More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3210 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3210  response regulator receiver protein  100 
 
 		 124 aa  246  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2765  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.557597  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0418  response regulator receiver protein  42.28 
 
 		 123 aa  100  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.22885  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4110  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2234  response regulator receiver domain-containing protein  40.34 
 
 		 130 aa  94.4  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1291  response regulator  41.8 
 
 		 123 aa  93.6  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2047  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637102 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2817  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1827  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.32093  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2012  response regulator receiver domain-containing protein  39.32 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.631712 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0891  response regulator receiver domain-containing protein  43.44 
 
 		 137 aa  89.4  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2758  response regulator receiver domain-containing protein  42.98 
 
 		 122 aa  88.6  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1018  response regulator receiver domain-containing protein  39.32 
 
 		 131 aa  87.4  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1214  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 125 aa  87.4  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.678516  hitchhiker  0.000513941 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1786  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4753  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 		 630 aa  82.8  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0649  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  40.98 
 
 		 387 aa  81.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.736737  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2171  response regulator receiver protein  40.57 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1858  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2359  putative two-component response regulator  43.93 
 
 		 394 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3577  response regulator receiver protein  42.99 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1404  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 119 aa  80.1  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1338  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.376219 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0945  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428151  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1682  response regulator receiver modulated serine phosphatase  42.06 
 
 		 412 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0585  DNA-binding response regulator  33.88 
 
 		 230 aa  77.8  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00125793  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2828  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 410 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2165  response regulator  42.06 
 
 		 393 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0249002  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1392  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1706  response regulator receiver modulated serine phosphatase  42.06 
 
 		 393 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000168842 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27940  putative two-component response regulator  42.99 
 
 		 394 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3413  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.25 
 
 		 453 aa  77  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2877  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.412079  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  36.89 
 
 		 265 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0693  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.87 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1333  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2117  response regulator  39.25 
 
 		 394 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0129975  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6438  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.43 
 
 		 394 aa  76.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00615091  normal  0.383003 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1912  response regulator receiver:stage II sporulation E  39.25 
 
 		 394 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.432168  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3151  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276361  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0953  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0255772  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.05 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3475  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.61 
 
 		 453 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0804749 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0237  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.390769  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0776  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000835167  normal  0.370558 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.71 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0960  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3849  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  40.19 
 
 		 412 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.22 
 
 		 221 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0788  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 634 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2019  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 		 1016 aa  74.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.25506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2461  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.98 
 
 		 581 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2022  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.79 
 
 		 589 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0532  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  32 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.693911  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0064  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2177  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2841  response regulator receiver protein  35.24 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0584  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 216 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0767221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16930  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2561  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  34.45 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  34.17 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0811  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3211  response regulator receiver domain-containing protein  34.17 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000097826 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2533  response regulator receiver domain-containing protein  37.19 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  34.17 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4841  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202718  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5047  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 387 aa  72  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2939  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.302842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4389  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 495 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205713  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002219  copper-sensing two-component system response regulator CpxR  34.71 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000572967  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4747  CheA signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 941 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159984 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2244  response regulator receiver protein  41.12 
 
 		 119 aa  72  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.502053  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00149  transcriptional regulator CpxR  35.54 
 
 		 229 aa  72  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  36.36 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1929  response regulator receiver protein  40.19 
 
 		 394 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.310245 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08281  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family protein  37.19 
 
 		 388 aa  72.8  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1097  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 		 915 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1797  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.36 
 
 		 461 aa  72  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.774224  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3461  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 122 aa  72  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5381  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0242785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1443  sensor histidine kinase/response regulator  34.38 
 
 		 654 aa  72  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.676986  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1858  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.43 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2018  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 447 aa  72  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0722  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1243  histidine kinase  36.07 
 
 		 654 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0706231 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  32.77 
 
 		 233 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  32.77 
 
 		 233 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1544  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.98 
 
 		 739 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.498595 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>