193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0816 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0816  membrane protein-like protein  100 
 
 		 357 aa  690    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0862  permease  72.52 
 
 		 356 aa  512  1e-144  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.254841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0016  permease  68.56 
 
 		 359 aa  427  1e-118  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1107  permease  50.56 
 
 		 350 aa  325  8.000000000000001e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0664  permease  43.31 
 
 		 386 aa  276  3e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.7223  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0828  permease  42.21 
 
 		 361 aa  277  3e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000427926  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_877  permease  45.2 
 
 		 343 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1323  permease  43.92 
 
 		 389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2072  permease  43.92 
 
 		 392 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1802  permease  43.55 
 
 		 362 aa  269  5e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0556  permease  44.96 
 
 		 390 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0944  transporter  42.57 
 
 		 347 aa  263  3e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1748  permease  42.53 
 
 		 362 aa  263  3e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000179413  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0753  permease  44.51 
 
 		 389 aa  251  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0377989 
 
 
-
 
NC_002936  DET1006  permease, putative  44.35 
 
 		 343 aa  249  4e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0459509  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1899  permease  48.29 
 
 		 350 aa  249  6e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0700  permease  42.37 
 
 		 359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1485  permease  40.96 
 
 		 393 aa  238  8e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.363242  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0456  permease  38.27 
 
 		 367 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.349904  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0893  permease  45.48 
 
 		 343 aa  232  6e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3597  permease  37.78 
 
 		 461 aa  229  5e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.306889 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1904  permease  37.66 
 
 		 433 aa  226  6e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.560761  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1478  permease  40.68 
 
 		 389 aa  225  8e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.177676  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2877  permease  41.97 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20090  permease  40.79 
 
 		 393 aa  223  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0184  hypothetical protein  37.59 
 
 		 437 aa  208  9e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1855  permease  47.52 
 
 		 489 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146115  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1323  permease  49.32 
 
 		 452 aa  135  7.000000000000001e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0701  permease  52.71 
 
 		 479 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  25.44 
 
 		 368 aa  83.2  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  23.33 
 
 		 363 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0503  hypothetical protein  22.92 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2338  permease  20.71 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.677868  normal  0.0877008 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3823  permease  20.71 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  22.19 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  26.32 
 
 		 352 aa  72.8  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  23.62 
 
 		 294 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05267  hypothetical protein  22.85 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08200  permease  22.95 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119775  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  22.66 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  20.68 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02580  hypothetical protein  22.13 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  23.65 
 
 		 316 aa  67  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01499  hypothetical protein  22.13 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  22.48 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  22.4 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  23.18 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  21.66 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  25.16 
 
 		 402 aa  66.2  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03018  predicted permease  25.45 
 
 		 346 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3621  putative permease  25.45 
 
 		 346 aa  65.9  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02969  hypothetical protein  25.45 
 
 		 346 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  22.29 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  20.82 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  24.13 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  23.23 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0523  permease  25.82 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3343  putative permease  25.81 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  22.26 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0554  permease  25.81 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4470  putative permease  25.81 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0547  permease  25.81 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.713723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3446  putative permease  25.27 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3797  putative permease  22.04 
 
 		 333 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236031 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  22.44 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3596  hypothetical protein  21.11 
 
 		 373 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3989  putative permease  21.71 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531766  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  21.28 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  28.09 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  21.14 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  22.54 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  24.38 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1936  putative permease  44.07 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0118434  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  21.74 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0147  putative permease  21.59 
 
 		 359 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  21.5 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  21.48 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  22.69 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  23.01 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  22.84 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0158  permease  23.03 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  20 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  21.28 
 
 		 336 aa  57  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  21.43 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  21.68 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  21.9 
 
 		 381 aa  56.2  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  24.36 
 
 		 341 aa  55.8  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  21.59 
 
 		 330 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  20 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  23.81 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3415  permease  22.5 
 
 		 351 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  20.74 
 
 		 315 aa  53.9  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  20.72 
 
 		 350 aa  54.3  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  22.08 
 
 		 352 aa  53.9  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  20.51 
 
 		 315 aa  53.9  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  22.87 
 
 		 322 aa  53.5  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  20.47 
 
 		 317 aa  53.5  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  21.59 
 
 		 315 aa  53.1  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  18.93 
 
 		 367 aa  53.1  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6565  permease  26.33 
 
 		 351 aa  52.8  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.200015  hitchhiker  0.00274163 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>