260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3421 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1369  4-alpha-glucanotransferase  55.59 
 
 
708 aa  686    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.613124  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11812  4-alpha-glucanotransferase malQ  67.73 
 
 
724 aa  939    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.268573 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24590  4-alpha-glucanotransferase  51.42 
 
 
718 aa  668    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.686427  normal  0.585333 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1101  4-alpha-glucanotransferase  51.12 
 
 
717 aa  655    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00817417  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3421  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 
708 aa  1414    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128647  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2869  4-alpha-glucanotransferase  72.55 
 
 
719 aa  974    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0478  4-alpha-glucanotransferase  51.2 
 
 
730 aa  667    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2899  4-alpha-glucanotransferase  72.55 
 
 
719 aa  974    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2153  4-alpha-glucanotransferase  53.18 
 
 
717 aa  676    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362113  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4887  4-alpha-glucanotransferase  56.47 
 
 
724 aa  769    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3529  4-alpha-glucanotransferase  54.04 
 
 
712 aa  669    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00842103  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2913  4-alpha-glucanotransferase  72.55 
 
 
719 aa  974    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3175  4-alpha-glucanotransferase  82.18 
 
 
730 aa  1160    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.682952  normal  0.0349305 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2633  4-alpha-glucanotransferase  51.68 
 
 
733 aa  654    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.272173 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13220  4-alpha-glucanotransferase  51.54 
 
 
717 aa  634  1e-180  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.133916  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2205  glycoside hydrolase family protein  48.79 
 
 
702 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3414  4-alpha-glucanotransferase  48.21 
 
 
677 aa  607  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.723218  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1347  4-alpha-glucanotransferase  50.5 
 
 
717 aa  601  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451927  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3533  4-alpha-glucanotransferase  50 
 
 
721 aa  595  1e-169  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1299  4-alpha-glucanotransferase  41.45 
 
 
749 aa  513  1e-144  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1692  4-alpha-glucanotransferase  40.95 
 
 
721 aa  513  1e-144  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5309  4-alpha-glucanotransferase  45.6 
 
 
780 aa  506  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.242878 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1321  4-alpha-glucanotransferase  41.18 
 
 
745 aa  506  9.999999999999999e-143  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0251  4-alpha-glucanotransferase  40.22 
 
 
721 aa  498  1e-139  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0996  4-alpha-glucanotransferase  44.76 
 
 
660 aa  495  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1601  4-alpha-glucanotransferase  47.8 
 
 
766 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154546  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11750  4-alpha-glucanotransferase  43.56 
 
 
1169 aa  488  1e-136  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1157  4-alpha-glucanotransferase  45.02 
 
 
757 aa  476  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.337105  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5116  4-alpha-glucanotransferase  43.9 
 
 
692 aa  458  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.796514  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3093  4-alpha-glucanotransferase  44.91 
 
 
610 aa  396  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601313  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.31 
 
 
1715 aa  361  2e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.79 
 
 
1730 aa  352  2e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0233  4-alpha-glucanotransferase  36.18 
 
 
717 aa  347  6e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  33.69 
 
 
1464 aa  345  2e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.33 
 
 
1703 aa  341  2e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36 
 
 
1673 aa  340  5e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0315  4-alpha-glucanotransferase  36.52 
 
 
707 aa  336  7e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  37 
 
 
1642 aa  330  4e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01251  4-alpha-glucanotransferase  31.36 
 
 
732 aa  326  8.000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1607  4-alpha-glucanotransferase  35.69 
 
 
728 aa  324  3e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0118  4-alpha-glucanotransferase  32.27 
 
 
726 aa  323  6e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3927  4-alpha-glucanotransferase  34.73 
 
 
694 aa  323  9.000000000000001e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6826  4-alpha-glucanotransferase  33.64 
 
 
736 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512583  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04850  4-alpha-glucanotransferase  32.59 
 
 
726 aa  320  6e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0039  4-alpha-glucanotransferase  31.56 
 
 
726 aa  319  1e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2994  glycoside hydrolase family protein  33.1 
 
 
692 aa  316  9e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10076  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001104  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  32.03 
 
 
726 aa  316  9e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3127  4-alpha-glucanotransferase  33.01 
 
 
692 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4120  4-alpha-glucanotransferase  34.4 
 
 
694 aa  313  4.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3992  4-alpha-glucanotransferase  32.76 
 
