More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1620 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1620  transport system permease protein  100 
 
 		 350 aa  677    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1703  heme/hemin ABC transporter, permease protein  58.57 
 
 		 352 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0744  transport system permease protein  60.17 
 
 		 345 aa  397  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290337 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0466  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  48.41 
 
 		 347 aa  318  1e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2425  transport system permease protein  46.67 
 
 		 356 aa  278  8e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3530  transport system permease protein  45.09 
 
 		 365 aa  278  8e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1219  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  47.08 
 
 		 360 aa  276  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.11373  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0575  transport system permease protein  46.04 
 
 		 357 aa  276  5e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2250  transport system permease protein  43.7 
 
 		 356 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7623  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  47.13 
 
 		 354 aa  272  7e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2028  transport system permease protein  43.7 
 
 		 356 aa  268  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4419  transport system permease protein  46.41 
 
 		 355 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347706 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0282  transport system permease protein  43.11 
 
 		 371 aa  264  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.669954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3090  transport system permease protein  45.57 
 
 		 360 aa  260  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1695  transport system permease protein  44.73 
 
 		 354 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347986  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2734  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  46.41 
 
 		 347 aa  259  4e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000167037  hitchhiker  0.000165993 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0026  transport system permease protein  45.24 
 
 		 331 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3610  transport system permease protein  45.27 
 
 		 360 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7104  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  47.56 
 
 		 360 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3036  transport system permease protein  45.91 
 
 		 360 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1099  transport system permease protein  42.98 
 
 		 360 aa  239  4e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.122873  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1709  transport system permease protein  40.97 
 
 		 319 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0920  ABC transporter permease  42.03 
 
 		 359 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.421925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0806  ABC transporter permease  42.05 
 
 		 359 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.129539  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1239  transport system permease protein  46.49 
 
 		 360 aa  235  7e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0865  ABC transporter permease  41.76 
 
 		 359 aa  235  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0897  ABC transporter permease  41.16 
 
 		 359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.660141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0834  ABC transporter permease  40.87 
 
 		 359 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0798  transport system permease protein  44.74 
 
 		 343 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.180919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3222  transport system permease protein  44.91 
 
 		 360 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118278 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2756  transport system permease protein  43.35 
 
 		 360 aa  230  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2750  transport system permease protein  44.61 
 
 		 360 aa  229  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2668  iron chelate ABC transporter permease  44.61 
 
 		 360 aa  229  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1539  iron chelate ABC transporter permease  44.61 
 
 		 353 aa  229  6e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.337435 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2697  transport system permease protein  42.12 
 
 		 352 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2719  transport system permease protein  44.62 
 
 		 352 aa  227  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000728456  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  38.33 
 
 		 367 aa  225  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2634  iron chelate ABC transporter permease protein  44.3 
 
 		 352 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000212766  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2568  transport system permease protein  46.2 
 
 		 344 aa  223  4.9999999999999996e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0538415  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  39.65 
 
 		 362 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  39 
 
 		 373 aa  211  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  37.62 
 
 		 355 aa  204  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  37.43 
 
 		 350 aa  204  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  36.3 
 
 		 355 aa  203  4e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4770  transport system permease protein  43.97 
 
 		 353 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  32.8 
 
 		 360 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0431  transport system permease protein  36.31 
 
 		 374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  36.21 
 
 		 357 aa  196  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  34.98 
 
 		 359 aa  195  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  31.36 
 
 		 348 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  34.58 
 
 		 383 aa  192  6e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  35.59 
 
 		 370 aa  191  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  30.51 
 
 		 348 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  33.02 
 
 		 348 aa  189  4e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  33.81 
 
 		 375 aa  187  3e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1186  transport system permease protein  35.9 
 
 		 369 aa  186  4e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  34.45 
 
 		 357 aa  186  6e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3058  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  33.04 
 
 		 346 aa  185  9e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  38.36 
 
 		 362 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  31.39 
 
 		 354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  31.79 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  32.78 
 
 		 356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  31.27 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2398  hypothetical protein  37.58 
 
 		 361 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1623  iron(III) dicitrate transport system permease protein  32.19 
 
 		 356 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0877318  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1822  transport system permease protein  35.01 
 
 		 350 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1041  transport system permease protein  37.37 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0274  transport system permease protein  33.78 
 
 		 358 aa  181  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00246015  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  34.71 
 
 		 347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1353  transport system permease protein  37.5 
 
 		 363 aa  179  4e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  31.64 
 
 		 340 aa  179  9e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0290  transport system permease protein  32.18 
 
 		 361 aa  178  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.602088  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1048  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  35.95 
 
 		 336 aa  177  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.522195  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  31.46 
 
 		 349 aa  176  5e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  35.1 
 
 		 352 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  39.43 
 
 		 351 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  35.49 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  34.57 
 
 		 330 aa  169  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4080  transport system permease protein  35.94 
 
 		 347 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  33.55 
 
 		 347 aa  167  2.9999999999999998e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  34.85 
 
 		 370 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  35.71 
 
 		 381 aa  166  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0485  transport system permease protein  29.3 
 
 		 357 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.644371  hitchhiker  0.000336075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  33.33 
 
 		 355 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1652  transport system permease protein  34.55 
 
 		 357 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  35.76 
 
 		 341 aa  163  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  31.1 
 
 		 343 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3915  transport system permease protein  36.3 
 
 		 332 aa  162  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  37.5 
 
 		 334 aa  162  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  37.5 
 
 		 334 aa  162  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  35.21 
 
 		 315 aa  161  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  32.72 
 
 		 345 aa  161  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  30.17 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0463  hemin permease  33.72 
 
 		 351 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  29.57 
 
 		 337 aa  161  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  30.12 
 
 		 356 aa  160  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0220  transport system permease protein  33.33 
 
 		 356 aa  160  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  31.85 
 
 		 343 aa  160  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  33.7 
 
 		 371 aa  160  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2874  transport system permease protein  36.2 
 
 		 360 aa  160  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>