106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1835 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1835  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
390 aa  738    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178489  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1626  major facilitator superfamily MFS_1  43.46 
 
 
395 aa  262  6.999999999999999e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0561  major facilitator transporter  35.08 
 
 
402 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2304  major facilitator transporter  34.06 
 
 
395 aa  124  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0644  major facilitator transporter  25.86 
 
 
397 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.535291  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1014  major facilitator transporter  23.68 
 
 
396 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1033  major facilitator transporter  23.68 
 
 
396 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.177021  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0605  hypothetical protein  23.8 
 
 
397 aa  73.6  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184061  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  27.11 
 
 
407 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  35.25 
 
 
415 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  35.51 
 
 
409 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  34.33 
 
 
408 aa  57  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  30.2 
 
 
387 aa  55.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  35.48 
 
 
434 aa  55.1  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37 
 
 
627 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  32.52 
 
 
411 aa  53.9  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  39.18 
 
 
411 aa  54.3  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37 
 
 
505 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.02 
 
 
540 aa  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.02 
 
 
534 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  32.65 
 
 
466 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  33.06 
 
 
467 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2806  major facilitator superfamily MFS_1  36.11 
 
 
434 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0845  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.87 
 
 
489 aa  48.9  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222515  normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13540  arabinose efflux permease family protein  31.21 
 
 
463 aa  49.7  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.76 
 
 
522 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33 
 
 
609 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.67 
 
 
478 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 
410 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34 
 
 
646 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34 
 
 
646 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34 
 
 
646 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.63 
 
 
514 aa  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  34.26 
 
 
418 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  37.11 
 
 
426 aa  47  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.63 
 
 
515 aa  47.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30030  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.18 
 
 
487 aa  47  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00171806  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  31.53 
 
 
419 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23950  arabinose efflux permease family protein  30.63 
 
 
456 aa  47.4  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.297919  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  31.53 
 
 
419 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4875  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.87 
 
 
579 aa  47  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 
399 aa  46.6  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32 
 
 
493 aa  46.6  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 
392 aa  46.6  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1272  protein of unknown function DUF894 DitE  30.51 
 
 
551 aa  46.2  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.951526 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0566  major facilitator transporter  28.26 
 
 
384 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000941679  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32 
 
 
509 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.96 
 
 
546 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4126  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 
397 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.641769 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  24.86 
 
 
492 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  30.4 
 
 
405 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  33.33 
 
 
468 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  22.31 
 
 
402 aa  45.1  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  33.33 
 
 
468 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1894  major facilitator transporter  29.08 
 
 
431 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  25.23 
 
 
388 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  25.23 
 
 
388 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4035  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 
398 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  23.76 
 
 
402 aa  45.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.9 
 
 
475 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  22.47 
 
 
406 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0291  major facilitator superfamily MFS_1  23.02 
 
 
415 aa  45.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2688  major facilitator family transporter  27.83 
 
 
412 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.278586  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6303  major facilitator transporter  28.79 
 
 
444 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2882  major facilitator family transporter  27.83 
 
 
412 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  29.79 
 
 
404 aa  44.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0387  major facilitator transporter  31.68 
 
 
467 aa  44.7  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.285838  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18291  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  28.46 
 
 
417 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 
417 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  30.43 
 
 
440 aa  44.3  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  25.73 
 
 
410 aa  44.3  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  32.26 
 
 
397 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  30.43 
 
 
384 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  30.43 
 
 
384 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 
411 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 
404 aa  44.3  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.87 
 
 
474 aa  44.3  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 
409 aa  44.3  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 
391 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.53 
 
 
489 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  32.26 
 
 
398 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0100  major facilitator transporter  32.08 
 
 
468 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2030  major facilitator transporter  29.03 
 
 
474 aa  43.9  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.275978  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.11 
 
 
504 aa  43.9  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  32.69 
 
 
376 aa  43.9  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8106  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 
502 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  32.8 
 
 
462 aa  43.9  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  27.43 
 
 
412 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  26.07 
 
 
395 aa  43.5  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  31.37 
 
 
405 aa  43.5  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  28.87 
 
 
412 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.43 
 
 
418 aa  43.5  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  25.84 
 
 
396 aa  43.1  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2933  major facilitator family transporter  28.87 
 
 
412 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000168922  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0005  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 
394 aa  43.1  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.32076  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  25.71 
 
 
387 aa  43.1  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  30.84 
 
 
428 aa  43.1  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3333  major facilitator transporter  24.79 
 
 
568 aa  43.1  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.901115  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  28.81 
 
 
406 aa  43.1  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0005  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 
394 aa  43.1  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.695547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>