More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1442 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
781 aa  1606    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371477  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
628 aa  221  3e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
984 aa  211  4e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 
629 aa  207  6e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0821  putative PAS/PAC sensor protein  25.84 
 
 
715 aa  204  5e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.99772  normal  0.688187 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2127  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 
621 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0793237  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
625 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2876  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 
930 aa  198  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2092  putative PAS/PAC sensor protein  27.89 
 
 
628 aa  189  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.180005  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0160  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
729 aa  182  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.401412  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  31.06 
 
 
631 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0885  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 
830 aa  174  6.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2222  histidine kinase  29.96 
 
 
605 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0226681 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1433  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 
974 aa  163  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.717996  normal  0.840517 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2845  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 
545 aa  150  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000115656  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03078  sensor histidine kinase  28.05 
 
 
678 aa  145  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1435  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 
512 aa  145  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
511 aa  146  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  26.68 
 
 
599 aa  145  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.84 
 
 
708 aa  142  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.06 
 
 
934 aa  140  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.15 
 
 
889 aa  139  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  25.79 
 
 
591 aa  139  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.9 
 
 
1058 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0955  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 
765 aa  138  4e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4310  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28 
 
 
631 aa  138  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.917762  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 
489 aa  137  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4200  multi-sensor hybrid histidine kinase  28 
 
 
678 aa  137  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.679083  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1811  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.38 
 
 
1085 aa  137  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.532209 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.39 
 
 
1331 aa  137  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0447  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.99 
 
 
662 aa  136  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.48 
 
 
625 aa  137  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  24.23 
 
 
762 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.16 
 
 
1002 aa  136  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1963  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 
642 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.743491  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.48 
 
 
581 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.81 
 
 
663 aa  136  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658614  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  23.35 
 
 
584 aa  135  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2982  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 
608 aa  135  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.49 
 
 
835 aa  134  5e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.74 
 
 
582 aa  134  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.21 
 
 
1808 aa  134  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
1010 aa  134  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  25.26 
 
 
581 aa  134  9e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3202  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.68 
 
 
896 aa  134  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1040  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 
590 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 
593 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.21 
 
 
1297 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 
590 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.128603 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.83 
 
 
453 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 
408 aa  132  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.32 
 
 
631 aa  132  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.963931  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.52 
 
 
584 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.53 
 
 
1559 aa  131  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05068  composite two-component sensor histidine kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  27.34 
 
 
676 aa  131  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5276  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 
579 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.606728  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.15 
 
 
608 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.16 
 
 
720 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 
581 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1997  histidine kinase/response regulator hybrid protein  27.56 
 
 
558 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.947527  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 
1255 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.97 
 
 
584 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.89 
 
 
1501 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2933  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.9 
 
 
806 aa  129  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.907124  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.85 
 
 
612 aa  128  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.05 
 
 
590 aa  129  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.84 
 
 
444 aa  128  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1922  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.32 
 
 
558 aa  128  5e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0779  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.93 
 
 
754 aa  127  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.19 
 
 
1267 aa  127  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0468  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.89 
 
 
596 aa  127  9e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0987  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 
451 aa  126  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 
590 aa  126  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3795  histidine kinase  33.77 
 
 
725 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.421724 
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  25.25 
 
 
581 aa  126  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.7 
 
 
585 aa  126  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.84 
 
 
456 aa  126  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  26.12 
 
 
794 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.89 
 
 
1184 aa  126  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.57 
 
 
939 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1005  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 
646 aa  125  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442988  decreased coverage  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 
460 aa  125  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  24.22 
 
 
587 aa  124  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.87 
 
 
763 aa  124  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.508031  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.52 
 
 
458 aa  124  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.26 
 
 
1478 aa  124  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.39 
 
 
1965 aa  124  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  24.01 
 
 
587 aa  124  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  27.38 
 
 
1399 aa  123  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0568  histidine kinase  22.7 
 
 
669 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.68 
 
 
1363 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.12 
 
 
1330 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1630  sensory box histidine kinase  24.73 
 
 
710 aa  123  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00580838  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  23.8 
 
 
587 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.68 
 
 
596 aa  123  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  25.1 
 
 
587 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  23.8 
 
 
587 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  23.8 
 
 
587 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 
713 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.908922  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0706  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.44 
 
 
611 aa  123  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174577  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>