More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0896 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0896  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  798    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.143199  hitchhiker  0.00101666 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  30.69 
 
 
390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  27.73 
 
 
365 aa  129  9.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  27.73 
 
 
365 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  32.15 
 
 
375 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  38.66 
 
 
348 aa  125  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  27.47 
 
 
365 aa  124  2e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  27.4 
 
 
399 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  29.47 
 
 
346 aa  122  8e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  30.31 
 
 
376 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.84 
 
 
372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  29.37 
 
 
379 aa  117  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  28.16 
 
 
366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
361 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  40.74 
 
 
374 aa  113  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.99 
 
 
396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  28.98 
 
 
369 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  29.58 
 
 
309 aa  107  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 
365 aa  106  8e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1214  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.86 
 
 
374 aa  105  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1384  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.74 
 
 
373 aa  104  3e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 
386 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 
364 aa  99.4  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  30.89 
 
 
368 aa  99.4  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.62 
 
 
465 aa  98.6  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0453  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  26.99 
 
 
374 aa  97.4  3e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1179  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 
373 aa  97.4  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.383911  hitchhiker  0.00245828 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1199  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 
356 aa  97.4  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0236987  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02449  Glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 
376 aa  96.7  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.634775  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.55 
 
 
377 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108704  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 
365 aa  95.1  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  28.17 
 
 
370 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13013  wlae protein  29.07 
 
 
321 aa  94  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 
385 aa  93.6  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2217  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
385 aa  92.8  9e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  25.06 
 
 
366 aa  92.8  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.06 
 
 
366 aa  92  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  25.07 
 
 
347 aa  91.7  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1431  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.76 
 
 
498 aa  90.9  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 
361 aa  91.3  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  36.63 
 
 
396 aa  90.9  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 
368 aa  90.5  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  29.67 
 
 
419 aa  90.1  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
394 aa  89.4  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  31.06 
 
 
360 aa  89  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.84 
 
 
420 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.84 
 
 
392 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.84 
 
 
420 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.84 
 
 
392 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.84 
 
 
420 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.38 
 
 
415 aa  89  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 
375 aa  89  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.84 
 
 
420 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.84 
 
 
420 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
377 aa  88.2  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
346 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 
390 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1772  glycosyl transferase, group 1  30.59 
 
 
359 aa  87.4  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1699  glycosyl transferase, group 1  35.76 
 
 
357 aa  86.7  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5440  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.27 
 
 
372 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 
353 aa  86.3  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4682  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.15 
 
 
356 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0529  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 
376 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.61936  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  25.77 
 
 
355 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3477  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 
418 aa  85.9  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  25.95 
 
 
384 aa  85.9  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 
393 aa  85.9  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4991  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.3 
 
 
376 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  29.66 
 
 
1032 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
419 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  33.72 
 
 
360 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
414 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
409 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3889  glycosyl transferase, group 1  32.93 
 
 
356 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3984  glycosyl transferase, group 1  32.93 
 
 
356 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4093  glycosyl transferase, group 1  32.93 
 
 
356 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 
419 aa  83.2  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0370  glycosyl transferase group 1  33.13 
 
 
401 aa  83.2  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0012  a-glycosyltransferase  28.74 
 
 
379 aa  83.2  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 
356 aa  82.8  0.000000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0956  general glycosylation pathway protein  25.16 
 
 
347 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.812105  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4332  glycosyl transferase group 1  33.54 
 
 
356 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4277  glycosyl transferase group 1  33.54 
 
 
356 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0432  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 
350 aa  81.6  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4472  glycosyl transferase group 1  33.54 
 
 
356 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
360 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0846  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
393 aa  81.3  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3400  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.99 
 
 
423 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000326761 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11043  glycosyltransferase  27.27 
 
 
377 aa  81.3  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.265999  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3918  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  28.99 
 
 
363 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0109965 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4580  glycosyl transferase, group 1  29.71 
 
 
378 aa  80.9  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  28.29 
 
 
346 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  29.87 
 
 
345 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 
361 aa  79.7  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.72 
 
 
371 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3937  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  28.4 
 
 
359 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  35.47 
 
 
371 aa  79  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>