More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0487 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0487  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
411 aa  853    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.168849  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0701  Extracellular ligand-binding receptor  25.41 
 
 
377 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0183935  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0404  extracellular ligand-binding receptor  24.78 
 
 
409 aa  96.7  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0168747  normal  0.259327 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  22.51 
 
 
385 aa  93.2  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6002  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  23.68 
 
 
389 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.0284097 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4482  extracellular ligand-binding receptor  23.42 
 
 
371 aa  83.2  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  24.32 
 
 
380 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  24.86 
 
 
383 aa  81.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  23.77 
 
 
380 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2810  extracellular ligand-binding receptor  22.7 
 
 
377 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.079562  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6474  extracellular ligand-binding receptor  24.59 
 
 
390 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0864936 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  23.77 
 
 
391 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  23.77 
 
 
391 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  21.37 
 
 
373 aa  80.1  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  24.17 
 
 
394 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  23.77 
 
 
380 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5695  Extracellular ligand-binding receptor  24.01 
 
 
373 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.348726 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  21.47 
 
 
402 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  23.77 
 
 
381 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.38 
 
 
380 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.38 
 
 
380 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1670  TPR repeat-containing protein  22.76 
 
 
412 aa  77.4  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00502897  hitchhiker  0.00000000193878 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3401  extracellular ligand-binding receptor  22.16 
 
 
379 aa  77.4  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.388266 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.38 
 
 
380 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.38 
 
 
376 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  24.04 
 
 
381 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3145  Extracellular ligand-binding receptor  23.29 
 
 
399 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00633656  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  24.38 
 
 
380 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.38 
 
 
380 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.77 
 
 
402 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.38 
 
 
380 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0821  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.04 
 
 
399 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  23.42 
 
 
382 aa  76.6  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  22.71 
 
 
399 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  23.5 
 
 
380 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  23.74 
 
 
384 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1045  extracellular ligand-binding receptor  22.69 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0341  extracellular ligand-binding receptor  24.48 
 
 
389 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4646  extracellular ligand-binding receptor  25.21 
 
 
384 aa  74.7  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.84 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.116287 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  23.74 
 
 
384 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.1 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.22 
 
 
380 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  23.18 
 
 
384 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4471  extracellular ligand-binding receptor  24.18 
 
 
373 aa  73.6  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  23.18 
 
 
384 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1661  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.95 
 
 
373 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00010868  normal  0.0729717 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  21.89 
 
 
371 aa  73.2  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2424  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  22.12 
 
 
383 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.806831  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5783  extracellular ligand-binding receptor  23.4 
 
 
384 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6148  extracellular ligand-binding receptor  23.4 
 
 
384 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3208  Extracellular ligand-binding receptor  25.6 
 
 
376 aa  72  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0660  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.86 
 
 
380 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.792803  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1290  branched chain amino acid ABC transporter permease  24.71 
 
 
392 aa  72  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.169952  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1178  outative extracellular ligand binding protein  24.86 
 
 
380 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2389  outative extracellular ligand binding protein  24.86 
 
 
372 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7692  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.46 
 
 
384 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1769  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.86 
 
 
380 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0853  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  21.55 
 
 
381 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18061  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.25 
 
 
378 aa  72  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1102  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.86 
 
 
380 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391264  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3654  extracellular ligand-binding receptor  21.82 
 
 
399 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  24.19 
 
 
386 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1439  Extracellular ligand-binding receptor  21.82 
 
 
383 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0805  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.86 
 
 
380 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  24.05 
 
 
404 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4242  extracellular ligand-binding receptor  22.95 
 
 
373 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000000756343  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  24.19 
 
 
386 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  24.34 
 
 
404 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3768  extracellular ligand-binding receptor  22.95 
 
 
373 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000000114958  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1534  Extracellular ligand-binding receptor  21.52 
 
 
383 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4261  extracellular ligand-binding receptor  22.68 
 
 
373 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  22.46 
 
 
396 aa  70.5  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1830  Extracellular ligand-binding receptor  21.69 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000559355  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6110  extracellular ligand-binding receptor  22.53 
 
 
369 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  24.34 
 
 
402 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  23.37 
 
 
400 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  24.34 
 
 
404 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  23.08 
 
 
401 aa  68.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2101  Extracellular ligand-binding receptor  22.96 
 
 
380 aa  68.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4008  extracellular ligand-binding receptor  22.4 
 
 
373 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.746913  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4359  extracellular ligand-binding receptor  22.4 
 
 
373 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1675  Extracellular ligand-binding receptor  22.33 
 
 
387 aa  67  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0898959 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5105  extracellular ligand-binding receptor  23.29 
 
 
381 aa  67  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140418  decreased coverage  0.00222912 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  21.89 
 
 
395 aa  67  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5995  extracellular ligand-binding receptor  22.4 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.814001  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4923  extracellular ligand-binding receptor  24.03 
 
 
378 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000164326 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  25.28 
 
 
381 aa  65.1  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4867  extracellular ligand-binding receptor  24.31 
 
 
378 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0924005  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2686  putative ABC transporter substrate binding protein  25 
 
 
390 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4659  extracellular ligand-binding receptor  23.77 
 
 
378 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00580673 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2330  Extracellular ligand-binding receptor  21.02 
 
 
386 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4745  extracellular ligand-binding receptor  24.31 
 
 
378 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000119526 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0991  extracellular ligand-binding receptor  24.76 
 
 
380 aa  65.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0611  Extracellular ligand-binding receptor  22.89 
 
 
371 aa  65.1  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  21.73 
 
 
401 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2491  extracellular ligand-binding receptor  23.74 
 
 
373 aa  64.7  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946067  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  24.01 
 
 
397 aa  64.7  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4914  extracellular ligand-binding receptor  22.22 
 
 
375 aa  64.3  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.113346  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0645  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
386 aa  64.3  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>