More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1095 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1095  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 172 aa  333  7.999999999999999e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.120995  normal  0.912563 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4118  peptidase A8 signal peptidase II  84.94 
 
 		 170 aa  191  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  39.22 
 
 		 174 aa  87.8  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0288  lipoprotein signal peptidase  38.71 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4414  signal peptidase II  42.99 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849735  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  35.33 
 
 		 160 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4860  lipoprotein signal peptidase  36.67 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.777227  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4037  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3163  lipoprotein signal peptidase  40.65 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1007  lipoprotein signal peptidase  35.67 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4181  lipoprotein signal peptidase  36 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4439  signal peptidase II  32.43 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2543  lipoprotein signal peptidase  38.4 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2206  lipoprotein signal peptidase  40.28 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.759642  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0149  lipoprotein signal peptidase  35.81 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0144  lipoprotein signal peptidase  35.81 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  31.13 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0632  lipoprotein signal peptidase  34.88 
 
 		 177 aa  73.9  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.263263  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  31.13 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2281  lipoprotein signal peptidase  39.64 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2219  lipoprotein signal peptidase  41.28 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  32.92 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3678  lipoprotein signal peptidase  36.08 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2861  lipoprotein signal peptidase  38.79 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0978018 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  42.48 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2326  lipoprotein signal peptidase  39.64 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.6435 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  28.4 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  34.75 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0161  lipoprotein signal peptidase  35.81 
 
 		 160 aa  70.5  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2603  lipoprotein signal peptidase  38.74 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1799  lipoprotein signal peptidase  38.76 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.408205  normal  0.0603455 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  34.51 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  32.74 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  33.09 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4477  lipoprotein signal peptidase  39.02 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4308  lipoprotein signal peptidase  39.02 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.114922  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4208  lipoprotein signal peptidase  39.02 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0480  lipoprotein signal peptidase  35.86 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2611  lipoprotein signal peptidase  44.04 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  35.66 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  33.88 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0392  lipoprotein signal peptidase  37.39 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.034269  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2334  lipoprotein signal peptidase  39.6 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000924043  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  35.06 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  34.19 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  33.58 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  34.19 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3258  signal peptidase II  39.19 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.802617  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  32.89 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3857  lipoprotein signal peptidase  40.94 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0363332  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2206  lipoprotein signal peptidase  38.71 
 
 		 177 aa  63.9  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.252335  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  35.46 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0359  lipoprotein signal peptidase  36.17 
 
 		 158 aa  63.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2655  lipoprotein signal peptidase  44.1 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251762  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  31.3 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  32.47 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6224  lipoprotein signal peptidase  34.59 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2356  lipoprotein signal peptidase  38.24 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0383384 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0026  lipoprotein signal peptidase  31.25 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138167 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25760  lipoprotein signal peptidase  37.04 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 166 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  29.37 
 
 		 158 aa  62  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  38.24 
 
 		 364 aa  62  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  35.25 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  35.09 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  35.09 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  31.82 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  31.62 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  35.25 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4429  lipoprotein signal peptidase  39.13 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438146  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  31.11 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  34.04 
 
 		 358 aa  60.8  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3952  lipoprotein signal peptidase  41.12 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.386002  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3614  lipoprotein signal peptidase  41.12 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.463393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  32.84 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  34.43 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  36.94 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  35.21 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  34.07 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  33.1 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  32.32 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  32.32 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  32.32 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0037  lipoprotein signal peptidase  31.41 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.251395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>