890764  normal  0.731397 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3014  secretion protein HlyD  26.59 
 
 
405 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.63 
 
 
379 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5352  RND family efflux transporter MFP subunit  26.59 
 
 
405 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730017  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03982  membrane fusion protein  25.15 
 
 
414 aa  67.4  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2243  RND family efflux transporter MFP subunit  26.26 
 
 
376 aa  67  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0151  RND family efflux transporter MFP subunit  22.5 
 
 
348 aa  67.4  0.0000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.961169  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1924  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.18 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.896235 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2224  multidrug efflux pump, membrane fusion protein  23.45 
 
 
388 aa  67  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4149  RND family efflux transporter MFP subunit  22.55 
 
 
372 aa  67  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.815582  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01755  hypothetical protein  25.08 
 
 
378 aa  67  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4699  RND family efflux transporter MFP subunit  26.59 
 
 
405 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4362  RND family efflux transporter MFP subunit  24.44 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  25.09 
 
 
352 aa  66.6  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0900  RND family efflux transporter MFP subunit  23.45 
 
 
388 aa  66.6  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1671  AcrA-like protein  21.43 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0632111  normal  0.139381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>