More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2533 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2533  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 125 aa  252  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3210  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2177  response regulator receiver protein  29.06 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3129  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  32.77 
 
 		 480 aa  67  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.736803  normal  0.276266 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1908  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 473 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1971  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.6 
 
 		 473 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0887215  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1618  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  33.05 
 
 		 486 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2056  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.6 
 
 		 473 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.732718  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3740  response regulator receiver protein  31.43 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.119956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  32.23 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1016  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.66 
 
 		 243 aa  64.7  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1269  two component transcriptional regulator  38.52 
 
 		 228 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2927  two component transcriptional regulator  38.52 
 
 		 228 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1658  response regulator/GGDEF domain-containing protein  32.41 
 
 		 458 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.939598  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0548  response regulator receiver and Hpt phospho transfer protein  32.41 
 
 		 570 aa  64.3  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.8 
 
 		 221 aa  64.3  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0418  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.22885  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0945  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428151  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1248  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2129  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2939  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.302842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2359  putative two-component response regulator  32.79 
 
 		 394 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1404  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2739  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 451 aa  63.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.693002  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0302  two component transcriptional regulator, winged helix family  32 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2174  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 		 633 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.634157  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0157  response regulator receiver protein  31.07 
 
 		 123 aa  63.5  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2109  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.67 
 
 		 515 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27940  putative two-component response regulator  34.55 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1951  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 470 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1377  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.56 
 
 		 462 aa  62  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.244526  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  35.04 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  35.04 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 119 aa  62  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2047  response regulator receiver protein  30.33 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637102 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2817  response regulator receiver protein  30.33 
 
 		 157 aa  62  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.93 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1837  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  31.36 
 
 		 480 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1832  two component transcriptional regulator  35.77 
 
 		 245 aa  61.6  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.366424  normal  0.561636 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0485  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  32.5 
 
 		 482 aa  61.2  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0514361  normal  0.01861 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1865  response regulator receiver  33.61 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4591  two component transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 265 aa  61.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3131  response regulator receiver domain-containing protein  30.71 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.164774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4025  two component LuxR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 230 aa  61.2  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.236685 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3065  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4379  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3791  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0790  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.04 
 
 		 466 aa  60.8  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  29.91 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2891  response regulator receiver protein  28.33 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486665  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0811  nitrogen regulation protein NtrX  29.66 
 
 		 456 aa  60.5  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.686874  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0604  response regulator receiver protein  37.14 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.72319  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5015  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263321  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2863  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  30.51 
 
 		 480 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2882  nitrogen metabolism transcriptional regulator NtrC  30.51 
 
 		 480 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2590  nitrogen metabolism transcriptional regulator NtrC  30.51 
 
 		 480 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.858566  normal  0.0152229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 237 aa  60.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1678  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  31.09 
 
 		 481 aa  60.5  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.510429  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0532  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  28.91 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.693911  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1338  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.376219 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3335  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  30 
 
 		 458 aa  60.5  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0671  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 		 857 aa  60.1  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269812 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3200  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.61 
 
 		 256 aa  60.1  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000259787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2578  nitrogen metabolism transcriptional regulator NtrC  30.51 
 
 		 480 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152448  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1310  DNA-binding response regulator  32.2 
 
 		 226 aa  60.1  0.000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3475  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.52 
 
 		 453 aa  60.1  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0804749 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3413  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.52 
 
 		 453 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  33.59 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.88 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4070  nitrogen metabolism transcriptional regulator NtrC  30.51 
 
 		 480 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.131979  normal  0.446618 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2135  nitrogen regulation protein NR(I)  30.51 
 
 		 483 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.13203  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1662  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 		 396 aa  59.3  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3601  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000651793  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4399  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  29.66 
 
 		 482 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.222867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0031  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.17 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0359  two component transcriptional regulator  34.45 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274157  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1492  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 		 1029 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  31.9 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.2 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2901  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191122  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2332  response regulator receiver domain-containing protein  31.2 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0126  response regulator receiver domain-containing protein  28.1 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0666  response regulator receiver  33.04 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3021  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.19 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  34.78 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0355  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  30.17 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  34.4 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  33.59 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3067  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.19 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.51 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  32.23 
 
 		 969 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0901  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3578  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.677729  normal  0.0425656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3021  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.381292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.76 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.03 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>