More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0063 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0063  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
121 aa  244  3e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0100  nitrogen regulatory protein P-II  74.38 
 
 
121 aa  194  3e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.250689  normal  0.0316533 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0660  nitrogen regulatory protein P-II  72.73 
 
 
121 aa  193  7e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187673  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1801  nitrogen regulatory protein P-II  70.25 
 
 
121 aa  185  2e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0145  nitrogen regulatory protein P-II  57.85 
 
 
120 aa  149  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.550451  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1554  nitrogen regulatory protein P-II  53.6 
 
 
125 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2279  P-II family nitrogen regulatory protein  51.64 
 
 
123 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000418064  normal  0.159182 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0550  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  55.56 
 
 
114 aa  121  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0094622  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1432  nitrogen regulatory protein P-II  47.62 
 
 
128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0169  nitrogen regulatory protein P-II  44.63 
 
 
125 aa  107  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00936567  normal  0.629139 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1048  nitrogen regulatory protein P-II  47.24 
 
 
127 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3092  nitrogen regulatory protein P-II  44.44 
 
 
131 aa  99  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2819  nitrogen regulatory protein P-II  46.46 
 
 
126 aa  97.1  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.587201  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1025  nitrogen regulatory protein P-II  40.48 
 
 
126 aa  94.4  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1246  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  44.44 
 
 
125 aa  94  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000500613  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1156  nitrogen regulatory protein P-II  44.72 
 
 
130 aa  94  7e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0742  nitrogen regulatory protein P-II  45.97 
 
 
125 aa  92  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1951  nitrogen regulatory protein P-II  43.41 
 
 
125 aa  88.6  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0122455  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0953  nitrogen regulatory protein P-II  39.02 
 
 
112 aa  87.4  6e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0683  nitrogen regulatory protein P-II  41.94 
 
 
125 aa  86.7  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2615  nitrogen regulatory protein P-II  43.65 
 
 
124 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  39.02 
 
 
112 aa  85.5  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1530  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  41.86 
 
 
125 aa  85.9  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.858615  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1629  nitrogen regulatory protein P-II  41.86 
 
 
125 aa  85.1  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000227966  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  38.98 
 
 
112 aa  84.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0556  nitrogen regulatory protein P-II  42.98 
 
 
112 aa  84.3  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  38.21 
 
 
112 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0836  nitrogen regulatory protein P-II  42.4 
 
 
124 aa  84  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  41.6 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2477  nitrogen regulatory protein P-II  39.67 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.698113  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1081  nitrogen regulatory protein P-II  38.84 
 
 
113 aa  80.9  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  43.44 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  40.8 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  40.8 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  38.02 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  40.8 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  40.8 
 
 
112 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  37.19 
 
 
113 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  40.8 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  40.8 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1753  nitrogen regulatory protein P-II  41.22 
 
 
125 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.424498  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0550  nitrogen regulatory protein P-II  37.19 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0064  nitrogen regulatory protein P-II  42.37 
 
 
105 aa  79  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  40.8 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  42.15 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  40 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  40.98 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3267  nitrogen regulatory protein P-II  40.16 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1466  nitrogen regulatory protein P-II  35.48 
 
 
113 aa  78.2  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 
117 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 
117 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0559  nitrogen regulatory protein P-II  37.68 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000146576  normal  0.195853 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2861  nitrogen regulatory protein P-II  38.52 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.715878  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1017  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 
126 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301084  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  39.2 
 
 
112 aa  77  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0104  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 
112 aa  76.6  0.00000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 
136 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  38.4 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  37.7 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  37.7 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0884  nitrogen regulatory protein P-II  39.67 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.275382  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  37.19 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  39.2 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0144  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 
105 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.419714  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1611  nitrogen regulatory protein P-II  38.84 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0141  nitrogen regulatory protein P-II  36.36 
 
 
111 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457658  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2209  nitrogen regulatory protein P-II  37.39 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.448638  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2735  nitrogen regulatory protein P-II  37.93 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0436  nitrogen regulatory protein P-II  31.03 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.447184  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  40.16 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1499  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  34.71 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  37.6 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  37.6 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  38.84 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  37.6 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4445  nitrogen regulatory protein P-II, GlnB, GlnK  34.71 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  37.7 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000317831  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  40.98 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  41.6 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2899  nitrogen regulatory protein P-II  38.4 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0172484 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  39.2 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  40.8 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0170  nitrogen regulatory protein P-II  39.83 
 
 
105 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.01556  normal  0.599524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3176  nitrogen regulatory protein P-II  38.02 
 
 
115 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00223348 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2274  nitrogen regulatory protein P-II  37.19 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.468205  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0137  nitrogen regulatory protein P-II  36.36 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000150493  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  38.4 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  40.16 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2863  nitrogen regulatory protein P-II  34.71 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00920081  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  40.16 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  37.7 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0865  nitrogen regulatory protein P-II  36.89 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.445753 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0532  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 
113 aa  74.7  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000140309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>