 
698 aa  313  6.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0162  4-alpha-glucanotransferase  32.76 
 
 
698 aa  313  9e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2547  4-alpha-glucanotransferase  32.34 
 
 
692 aa  312  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1635  4-alpha-glucanotransferase  31.11 
 
 
731 aa  311  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2365  4-alpha-glucanotransferase  29.71 
 
 
732 aa  311  2e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.84762  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2866  glycoside hydrolase family protein  33.51 
 
 
736 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.988435 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3751  4-alpha-glucanotransferase  32.62 
 
 
698 aa  311  2.9999999999999997e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3715  4-alpha-glucanotransferase  34.95 
 
 
692 aa  311  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.2 
 
 
1647 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3883  4-alpha-glucanotransferase  34.89 
 
 
692 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3821  4-alpha-glucanotransferase  34.89 
 
 
692 aa  309  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3787  4-alpha-glucanotransferase  34.72 
 
 
692 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.28 
 
 
1662 aa  309  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3712  4-alpha-glucanotransferase  34.78 
 
 
692 aa  308  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3797  4-alpha-glucanotransferase  32.24 
 
 
694 aa  307  5.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2938  4-alpha-glucanotransferase  35.04 
 
 
664 aa  307  5.0000000000000004e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4388  4-alpha-glucanotransferase  33.24 
 
 
726 aa  307  6e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3829  4-alpha-glucanotransferase  34.14 
 
 
695 aa  305  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2674  4-alpha-glucanotransferase  36.05 
 
 
607 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1780  4-alpha-glucanotransferase  36.91 
 
 
605 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.900692  normal  0.822688 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3892  4-alpha-glucanotransferase  32.04 
 
 
694 aa  305  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0297  4-alpha-glucanotransferase  32.04 
 
 
694 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128437  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0297  4-alpha-glucanotransferase  32.04 
 
 
694 aa  303  7.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000311021  normal  0.0613825 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3614  4-alpha-glucanotransferase  32.04 
 
 
694 aa  303  7.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3697  4-alpha-glucanotransferase  31.98 
 
 
694 aa  302  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.451758 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3143  4-alpha-glucanotransferase  35.16 
 
 
682 aa  302  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113205  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1822  4-alpha-glucanotransferase  33.67 
 
 
689 aa  302  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.231101 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03268  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  31.9 
 
 
694 aa  300  4e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000118056  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03220  hypothetical protein  31.9 
 
 
694 aa  300  4e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4723  4-alpha-glucanotransferase  31.9 
 
 
694 aa  299  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0890  4-alpha-glucanotransferase  31.54 
 
 
699 aa  298  2e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.763251  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3677  4-alpha-glucanotransferase  36.8 
 
 
656 aa  297  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1467  4-alpha-glucanotransferase  35.88 
 
 
646 aa  297  5e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36590  putative 4-alpha-glucanotransferase  35.59 
 
 
684 aa  296  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.393735  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4231  glycoside hydrolase family protein  34.17 
 
 
733 aa  295  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24890  4-alpha-glucanotransferase  34.79 
 
 
691 aa  291  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829974  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.11 
 
 
1646 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.03 
 
 
1650 aa  290  8e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1210  glycoside hydrolase family protein  33.57 
 
 
663 aa  288  2e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495864  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.96 
 
 
1646 aa  288  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4635  4-alpha-glucanotransferase  32.77 
 
 
696 aa  288  2.9999999999999996e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1791  4-alpha-glucanotransferase  33.52 
 
 
689 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.816513  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1114  4-alpha-glucanotransferase  35.61 
 
 
605 aa  287  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.587609 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6321  putative 4-alpha-glucanotransferase  34.75 
 
 
650 aa  287  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4052  4-alpha-glucanotransferase  33.24 
 
 
689 aa  287  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3651  4-alpha-glucanotransferase  32.54 
 
 
689 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.215305 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2451  putative 4-alpha-glucanotransferase  35.92 
 
 
605 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2279  4-alpha-glucanotransferase  33.67 
 
 
684 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0480824  normal  0.0112086 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4047  4-alpha-glucanotransferase  32.58 
 
 
760 aa  284  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3934  4-alpha-glucanotransferase  32.58 
 
 
760 aa  284  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5113  4-alpha-glucanotransferase  33.22 
 
 
619 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0943987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>