More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1934 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1934  CoA-binding  100 
 
 
684 aa  1392    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.569355  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  32.01 
 
 
718 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  27.94 
 
 
712 aa  263  6e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  27.46 
 
 
921 aa  253  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  28.89 
 
 
699 aa  248  3e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  28.61 
 
 
669 aa  246  8e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  27.88 
 
 
929 aa  244  5e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  27.83 
 
 
708 aa  244  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  27.11 
 
 
697 aa  242  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  28.21 
 
 
698 aa  241  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  28.23 
 
 
911 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  27.04 
 
 
711 aa  239  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  26.31 
 
 
696 aa  236  7e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  26.33 
 
 
707 aa  236  8e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  27.94 
 
 
710 aa  236  9e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  26.35 
 
 
892 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  27.08 
 
 
920 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3477  CoA-binding domain-containing protein  29.89 
 
 
707 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.025154  normal  0.742177 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  26.85 
 
 
699 aa  233  1e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  27 
 
 
698 aa  232  2e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  27 
 
 
701 aa  231  4e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  26.26 
 
 
696 aa  230  6e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  25.87 
 
 
912 aa  229  9e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  26.47 
 
 
711 aa  229  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  26.69 
 
 
706 aa  229  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  28.41 
 
 
715 aa  227  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  27.14 
 
 
892 aa  226  8e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  27.73 
 
 
895 aa  226  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0674  CoA-binding protein  28.95 
 
 
705 aa  225  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  26.05 
 
 
905 aa  224  4.9999999999999996e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  27.52 
 
 
700 aa  224  4.9999999999999996e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  26.54 
 
 
698 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  29.36 
 
 
715 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  25.71 
 
 
915 aa  221  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  25.74 
 
 
918 aa  221  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  26.77 
 
 
741 aa  220  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  26.91 
 
 
697 aa  220  7e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1377  CoA-binding domain-containing protein  29.32 
 
 
705 aa  220  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.249497  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  27.1 
 
 
704 aa  218  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  28.01 
 
 
692 aa  219  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1473  putative pimeloyl-CoA synthetase  29.11 
 
 
716 aa  219  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.21292  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  25.56 
 
 
897 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  26.19 
 
 
728 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  26.47 
 
 
883 aa  216  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  26.69 
 
 
703 aa  213  7.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1637  CoA-binding domain protein  26.9 
 
 
709 aa  213  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2759  CoA-binding domain-containing protein  26.93 
 
 
729 aa  212  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1328  CoA ligase family protein  26.76 
 
 
685 aa  210  7e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  26.32 
 
 
911 aa  210  7e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  28.31 
 
 
712 aa  209  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  27.05 
 
 
710 aa  209  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3477  CoA-binding domain protein  27.23 
 
 
699 aa  209  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  26.04 
 
 
900 aa  209  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  26.25 
 
 
889 aa  207  4e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  28.49 
 
 
698 aa  207  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  25.14 
 
 
698 aa  205  2e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  25.6 
 
 
702 aa  205  3e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  25.67 
 
 
702 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3702  CoA-binding  27.41 
 
 
725 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0568  putative CoA ligase  27.07 
 
 
708 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000830442  normal  0.832734 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  26.74 
 
 
695 aa  201  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  25.84 
 
 
711 aa  200  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3724  acyl-CoA synthetase, putative  25.38 
 
 
705 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.79525  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  26.04 
 
 
706 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  26.32 
 
 
893 aa  197  5.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5094  acyl-CoA synthetase domain-containing protein  27.34 
 
 
718 aa  197  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.504195 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  25.75 
 
 
903 aa  197  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4556  CoA-binding  26.26 
 
 
715 aa  196  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.732874  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0708  CoA-binding domain-containing protein  26.72 
 
 
682 aa  196  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  24.58 
 
 
893 aa  196  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3495  CoA-binding domain-containing protein  25.89 
 
 
711 aa  195  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244282 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2182  acyl-CoA synthetase, putative  26.12 
 
 
705 aa  194  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.769961  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  26.04 
 
 
711 aa  192  1e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0007  GCN5-related N-acetyltransferase  25.42 
 
 
890 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  25.34 
 
 
700 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  24.68 
 
 
750 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  27.49 
 
 
897 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  25.18 
 
 
699 aa  191  5.999999999999999e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3312  CoA-binding  27.03 
 
 
697 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292694  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  27.05 
 
 
703 aa  188  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  28.63 
 
 
703 aa  188  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  24.4 
 
 
714 aa  188  3e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2039  CoA-binding domain-containing protein  25.25 
 
 
705 aa  187  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  27.09 
 
 
926 aa  187  7e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2458  CoA-binding domain-containing protein  27.37 
 
 
893 aa  186  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366091  normal  0.773834 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  27 
 
 
700 aa  185  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4844  CoA-binding domain-containing protein  28.06 
 
 
693 aa  184  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0385105  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0505  CoA-binding domain protein  25.84 
 
 
887 aa  183  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  26.79 
 
 
704 aa  182  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4811  CoA-binding domain-containing protein  25.32 
 
 
693 aa  180  8e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441537  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1776  GCN5-related N-acetyltransferase  24.93 
 
 
898 aa  179  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.634734 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  25.63 
 
 
704 aa  179  1e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65810  hypothetical protein  26.12 
 
 
696 aa  178  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.410069  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1585  CoA-binding domain-containing protein  25.85 
 
 
697 aa  178  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.27477 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4045  GCN5-related N-acetyltransferase  24.93 
 
 
899 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565149  normal  0.994893 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  24.47 
 
 
697 aa  177  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3448  CoA-binding domain-containing protein  23.78 
 
 
898 aa  177  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401225  normal  0.714388 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1512  CoA-binding protein  26.62 
 
 
703 aa  176  9e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1535  CoA-binding domain-containing protein  26.62 
 
 
703 aa  176  9e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  26.52 
 
 
695 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>