82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3876 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3876  protein of unknown function DUF159  100 
 
 		 217 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3586  hypothetical protein  97.7 
 
 		 217 aa  436  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0544  protein of unknown function DUF159  83.8 
 
 		 215 aa  375  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3635  hypothetical protein  57.5 
 
 		 241 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3740  hypothetical protein  61.29 
 
 		 222 aa  267  7e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3432  hypothetical protein  58.26 
 
 		 244 aa  265  5.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0238  hypothetical protein  62.2 
 
 		 210 aa  263  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3320  hypothetical protein  56.43 
 
 		 244 aa  252  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.541454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3995  hypothetical protein  59.73 
 
 		 226 aa  250  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0010  hypothetical protein  59.39 
 
 		 230 aa  248  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3808  protein of unknown function DUF159  55 
 
 		 246 aa  245  4e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1134  protein of unknown function DUF159  54.58 
 
 		 241 aa  244  8e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6423  protein of unknown function DUF159  57.27 
 
 		 215 aa  223  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5645  protein of unknown function DUF159  55.91 
 
 		 215 aa  214  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4176  protein of unknown function DUF159  55.41 
 
 		 219 aa  210  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.829162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0573  hypothetical protein  55 
 
 		 214 aa  207  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3296  hypothetical protein  54.46 
 
 		 244 aa  205  4e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.543717  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3882  hypothetical protein  54.71 
 
 		 222 aa  202  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0171442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3340  hypothetical protein  51.61 
 
 		 220 aa  201  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0811  hypothetical protein  47.25 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.782351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3144  hypothetical protein  44.58 
 
 		 256 aa  179  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5204  hypothetical protein  43.37 
 
 		 257 aa  167  9e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7622  protein of unknown function DUF159  57.53 
 
 		 232 aa  148  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4793  hypothetical protein  50.6 
 
 		 208 aa  147  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3283  hypothetical protein  41.78 
 
 		 208 aa  131  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.232935  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1849  hypothetical protein  39.83 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4144  hypothetical protein  39.64 
 
 		 223 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352175  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3770  hypothetical protein  42.86 
 
 		 151 aa  96.3  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0018  hypothetical protein  66.15 
 
 		 74 aa  90.1  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.185366 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2524  hypothetical protein  31.82 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4810  hypothetical protein  67.86 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3492  hypothetical protein  64.81 
 
 		 177 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.205751 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  30.92 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0838  hypothetical protein  60.42 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  28.64 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  28.7 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  29.73 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  28.71 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3953  hypothetical protein  30.24 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  28.84 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  28.64 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  27.37 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  29.47 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2756  hypothetical protein  29.26 
 
 		 346 aa  55.1  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  29.23 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  29.51 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  26.57 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  27.4 
 
 		 254 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  30.57 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  28.73 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  29.3 
 
 		 241 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  26.7 
 
 		 221 aa  48.1  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0318  protein of unknown function DUF159  27.78 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.527161  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  29.47 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  28.18 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2013  protein of unknown function DUF159  22.8 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  24.89 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  28.24 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  27.17 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  26.54 
 
 		 254 aa  45.8  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3924  hypothetical protein  25.6 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405964  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4873  hypothetical protein  34.07 
 
 		 237 aa  45.1  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  25.76 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  25.79 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5154  protein of unknown function DUF159  34.19 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.616671 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  27.96 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3713  hypothetical protein  29.82 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  26.32 
 
 		 254 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0851  protein of unknown function DUF159  28.85 
 
 		 221 aa  43.1  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00651427  normal  0.246274 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  29.59 
 
 		 240 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4099  hypothetical protein  23.7 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1998  hypothetical protein  47.37 
 
 		 77 aa  43.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1375  hypothetical protein  27.22 
 
 		 317 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.246417  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  28.42 
 
 		 221 aa  42.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  30.22 
 
 		 254 aa  42.4  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16700  hypothetical protein  25.82 
 
 		 237 aa  42.4  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3104  hypothetical protein  25.25 
 
 		 236 aa  42  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  27.27 
 
 		 243 aa  42  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  27.72 
 
 		 226 aa  41.6  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  27.83 
 
 		 257 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1467  hypothetical protein  26.34 
 
 		 251 aa  41.6  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>