More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_02710 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_2771  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  54.95 
 
 
572 aa  635    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2703  pyruvate dehydrogenase  57.14 
 
 
573 aa  657    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0935  pyruvate dehydrogenase  55.36 
 
 
572 aa  641    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2510  pyruvate dehydrogenase  58.17 
 
 
572 aa  679    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2725  pyruvate dehydrogenase  54.95 
 
 
572 aa  635    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1589  pyruvate dehydrogenase  56.97 
 
 
573 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2314  pyruvate dehydrogenase  56.99 
 
 
601 aa  668    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.493557  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2788  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  64.29 
 
 
578 aa  721    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.987771  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1664  pyruvate dehydrogenase  57.67 
 
 
573 aa  671    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.265267  normal  0.610724 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5205  pyruvate dehydrogenase  54.91 
 
 
573 aa  639    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.799967  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02710  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 
571 aa  1157    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0892  pyruvate dehydrogenase  58.13 
 
 
576 aa  676    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129247  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1843  pyruvate dehydrogenase  57.12 
 
 
577 aa  667    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.528367  normal  0.413476 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0203  pyruvate dehydrogenase  58.29 
 
 
576 aa  681    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0234842 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0970  pyruvate dehydrogenase  55.18 
 
 
572 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2374  pyruvate dehydrogenase  58.17 
 
 
573 aa  669    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5095  pyruvate dehydrogenase  54.66 
 
 
573 aa  640    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0038503 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1002  pyruvate dehydrogenase  55.18 
 
 
572 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.244882  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1033  pyruvate dehydrogenase  55.18 
 
 
572 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1677  pyruvate dehydrogenase  58.68 
 
 
577 aa  661    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.50308  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5157  pyruvate dehydrogenase  54.91 
 
 
573 aa  639    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1032  pyruvate dehydrogenase  55.01 
 
 
572 aa  635    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1052  pyruvate dehydrogenase  55.18 
 
 
572 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3312  pyruvate dehydrogenase  54.74 
 
 
573 aa  639    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653262  normal  0.0298964 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3125  pyruvate dehydrogenase  54.29 
 
 
574 aa  636    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.765369  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2619  pyruvate dehydrogenase  57.14 
 
 
573 aa  656    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1564  pyruvate dehydrogenase  57.29 
 
 
577 aa  667    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.48094  normal  0.707647 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0024  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  62.02 
 
 
578 aa  701    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.338176  normal  0.262087 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1531  pyruvate dehydrogenase  58.81 
 
 
576 aa  696    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.885242  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00876  pyruvate dehydrogenase  54.77 
 
 
572 aa  634  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.688216  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2460  pyruvate dehydrogenase  55.01 
 
 
572 aa  634  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00882  hypothetical protein  54.77 
 
 
572 aa  634  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.731415  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0944  pyruvate dehydrogenase  54.66 
 
 
572 aa  632  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0900  pyruvate dehydrogenase  54.83 
 
 
572 aa  633  1e-180  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4864  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  57.72 
 
 
575 aa  634  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.662059  normal  0.681862 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0975  pyruvate dehydrogenase  55.01 
 
 
572 aa  634  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03967  pyruvate dehydrogenase  54.72 
 
 
575 aa  633  1e-180  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2858  pyruvate dehydrogenase  54.28 
 
 
573 aa  629  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21878  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4140  pyruvate dehydrogenase  54.04 
 
 
573 aa  628  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4792  pyruvate dehydrogenase  54.21 
 
 
573 aa  631  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3376  pyruvate dehydrogenase  54.21 
 
 
573 aa  631  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2219  pyruvate dehydrogenase  57.72 
 
 
572 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.372281  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0699  pyruvate dehydrogenase  57.72 
 
 
572 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1387  pyruvate dehydrogenase  54.48 
 
 
572 aa  627  1e-178  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2302  pyruvate dehydrogenase  57.89 
 
 
572 aa  623  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1650  pyruvate dehydrogenase  57.54 
 
 
572 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1728  pyruvate dehydrogenase  57.54 
 
