86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1530 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2113  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  86.8 
 
 
474 aa  833    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1530  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  100 
 
 
463 aa  954    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1544  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  48.12 
 
 
448 aa  444  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000180144  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1005  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  44.24 
 
 
434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4695  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase related protein  38.94 
 
 
406 aa  253  6e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1853  hypothetical protein  39.67 
 
 
417 aa  239  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3159  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  39.71 
 
 
420 aa  235  1.0000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0736  hypothetical protein  34.74 
 
 
396 aa  233  4.0000000000000004e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0716  hypothetical protein  34.24 
 
 
396 aa  226  7e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1547  hypothetical protein  33.42 
 
 
384 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.26317  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1811  hypothetical protein  35.07 
 
 
399 aa  201  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369907  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5182  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  38.9 
 
 
423 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2676  hypothetical protein  33.85 
 
 
401 aa  196  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4716  hypothetical protein  34.48 
 
 
406 aa  193  6e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2308  hypothetical protein  32.35 
 
 
399 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14665  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0967  alpha/beta fold family hydrolase  31.68 
 
 
388 aa  182  1e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2193  hypothetical protein  28.78 
 
 
402 aa  166  9e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2165  hypothetical protein  29.03 
 
 
402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2957  hypothetical protein  31.85 
 
 
418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.85194  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1228  hypothetical protein  31.03 
 
 
403 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.395886  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2118  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  29.03 
 
 
383 aa  140  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3412  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  29.01 
 
 
381 aa  127  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0714  hypothetical protein  28.96 
 
 
385 aa  124  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3150  hypothetical protein  31.4 
 
 
386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0886  alpha/beta fold family hydrolase  26.85 
 
 
373 aa  119  9e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1933  hypothetical protein  29.4 
 
 
385 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3195  hypothetical protein  29.12 
 
 
420 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304739  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  27.44 
 
 
357 aa  117  5e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0478  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  26.78 
 
 
388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4831  hypothetical protein  28.15 
 
 
386 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.857401  normal  0.718277 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2344  alpha/beta fold family hydrolase  26.23 
 
 
374 aa  112  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.946949  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2389  hypothetical protein  27.9 
 
 
390 aa  113  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3425  hypothetical protein  29.39 
 
 
387 aa  107  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.4734  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5486  hypothetical protein  26.78 
 
 
390 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.416451  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0856  hypothetical protein  31.86 
 
 
386 aa  104  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4305  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  26.04 
 
 
413 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0350755  normal  0.767198 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0906  hypothetical protein  27.06 
 
 
385 aa  100  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60282  normal  0.197591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4700  hypothetical protein  32.41 
 
 
377 aa  100  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14251  normal  0.0502097 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5609  hypothetical protein  30.29 
 
 
400 aa  97.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675144  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5973  hypothetical protein  30.29 
 
 
400 aa  97.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0578676  hitchhiker  0.00100227 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4476  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  30.59 
 
 
376 aa  93.2  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1275  alpha/beta fold family hydrolase  24.72 
 
 
378 aa  90.5  6e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  30.54 
 
 
402 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0219  hypothetical protein  27.11 
 
 
400 aa  84.7  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.431687  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  24.62 
 
 
406 aa  82  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.351879  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0613  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  29.72 
 
 
383 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5460  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  22.36 
 
 
424 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.528765  normal  0.198358 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09171  conidial pigment biosynthesis protein Ayg1 (AFU_orthologue; AFUA_2G17550)  29.59 
 
 
300 aa  69.3  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2955  fermentation/respiration switch protein  26.96 
 
 
419 aa  63.9  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.283852  normal  0.148271 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
295 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
295 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0541  hypothetical protein  23.11 
 
 
372 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  26.96 
 
 
295 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4575  hypothetical protein  33 
 
 
326 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.116237 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  26.02 
 
 
286 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  37.04 
 
 
318 aa  53.5  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  26.02 
 
 
286 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 
296 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3940  hypothetical protein  27.27 
 
 
418 aa  53.1  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000344769  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3671  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 
314 aa  52.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.416177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  26.12 
 
 
308 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6158  peptidase S15  25.75 
 
 
295 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5227  hypothetical protein  24.75 
 
 
315 aa  50.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.335555 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  28.19 
 
 
298 aa  50.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  30.34 
 
 
876 aa  50.1  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 
297 aa  49.7  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1247  hypothetical protein  28.95 
 
 
546 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000443968 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0501  hypothetical protein  26.45 
 
 
436 aa  48.5  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3483  hypothetical protein  30.63 
 
 
373 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0462629  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1866  fermentation/respiration switch protein  23.55 
 
 
415 aa  47.8  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000738572  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3351  putative membrane protein of unknown function  27.78 
 
 
491 aa  47.8  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.881704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4281  hydrolase family protein  25.57 
 
 
332 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.549804  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0764  membrane protein  29.55 
 
 
330 aa  47  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000138363 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2726  hypothetical protein  32.76 
 
 
510 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  30.23 
 
 
309 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0323  alpha/beta hydrolase  23.38 
 
 
316 aa  45.8  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.323866  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  31.71 
 
 
317 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3774  hypothetical protein  30.97 
 
 
533 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113955  normal  0.0693003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  27.96 
 
 
326 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2753  hypothetical protein  29.92 
 
 
293 aa  44.3  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.999004  normal  0.272807 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  29.92 
 
 
292 aa  43.9  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4482  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like  31.54 
 
 
358 aa  43.9  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1006  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  26.9 
 
 
438 aa  43.9  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.342716 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2932  hypothetical protein  32.23 
 
 
399 aa  43.5  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  23.67 
 
 
298 aa  43.1  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2005  hypothetical protein  32.63 
 
 
259 aa  43.1  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.878418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>