More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1059 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  100 
 
 		 277 aa  566  1e-160  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  46.79 
 
 		 271 aa  249  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  51.63 
 
 		 279 aa  246  3e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  47.13 
 
 		 271 aa  245  4.9999999999999997e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  48.03 
 
 		 281 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  46.03 
 
 		 273 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  50.39 
 
 		 273 aa  244  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  47.57 
 
 		 272 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  46.98 
 
 		 297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  49.81 
 
 		 270 aa  238  5.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  49.6 
 
 		 271 aa  238  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  46 
 
 		 284 aa  235  5.0000000000000005e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  48.86 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  46.96 
 
 		 282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  47.51 
 
 		 281 aa  233  3e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  48.05 
 
 		 279 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  45.83 
 
 		 281 aa  230  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  47.01 
 
 		 273 aa  229  5e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  43.56 
 
 		 286 aa  227  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  46.67 
 
 		 274 aa  226  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  46.37 
 
 		 276 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  44.58 
 
 		 289 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  43.73 
 
 		 286 aa  224  2e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  44.84 
 
 		 280 aa  223  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  46.99 
 
 		 302 aa  223  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  42.05 
 
 		 269 aa  221  7e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  45.56 
 
 		 291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  44.53 
 
 		 277 aa  218  7e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  44.36 
 
 		 275 aa  217  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  39.56 
 
 		 288 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  45.7 
 
 		 278 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  43.32 
 
 		 276 aa  214  9e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  46.01 
 
 		 275 aa  214  9.999999999999999e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  44.53 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  44.92 
 
 		 269 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  41.5 
 
 		 274 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  41.5 
 
 		 274 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  43.98 
 
 		 263 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  41.76 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  40.64 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  45.1 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  41.37 
 
 		 294 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  41.09 
 
 		 311 aa  209  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2843  transketolase subunit A  44.44 
 
 		 276 aa  209  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.140333  normal  0.2899 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  45.82 
 
 		 689 aa  209  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  42.91 
 
 		 274 aa  209  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  47.08 
 
 		 278 aa  209  5e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  47.19 
 
 		 279 aa  208  7e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  42.91 
 
 		 274 aa  208  9e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  44.92 
 
 		 269 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  42.98 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.23 
 
 		 555 aa  206  3e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2527  transketolase domain protein  44.06 
 
 		 276 aa  205  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.336828 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  43.9 
 
 		 273 aa  205  5e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2582  transketolase domain-containing protein  44.06 
 
 		 276 aa  205  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2482  transketolase domain protein  43.68 
 
 		 276 aa  205  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2690  transketolase domain-containing protein  43.68 
 
 		 276 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.277704 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3643  Transketolase domain protein  45.45 
 
 		 267 aa  202  5e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2570  transketolase domain protein  43.3 
 
 		 276 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.479984  normal  0.537174 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  42.16 
 
 		 297 aa  199  6e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  43.85 
 
 		 277 aa  198  7e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  43.72 
 
 		 281 aa  198  9e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  44.4 
 
 		 276 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3529  Transketolase domain protein  44.07 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  39.92 
 
 		 275 aa  196  3e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  40.3 
 
 		 275 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  42.01 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  40.32 
 
 		 275 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  45.62 
 
 		 283 aa  195  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0861  Transketolase domain protein  40.74 
 
 		 299 aa  195  7e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  45.81 
 
 		 276 aa  195  8.000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3383  transketolase domain-containing protein  45.81 
 
 		 276 aa  195  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3249  putative transketolase. N-terminal subunit  45.81 
 
 		 276 aa  194  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0795  Transketolase domain protein  43.64 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  39.42 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  38.89 
 
 		 275 aa  194  2e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4274  transketolase domain-containing protein  41.38 
 
 		 287 aa  191  9e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1147  Transketolase domain protein  41.32 
 
 		 271 aa  191  1e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5276  transketolase domain-containing protein  40.54 
 
 		 282 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2288  transketolase domain-containing protein  42.15 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0407  Transketolase domain protein  40.65 
 
 		 307 aa  189  5.999999999999999e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  39.62 
 
 		 621 aa  187  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  39.69 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0615  transketolase subunit A  45.64 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828068 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4382  Transketolase domain protein  39.85 
 
 		 285 aa  186  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1587  transketolase, N-terminal subunit  39.17 
 
 		 252 aa  186  4e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  37.55 
 
 		 303 aa  185  7e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0728  transketolase domain-containing protein  41.22 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3311  Transketolase domain protein  39.16 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2719  transketolase subunit A  39.76 
 
 		 282 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2569  transketolase domain-containing protein  43.94 
 
 		 274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.818868  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2656  transketolase, N-terminal subunit  43.38 
 
 		 311 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.653892  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2614  transketolase domain-containing protein  39.47 
 
 		 285 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.336925  normal  0.70131 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1461  transketolase subunit A  39.7 
 
 		 279 aa  181  9.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  40.89 
 
 		 640 aa  181  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1184  Transketolase domain protein  39.42 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2131  transketolase, N-terminal subunit  43.94 
 
 		 274 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.805825  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3183  transketolase, N-terminal subunit  43.94 
 
 		 274 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2516  transketolase domain-containing protein  43.94 
 
 		 274 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499575  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1405  transketolase, N-terminal subunit  43.94 
 
 		 274 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0485519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>