 
576 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0611  pyruvate dehydrogenase  57.54 
 
 
576 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.69435  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1935  pyruvate dehydrogenase  57.54 
 
 
572 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.935279  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2816  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  54.55 
 
 
577 aa  620  1e-176  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3833  pyruvate dehydrogenase  55.36 
 
 
583 aa  609  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2427  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  50.61 
 
 
574 aa  607  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0700684  normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0284  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  53.32 
 
 
579 aa  583  1.0000000000000001e-165  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.600747  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01410  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  49.91 
 
 
591 aa  548  1e-154  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22790  pyruvate dehydrogenase  50.09 
 
 
578 aa  543  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.998017  normal  0.640022 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0367  pyruvate dehydrogenase  49.57 
 
 
579 aa  536  1e-151  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384564  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3149  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  47.21 
 
 
572 aa  523  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0282907  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0214  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  46.69 
 
 
588 aa  514  1e-144  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0590  pyruvate dehydrogenase  46.75 
 
 
582 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3808  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  48.17 
 
 
582 aa  508  9.999999999999999e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0720  pyruvate dehydrogenase  46.14 
 
 
582 aa  504  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69925  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  47 
 
 
572 aa  505  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0553  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  45.23 
 
 
576 aa  502  1e-141  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3196  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  48.56 
 
 
589 aa  501  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000534651 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6071  pyruvate dehydrogenase  47.17 
 
 
572 aa  498  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1010  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  43.25 
 
 
573 aa  483  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9103  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  48.98 
 
 
577 aa  482  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2249  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  41.43 
 
 
579 aa  479  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0404885  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2791  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain-containing protein  45.68 
 
 
576 aa  480  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0635028  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2307  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  41.36 
 
 
578 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.401078  normal  0.110885 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2294  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  41.36 
 
 
578 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.879055  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2031  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  41.19 
 
 
578 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0972  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  43.14 
 
 
581 aa  465  9.999999999999999e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3383  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  45.07 
 
 
571 aa  464  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2187  thiamine pyrophosphate protein central region  43.06 
 
 
572 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1899  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  41.62 
 
 
570 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02520  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  46.8 
 
 
583 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3372  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  42.78 
 
 
576 aa  435  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0736  pyruvate dehydrogenase [cytochrome]  39.53 
 
 
563 aa  424  1e-117  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7374  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  37.15 
 
 
576 aa  352  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.693349 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2201  pyruvate oxidase  33.57 
 
 
566 aa  336  7.999999999999999e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0998219  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2122  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  34.64 
 
 
584 aa  335  2e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1986  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  33.21 
 
 
549 aa  332  2e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2152  pyruvate oxidase  33.39 
 
 
566 aa  332  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2360  pyruvate oxidase  33.57 
 
 
566 aa  331  3e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2495  pyruvate oxidase  33.39 
 
 
566 aa  330  4e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.667676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2426  pyruvate oxidase  33.39 
 
 
566 aa  330  6e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0695657  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2151  pyruvate oxidase  37 
 
 
584 aa  327  3e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2615  pyruvate oxidase  31.28 
 
 
579 aa  321  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2562  pyruvate oxidase  31.28 
 
 
579 aa  321  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0784  thiamine pyrophosphate protein  37.15 
 
 
608 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0772  thiamine pyrophosphate protein  37.15 
 
 
608 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0548988  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6370  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  33.57 
 
 
599 aa  313  3.9999999999999997e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.529318 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0946  thiamine pyrophosphate protein  37.15 
 
 
744 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.217897  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37340  thiamine pyrophosphate protein  37.7 
 
 
590 aa  307  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000027158  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3203  thiamine pyrophosphate protein  37.52 
 
 
590 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5492  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.53 
 
 
597 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.165409  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2115  pyruvate oxidase  29.54 
 
 
579 aa  306  9.000000000000001e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.100527  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3445  thiamine pyrophosphate protein  35.3 
 
 
596 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.663093  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5505  thiamine pyrophosphate protein  37.54 
 
 
606 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.363102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>